| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第1章 绪论 | 第12-32页 |
| 1.1 常用生物信息数据库介绍 | 第13-16页 |
| 1.1.1 不同研究方向代表性数据库 | 第13-14页 |
| 1.1.2 四大常见的核酸数据库 | 第14-16页 |
| 1.2 相关编程语言介绍 | 第16-19页 |
| 1.2.1 C语言简介 | 第16-18页 |
| 1.2.2 R语言简介 | 第18-19页 |
| 1.3 简单重复序列概览 | 第19-23页 |
| 1.3.1 重复序列的分类 | 第20-21页 |
| 1.3.2 简单重复序列的分布情况 | 第21-22页 |
| 1.3.3 简单重复序列的功能 | 第22页 |
| 1.3.4 简单重复序列的应用 | 第22-23页 |
| 1.4 人类的相关知识介绍 | 第23-30页 |
| 1.4.1 人类的起源与演化 | 第23-26页 |
| 1.4.2 人类Y染色体的起源与进化 | 第26-29页 |
| 1.4.3 人类Y染色体的分子结构 | 第29-30页 |
| 1.5 本研究工作的内容和意义 | 第30-32页 |
| 第2章 人类基因组Y染色体参考序列中微卫星序列的统计学分析 | 第32-44页 |
| 2.1 前言 | 第32页 |
| 2.2 材料与方法 | 第32-36页 |
| 2.2.1 人类基因组Y染色体参考序列 | 第32-35页 |
| 2.2.2 微卫星的提取 | 第35页 |
| 2.2.3 人类Y染色体参考序列55个已测序片段S1-S55的统计学分析 | 第35-36页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第36-42页 |
| 2.3.1 所有已测序片段上微卫星的统计 | 第36-37页 |
| 2.3.2 各个已测序片段上微卫星的统计 | 第37-40页 |
| 2.3.3 各个已测序片段上不同重复单元微卫星的统计 | 第40-42页 |
| 2.4 本章小结 | 第42-44页 |
| 第3章 人类基因组Y染色体参考序列的SSR序列不均匀性分析 | 第44-53页 |
| 3.1 前言 | 第44页 |
| 3.2 材料与方法 | 第44-49页 |
| 3.2.1 人类基因组Y染色体参考序列及微卫星的提取 | 第44-45页 |
| 3.2.2 微型卫星微分计算器DCM 2.0 | 第45-48页 |
| 3.2.3 数据可视化之R语言ggplot包 | 第48-49页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第49-52页 |
| 3.3.1 以50000bp为微分单元的人类Y染色体参考序列上SSR不均匀分布分析 | 第49-51页 |
| 3.3.2 以1000bp为微分单元的人类Y染色体参考序列上SSR不均匀分布分析 | 第51-52页 |
| 3.4 本章小结 | 第52-53页 |
| 结论 | 第53-55页 |
| 参考文献 | 第55-59页 |
| 附录B 用C语言爬取序列中N区域的程序代码 | 第59-61页 |
| 附录C 附表1 | 第61-64页 |
| 附录D 附表2 | 第64-66页 |
| 附录E 附图1 | 第66-67页 |
| 致谢 | 第67页 |
