| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-10页 |
| 上篇 文献综述 | 第11-28页 |
| 第一章 梨锈水病的研究现状 | 第12-16页 |
| 1 梨锈水病的发生及危害 | 第12-13页 |
| 2 梨锈水病的病原学研究 | 第13-14页 |
| 2.1 病原菌 | 第13页 |
| 2.2 D.fangzhongdai sp.nov.的分类学地位 | 第13-14页 |
| 2.3 发病特点 | 第14页 |
| 3 梨锈水病的防治方法 | 第14-16页 |
| 3.1 农业防治 | 第14页 |
| 3.2 化学防治 | 第14-16页 |
| 第二章 植物病原菌的检测和鉴定技术 | 第16-24页 |
| 1 传统检测技术 | 第16-17页 |
| 1.1 分离培养法 | 第16页 |
| 1.2 致病性测定 | 第16-17页 |
| 1.3 生理生化法 | 第17页 |
| 2 血清学检测技术 | 第17-18页 |
| 2.1 凝集反应测定法(Agglutination Reaction) | 第17页 |
| 2.2 酶联反应吸附测定(ELISA) | 第17-18页 |
| 2.3 免疫荧光技术(Immunofluorescence) | 第18页 |
| 2.4 胶体金免疫层析检测法(Immune Colloidal Gold Technique) | 第18页 |
| 3 植物病原细菌DNA分子生物学检测方法 | 第18-24页 |
| 3.1 聚合酶链式反应技术(Polymerase Chain Reaction,PCR) | 第18-21页 |
| 3.2 锁式探针技术(Padlock) | 第21页 |
| 3.3 基因芯片技术(DNA Chip) | 第21-22页 |
| 3.4 DNA条形码检测技术(DNA Barcoding) | 第22页 |
| 3.5 环介导等温扩增技术(LAMP) | 第22-24页 |
| 第三章 生物信息技术与分子检测靶点的发掘 | 第24-28页 |
| 1 生物信息学简介 | 第24页 |
| 2 生物信息数据库的建设 | 第24-25页 |
| 2.1 各大数据库的介绍 | 第24-25页 |
| 3 序列分析方法 | 第25-26页 |
| 3.1 序列相似性比较 | 第25页 |
| 3.2 序列比对工具 | 第25-26页 |
| 4 生物信息学的应用 | 第26-27页 |
| 5 我国出入境检疫工作对于生物信息学发展的要求 | 第27-28页 |
| 下篇 研究内容 | 第28-74页 |
| 第一章 用生物信息学方法发掘梨锈水病菌分子检测靶点 | 第30-38页 |
| 1 方法与流程概述 | 第31页 |
| 2 基于本地化的生物分析体系的构建 | 第31-34页 |
| 2.1 系统平台与运行环境 | 第31-32页 |
| 2.2 Blast软件的获得及安装 | 第32页 |
| 2.3 细菌数据库来源及本地化处理 | 第32-33页 |
| 2.4 梨锈水菌核酸序列来源 | 第33-34页 |
| 3 梨锈水菌特异性基因序列的发掘 | 第34-36页 |
| 3.1 多文件Blast比对 | 第34-35页 |
| 3.2 比对结果分析筛选 | 第35页 |
| 3.3 筛选结果与分析 | 第35页 |
| 3.4 设计特异性引物 | 第35-36页 |
| 4 讨论 | 第36-38页 |
| 第二章 梨锈水病原菌特异性检测靶点的PCR评价 | 第38-54页 |
| 1 材料与方法 | 第39-45页 |
| 1.1 材料 | 第39-42页 |
| 1.2 方法 | 第42-45页 |
| 2 结果与分析 | 第45-53页 |
| 2.1 普通PCR引物特异性 | 第45-50页 |
| 2.2 PCR引物灵敏度 | 第50-51页 |
| 2.3 实际样品检测 | 第51-53页 |
| 3 结论 | 第53-54页 |
| 第三章 应用Real-Time PCR检测梨锈水病原菌 | 第54-66页 |
| 1 材料与方法 | 第55-61页 |
| 1.1 材料 | 第55-56页 |
| 1.2 方法 | 第56-61页 |
| 2 结果与分析 | 第61-65页 |
| 2.1 标准质粒的构建 | 第61-62页 |
| 2.2 荧光定量PCR的条件优化 | 第62页 |
| 2.3 标准曲线的建立 | 第62页 |
| 2.4 特异性试验 | 第62-63页 |
| 2.5 灵敏度实验 | 第63-64页 |
| 2.6 重复性实验 | 第64页 |
| 2.7 实际样品检测 | 第64-65页 |
| 3 讨论 | 第65-66页 |
| 第四章 丁香假单胞菌黄瓜株系和甜瓜株系的碳源利用比较 | 第66-74页 |
| 1 材料和方法 | 第67-69页 |
| 1.1 材料 | 第67-68页 |
| 1.2 Biolog鉴定 | 第68-69页 |
| 2 结果和分析 | 第69-71页 |
| 2.1 碳源利用结果表明丁香假单胞菌黄瓜株系和甜瓜株系属于不同的基因种 | 第69-71页 |
| 3 讨论 | 第71-74页 |
| 参考文献 | 第74-82页 |
| 攻读硕士学位期间文章发表情况 | 第82-84页 |
| 致谢 | 第84页 |
