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贵州省喀斯特地区叶点霉属真菌的分类与系统发育研究

摘要第5-7页
英文摘要第7-8页
第一章 绪论第9-15页
    1.1 叶点霉属真菌的重要性第9-11页
    1.2 叶点霉属形态学研究第11页
    1.3 系统发育学在叶点霉属真菌中的应用第11-12页
    1.4 中国叶点霉属研究进展第12-13页
    1.5 贵州喀斯特地区生态特点第13页
    1.6 本研究意义第13-15页
第二章 叶点霉属真菌的采集及鉴定第15-46页
    2.1 材料第15-16页
        2.1.1 主要试剂第15页
        2.1.2 实验仪器第15-16页
        2.1.3 培养基第16页
    2.2 方法第16-27页
        2.2.1 标本采集第16页
        2.2.2 菌株的分离纯化第16-17页
        2.2.3 病原菌形态学研究与培养性状第17页
        2.2.4 菌株保藏第17页
        2.2.5 基因组DNA的提取第17-18页
        2.2.6 特异性片段的扩增第18-22页
        2.2.7 PCR产物检测及测序第22页
        2.2.8 系统发育学分析第22-26页
            2.2.8.1 序列校对与序列拼接第22页
            2.2.8.2 序列的搜索及下载第22-25页
            2.2.8.3 序列比对第25页
            2.2.8.4 提取保守位点第25页
            2.2.8.5 基因连接第25页
            2.2.8.6 多基因系统发育分析第25-26页
            2.2.8.7 系统发育树编辑第26页
        2.2.9 新种数据上传第26-27页
    2.3 结果与分析第27-44页
        2.3.1 分离结果第27-28页
        2.3.2 分离菌株在PDA培养基上的培养性状第28-29页
        2.3.3 贵州喀斯特地区叶点霉属分子系统发育分析第29-33页
            2.3.3.1 保守序列的选取第29页
            2.3.3.2 多基因系统发育分析第29-33页
        2.3.4 新种鉴定第33-44页
            2.3.4.1 叶点霉属新种的鉴定描述第33-35页
            2.3.4.2 新种登陆号的获取第35页
            2.3.4.3 叶点霉属已知种的鉴定与描述第35-44页
                2.3.4.3.1 中央叶点霉第35-39页
                    2.3.4.3.1.1红豆杉叶斑病病原鉴定第37-39页
                2.3.4.3.2 香蕉生球座菌第39-41页
                    2.3.4.3.2.1.山茶花灰斑病病原鉴定第39-41页
                2.3.4.3.3 地锦叶点霉第41-44页
                    2.3.4.3.3.1爬山虎叶斑病病原鉴定第41-44页
    2.4 讨论第44-45页
    2.5 结论第45-46页
第三章 关于Phyllosticta属真菌骨干树支持率提升的探索第46-59页
    3.1 前言第46页
    3.2 材料第46-49页
        3.2.1 试验所需菌株第46-49页
    3.3 方法第49-50页
        3.3.1 数据集碱基组成的同质性检验及替换形式异质性差异分析第49页
        3.3.2 同型性状分析第49-50页
        3.3.3 树长分布偏斜性检验第50页
        3.3.4 矩阵随机化检验(PTP)第50页
        3.3.5 潜在同源性状法第50页
        3.3.6 邻居网络法分析第50页
    3.4 结果与分析第50-57页
        3.4.1 碱基同质性分析第50-51页
        3.4.2 碱基异质性分析第51-54页
        3.4.3 同型性状分析第54页
        3.4.4 树长分布偏斜性检验第54-55页
        3.4.5 矩阵随机化检验第55-56页
        3.4.6 潜在同源性状法第56页
        3.4.7 邻居网络法分析第56-57页
    3.5 结论与讨论第57-59页
致谢第59-60页
参考文献第60-68页
附录第68-75页
攻读学位期间发表的学术论文第75-76页

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