| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-13页 |
| 第1章 绪论 | 第13-25页 |
| ·第一节 细菌视紫红质 | 第13-17页 |
| ·研究背景 | 第13-14页 |
| ·BR质子转运机理及应用 | 第14-15页 |
| ·BR表达系统 | 第15-17页 |
| ·第二节 嗜盐古菌耐辐射机理研究 | 第17-19页 |
| ·研究背景 | 第17-18页 |
| ·d(CTAG)甲基化指导的错配修复机制 | 第18-19页 |
| ·第三节 基因组进化中的移码突变 | 第19-24页 |
| ·研究背景 | 第19-20页 |
| ·新基因起源机制 | 第20-23页 |
| ·移码突变 | 第23-24页 |
| ·本章小结 | 第24-25页 |
| 第2章 Halobiforma lacisalsi bop基因克隆和表达 | 第25-44页 |
| ·引言 | 第25-26页 |
| ·实验材料 | 第26-27页 |
| ·主要仪器 | 第26页 |
| ·菌株、质粒与培养条件 | 第26-27页 |
| ·AJ5 bop基因克隆 | 第27-35页 |
| ·嗜盐古菌基因组DNA的抽提 | 第27-28页 |
| ·bop基因保守序列的获取 | 第28-30页 |
| ·CaCl2法制备大肠杆菌JM109感受态细胞 | 第30页 |
| ·大肠杆菌的转化 | 第30-31页 |
| ·质粒DNA的小量制备 | 第31-32页 |
| ·PCR扩增保守序列5'未知区域 | 第32-34页 |
| ·PCR扩增保守序列3'未知区域 | 第34页 |
| ·拼接DNA片段以及PCR扩增全长 | 第34-35页 |
| ·序列分析 | 第35页 |
| ·AJ5 bop基因在大肠杆菌中的表达 | 第35-37页 |
| ·重组表达质粒构建 | 第35-36页 |
| ·紫膜粗提物吸收光谱测定 | 第36-37页 |
| ·实验结果 | 第37-42页 |
| ·AJ5 bop基因全长扩增 | 第37-38页 |
| ·bop基因序列分析 | 第38-40页 |
| ·bop基因在大肠杆菌中表达以及BR膜吸收光谱 | 第40-42页 |
| ·讨论 | 第42-43页 |
| ·本章小结 | 第43-44页 |
| 第3章 嗜盐菌科基因组和蛋白质组耐辐射结构分析 | 第44-57页 |
| ·引言 | 第44-45页 |
| ·材料与方法 | 第45-47页 |
| ·基因组序列 | 第45页 |
| ·双嘧啶组成 | 第45-47页 |
| ·氨基酸组成分析 | 第47页 |
| ·CTAG分布 | 第47页 |
| ·结果 | 第47-54页 |
| ·双嘧啶组成 | 第47-50页 |
| ·氨基酸组成分析 | 第50-52页 |
| ·CTAG分布 | 第52-54页 |
| ·讨论 | 第54-55页 |
| ·本章小结 | 第55-57页 |
| 第4章 大肠杆菌基因组中的移码突变事件 | 第57-80页 |
| ·引言 | 第57-58页 |
| ·材料与方法 | 第58-65页 |
| ·基因组序列 | 第58页 |
| ·比对过程 | 第58-61页 |
| ·基因融合/断裂事件筛选 | 第61-65页 |
| ·结果 | 第65-76页 |
| ·毒素-抗毒素基因对中的移码突变 | 第66-70页 |
| ·移码突变Case 2 | 第70-72页 |
| ·移码突变Case 3 | 第72页 |
| ·移码突变Case 5 | 第72-74页 |
| ·移码突变Case 6 | 第74页 |
| ·移码突变Case 7 | 第74-75页 |
| ·算法灵活性 | 第75-76页 |
| ·讨论 | 第76-79页 |
| ·本章小结 | 第79-80页 |
| 第5章 结论 | 第80-82页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文(含待发表) | 第82-83页 |
| 致谢 | 第83-84页 |
| 参考文献 | 第84-91页 |