| 摘要 | 第10-12页 |
| Abstract | 第12-14页 |
| 第一章 绪论 | 第15-21页 |
| 1.1 潮间带生态系统 | 第15-16页 |
| 1.2 底栖微型真核生物研究简介 | 第16-17页 |
| 1.3 微型真核生物分子生态学研究方法进展 | 第17-19页 |
| 1.3.1 分子标记技术 | 第17-18页 |
| 1.3.2 变性梯度和温度梯度凝胶电泳 | 第18-19页 |
| 1.3.3 高通量测序技术 | 第19页 |
| 1.4 研究意义与特色 | 第19-21页 |
| 第二章 漳江口红树林底栖微型真核生物的多样性研究 | 第21-55页 |
| 2.1 漳江口红树林概况 | 第21页 |
| 2.2 实验材料和方法 | 第21-28页 |
| 2.2.1 采样时间和地点 | 第21-22页 |
| 2.2.2 非生物因子的采集与测定 | 第22-23页 |
| 2.2.3 生物因子的测定 | 第23页 |
| 2.2.4 沉积物中总RNA提取及逆转录 | 第23-24页 |
| 2.2.5 18S rRNA V4区扩增与PCR产物纯化 | 第24页 |
| 2.2.6 Illumina测序及测序结果优化 | 第24-25页 |
| 2.2.7 高通量测序数据分析 | 第25页 |
| 2.2.8 丰富(abundant)和稀有(rare)OTUs | 第25页 |
| 2.2.9 Alpha多样性指数计算 | 第25-27页 |
| 2.2.10 Beta多样性分析 | 第27-28页 |
| 2.3 实验结果 | 第28-50页 |
| 2.3.1 非生物因子 | 第28-31页 |
| 2.3.2 生物因子 | 第31-35页 |
| 2.3.3 Alpha多样性及其与环境因子的相关性 | 第35-38页 |
| 2.3.4 底栖微型真核生物群落组成 | 第38-41页 |
| 2.3.5 微型真核生物群落相似性分析 | 第41-45页 |
| 2.3.6 微型真核生物对环境因子的响应 | 第45-50页 |
| 2.4 讨论 | 第50-54页 |
| 2.4.1 部分数据的缺失 | 第50-51页 |
| 2.4.2 底栖微型真核生物群落组成 | 第51-52页 |
| 2.4.3 底栖微型真核生物群落的驱动因子 | 第52-53页 |
| 2.4.4 底栖微型真核生物优势类群和稀有类群的比较 | 第53-54页 |
| 2.5 小结 | 第54-55页 |
| 第三章 厦门近岸潮间带底栖微型真核生物时空分布 | 第55-72页 |
| 3.1 实验材料与方法 | 第55-57页 |
| 3.1.1 采样时间和地点 | 第55-56页 |
| 3.1.2 样品的采集与测定 | 第56-57页 |
| 3.2 实验结果 | 第57-69页 |
| 3.2.1 非生物因子 | 第57页 |
| 3.2.2 生物因子 | 第57-60页 |
| 3.2.3 Alpha多样性及其与环境因子的相关性 | 第60-62页 |
| 3.2.4 底栖微型真核生物群落组成 | 第62-64页 |
| 3.2.5 底栖微型真核生物群落相似性分析 | 第64-68页 |
| 3.2.6 环境因子对微型真核生物群落组成的影响 | 第68-69页 |
| 3.3 讨论 | 第69-70页 |
| 3.3.1 OTU丰度和Chao1值 | 第69-70页 |
| 3.3.2 环境因子对微型真核生物组成的影响 | 第70页 |
| 3.4 小结 | 第70-72页 |
| 第四章 总结与展望 | 第72-74页 |
| 4.1 主要结论 | 第72-73页 |
| 4.2 创新点 | 第73页 |
| 4.3 不足之处 | 第73页 |
| 4.4 未来工作的展望 | 第73-74页 |
| 参考文献 | 第74-82页 |
| 致谢 | 第82页 |
