Abstract | 第5-6页 |
Abbreviations | 第7-11页 |
Chapter one: Literature review | 第11-47页 |
1. Introduction | 第12-47页 |
1.1. Ubiquitination | 第12-15页 |
1.2. MEX-3 is a novel family RNA-binding proteins | 第15-19页 |
1.3. Human MEX-3C protein | 第19-25页 |
1.4. The KH domain | 第25-28页 |
1.5. Ring finger domain | 第28-32页 |
1.6. Ring type E3 ligases | 第32-34页 |
1.7. The function of the Ring finger domain | 第34-37页 |
1.8. The Ring finger domain activates the E2-Ub conjugates | 第37-40页 |
1.9. Dimerization of Ring finger domain | 第40-43页 |
1.10. MEX-3C in human diseases | 第43-47页 |
Chapter Two: Structural and functional insights into the Ring finger domain of hMEX-3C | 第47-91页 |
2.1. Introduction | 第48-49页 |
2.2. Materials and methods | 第49-75页 |
2.2.1. The Ring finger domain of human MEX-3C protein cloning construction | 第49-58页 |
2.2.1.1. Molecular cloning and site-directed mutagenesis | 第49-51页 |
2.2.1.2. Purpose restriction of DNA fragments | 第51-52页 |
2.2.1.3. Preparation of the carrier | 第52-53页 |
2.2.1.4. The destination segment is connected to the carrier | 第53-54页 |
2.2.1.5. The transformation of recombinant plasmid | 第54-55页 |
2.2.1.6. The preparation of the component cells | 第55-56页 |
2.2.1.7. Mutant construction | 第56-58页 |
2.2.2. Protein expression and purification | 第58-68页 |
2.2.2.1. Expression of GST-hMEX-3C Ring finger domain | 第58页 |
2.2.2.2. Extraction and purification | 第58-59页 |
2.2.2.3. GST column affinity chromatography | 第59-61页 |
2.2.2.4. SDS-PAGE experiment | 第61-63页 |
2.2.2.5. Protein concentration | 第63-64页 |
2.2.2.6. Gel filtration chromatography | 第64-66页 |
2.2.2.7. The excision and purification of recombinant expressed protein tags | 第66-68页 |
2.2.3. Crystallization, crystal data collection, and processing | 第68-69页 |
2.2.3.1. Crystal growth | 第68-69页 |
2.2.3.2. Crystal data collection and processing | 第69页 |
2.2.4. Ubiquitylation assays | 第69-70页 |
2.2.5. Western blot technique | 第70-73页 |
2.2.6. Assay of chelation experiment | 第73页 |
2.2.7. Circular Dichroism (CD) spectrometry | 第73-75页 |
2.3. Results | 第75-87页 |
2.3.1. Expression and purification of the hMEX-3C Ring finger domain | 第75-76页 |
2.3.2. Sequence and structural analysis of the hMEX-3C Ring finger domain | 第76-80页 |
2.3.3. The Ring finger domain of hMEX-3Cnmediates autoubiquitination assays | 第80-82页 |
2.3.4. Structural superimposition and ubiquitination assays identified the key residuesinvolved in the interaction with E2-Ub | 第82-86页 |
2.3.5. A role for zinc ions (Zn~(2+)) in the ubiquitination assay of the hMEX-3C Ring fingerdomin | 第86-87页 |
2.4. Summary and Discussion | 第87-91页 |
References | 第91-115页 |
Acknowledgements | 第115-117页 |
Academic papers published during PhD period | 第117页 |