| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 引言 | 第14-15页 |
| 第一章 综述 | 第15-29页 |
| 1.1 冷应激和增强鸡低温适应性的需求 | 第15-16页 |
| 1.1.1 冷应激 | 第15页 |
| 1.1.2 气候条件与冷应激 | 第15页 |
| 1.1.3 生态型养殖模式与冷应激 | 第15-16页 |
| 1.2 低温对鸡的影响和低温适应 | 第16-25页 |
| 1.2.1 低温对鸡生长发育、生产性能和健康的影响 | 第16-17页 |
| 1.2.2 低温对鸡神经内分泌系统的影响 | 第17-20页 |
| 1.2.3 低温对鸡基因表达的影响 | 第20-22页 |
| 1.2.4 鸟类对低温环境的适应 | 第22-25页 |
| 1.3 转录组学及其在鸡抗性研究中的应用 | 第25-26页 |
| 1.3.1 转录组学的发展 | 第25-26页 |
| 1.3.2 RNA-Seq在鸡热应激和疾病研究中的应用 | 第26页 |
| 1.4 基因共表达网络及其在畜禽研究中的应用 | 第26-28页 |
| 1.4.1 基因共表达网络 | 第26-27页 |
| 1.4.2 畜禽中基因共表达网络的研究 | 第27-28页 |
| 1.5 低温适应性评价、实验设计和研究目的 | 第28-29页 |
| 第二章 低温环境对鸡生产性能的影响及品种间低温适应性比较 | 第29-38页 |
| 2.1 实验鸡品种的选择 | 第29页 |
| 2.2 实验动物 | 第29-30页 |
| 2.3 实验方法 | 第30-32页 |
| 2.3.1 实验设计和环境 | 第30-31页 |
| 2.3.2 测定指标和品种间低温适应性比较 | 第31页 |
| 2.3.3 统计方法 | 第31-32页 |
| 2.4 实验结果 | 第32-36页 |
| 2.4.1 低温环境对RIR、BS、RMBF、RFBM产蛋性能的影响 | 第32-33页 |
| 2.4.2 低温环境对RIR、BS、RMBF、RFBM体重的影响 | 第33-35页 |
| 2.4.3 低温环境对RIR、BS、RMBF、RFBM采食量的影响 | 第35-36页 |
| 2.5 分析与讨论 | 第36-38页 |
| 第三章 低温环境对鸡体温和血液生化指标的影响 | 第38-47页 |
| 3.1 实验动物和实验环境 | 第38页 |
| 3.2 实验方法 | 第38-39页 |
| 3.2.1 样本采集 | 第38页 |
| 3.2.2 体温和血液生化指标数据的测定 | 第38-39页 |
| 3.3 实验结果 | 第39-44页 |
| 3.3.1 低温环境对RIR、BS、RMBF、RFBM体温的影响 | 第39-41页 |
| 3.3.2 低温环境对RIR、BS、RMBF、RFBM血液生化指标的影响 | 第41-44页 |
| 3.4 分析与讨论 | 第44-47页 |
| 第四章 品种和温度对鸡下丘脑、垂体、甲状腺、卵巢转录组的影响 | 第47-96页 |
| 4.1 实验材料 | 第47-48页 |
| 4.1.1 实验动物和处理 | 第47页 |
| 4.1.2 主要仪器设备及试剂 | 第47-48页 |
| 4.2 实验方法 | 第48-53页 |
| 4.2.1 样本采集 | 第48页 |
| 4.2.2 总RNA提取 | 第48-49页 |
| 4.2.3 RNA-Seq | 第49页 |
| 4.2.4 测序数据处理与差异基因分析 | 第49-50页 |
| 4.2.5 GO和KEGG分析 | 第50-51页 |
| 4.2.6 可变剪切分析 | 第51页 |
| 4.2.7 差异表达基因的荧光定量PCR验证 | 第51-53页 |
| 4.3 转录组学研究结果与分析 | 第53-94页 |
| 4.3.1 甲状腺转录组学研究结果与分析 | 第53-74页 |
| 4.3.2 下丘脑转录组学研究结果与分析 | 第74-81页 |
| 4.3.3 垂体转录组学研究结果与分析 | 第81-87页 |
| 4.3.4 卵巢转录组学研究结果与分析 | 第87-94页 |
| 4.4 荧光定量PCR验证 | 第94-96页 |
| 第五章 基因共表达网络分析 | 第96-107页 |
| 5.1 实验数据和分析方法 | 第96-98页 |
| 5.1.1 数据集和软件 | 第96-97页 |
| 5.1.2 权重基因共表达网络分析 | 第97页 |
| 5.1.3 基因模块功能分析 | 第97-98页 |
| 5.2 结果 | 第98-105页 |
| 5.2.1 数据过滤和样本聚类 | 第98页 |
| 5.2.2 阈值参数确定 | 第98-100页 |
| 5.2.3 权重基因共表达网络构建和基因模块识别 | 第100-101页 |
| 5.2.4 基因模块的功能富集分析 | 第101-105页 |
| 5.3 讨论 | 第105-107页 |
| 第六章 结论 | 第107-108页 |
| 6.1 主要结论 | 第107页 |
| 6.2 创新点 | 第107-108页 |
| 参考文献 | 第108-124页 |
| 附图 | 第124-125页 |
| 附表 | 第125-126页 |
| 致谢 | 第126-127页 |
| 个人简介 | 第127页 |
