| 摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 缩略词表 | 第12-13页 |
| 第一章 前言 | 第13-31页 |
| 1.1 课题的提出 | 第13-14页 |
| 1.2 前人研究进展 | 第14-29页 |
| 1.2.1 什么是表观遗传 | 第14页 |
| 1.2.2 表观调控机制 | 第14-15页 |
| 1.2.3 DNA甲基化 | 第15-20页 |
| 1.2.4 组蛋白修饰 | 第20-23页 |
| 1.2.5 表观基因组 | 第23页 |
| 1.2.6 DNA甲基化的研究方法 | 第23-26页 |
| 1.2.7 DNA甲基化的功能 | 第26-29页 |
| 1.3 本研究的目的和内容 | 第29-31页 |
| 第二章 柑橘果实发育过程中DNA甲基化变化 | 第31-48页 |
| 2.1 引言 | 第31-32页 |
| 2.2 材料与方法 | 第32-35页 |
| 2.2.1 实验材料 | 第32页 |
| 2.2.2 实验方法 | 第32-35页 |
| 2.3 结果与分析 | 第35-44页 |
| 2.3.1 高效毛细管电泳测定DNA甲基化方法的建立和甜橙中不同组织的DNA甲基化水平 | 第35-36页 |
| 2.3.2 柑橘果实发育时期DNA甲基化水平的变化 | 第36-37页 |
| 2.3.3 DNA甲基化相关基因的克隆及Southern杂交分析 | 第37-39页 |
| 2.3.4 DNA甲基化相关基因在甜橙不同组织的表达模式 | 第39-40页 |
| 2.3.5 DNA甲基化相关基因在不同果实发育时期的表达模式 | 第40-42页 |
| 2.3.6 暗柳橙和红暗柳橙中类胡萝卜素关键基因PSY和LCYB的甲基化分析 | 第42-44页 |
| 2.4 讨论 | 第44-48页 |
| 2.4.1 甜橙DNA甲基化水平与其他物种的比较 | 第44-45页 |
| 2.4.2 DNA甲基化在不同组织和不同发育时期的特异性 | 第45-46页 |
| 2.4.3 柑橘中的DNA甲基转移酶及其表达特性 | 第46页 |
| 2.4.4 PSY和LCYB基因的甲基化修饰 | 第46-48页 |
| 第三章 去甲基化处理对柑橘愈伤中类胡萝卜素积累的影响 | 第48-71页 |
| 3.1 引言 | 第48-49页 |
| 3.2 材料方法 | 第49-52页 |
| 3.2.1 实验材料 | 第49-50页 |
| 3.2.2 实验方法 | 第50-52页 |
| 3.3 结果与分析 | 第52-67页 |
| 3.3.1 5-氮胞苷处理造成了愈伤中类胡萝卜素的降解 | 第52-54页 |
| 3.3.2 5-氮胞苷处理显著上调了类胡萝卜素代谢中CCD1的表达 | 第54-56页 |
| 3.3.3 CpCCD1具有降解类胡萝卜素的功能 | 第56-57页 |
| 3.3.4 去甲基化并不是直接激活CpCCD1的原因 | 第57-59页 |
| 3.3.5 5-氮胞苷处理诱导DNA甲基转移酶基因的上调表达 | 第59页 |
| 3.3.6 5-氮胞苷处理后的ABA分析 | 第59-60页 |
| 3.3.7 5-氮胞苷处理对愈伤表达谱的影响 | 第60-63页 |
| 3.3.8 5-氮胞苷处理对全基因组甲基化的影响 | 第63-66页 |
| 3.3.9 5-氮胞苷处理对初生代谢物的影响 | 第66-67页 |
| 3.4 讨论 | 第67-71页 |
| 3.4.1 愈伤中类胡萝卜素的存贮方式为CCD1提供了降解底物 | 第67-68页 |
| 3.4.2 CpCCD1的上调表达与DNA甲基化 | 第68页 |
| 3.4.3 5-氮胞苷处理的去甲基化作用具有全基因组范围内的随机性 | 第68-69页 |
| 3.4.4 5-氮胞苷处理诱导柑橘愈伤类胡萝卜素降解机制的假定模型 | 第69-71页 |
| 第四章 柑橘多胚发育过程中DNA甲基化的调控作用 | 第71-85页 |
| 4.1 引言 | 第71-72页 |
| 4.2 材料方法 | 第72-74页 |
| 4.2.1 实验材料 | 第72-73页 |
| 4.2.2 实验方法 | 第73-74页 |
| 4.3 结果与分析 | 第74-82页 |
| 4.3.1 多胚发育过程中的转录组分析 | 第74-76页 |
| 4.3.2 全基因组甲基化解析柑橘多胚发育过程 | 第76-78页 |
| 4.3.3 柑橘多胚发育过程中甲基化组和转录组的联合分析 | 第78-79页 |
| 4.3.4 柑橘有性生殖胚珠发育过程的全基因组甲基化分析 | 第79-81页 |
| 4.3.5 遗传定位的多胚控制区域内的变化 | 第81-82页 |
| 4.4 讨论 | 第82-85页 |
| 第五章 甜橙中组蛋白修饰酶基因的鉴定与分析 | 第85-108页 |
| 5.1 引言 | 第85-86页 |
| 5.2 材料方法 | 第86-89页 |
| 5.2.1 实验材料 | 第86-87页 |
| 5.2.2 实验方法 | 第87-89页 |
| 5.3 结果与分析 | 第89-104页 |
| 5.3.1 甜橙基因组中的HMs（Histone Modification genes） | 第89-90页 |
| 5.3.2 CsHMs的基因组分布 | 第90-91页 |
| 5.3.3 CsHMs的聚类、结构域和基因结构分析 | 第91-96页 |
| 5.3.4 CsHMs在不同组织中的表达分析 | 第96-97页 |
| 5.3.5 CsHMs在果实发育时期的表达分析 | 第97-101页 |
| 5.3.6 青霉菌侵染后CsHMs的表达模式 | 第101-103页 |
| 5.3.7 CsSDG7的功能研究 | 第103-104页 |
| 5.4 讨论 | 第104-108页 |
| 5.4.1 甜橙中组蛋白修饰基因家族成员与其他物种的比较 | 第105页 |
| 5.4.2 SDG家族参与果实成熟过程和调控类胡萝卜素代谢 | 第105-106页 |
| 5.4.3 柑橘中组蛋白去甲基化及乙酰化/去乙酰化基因的潜在功能 | 第106-107页 |
| 5.4.4 柑橘组蛋白修饰基因对青霉菌侵染的响应 | 第107-108页 |
| 第六章 总结与展望 | 第108-110页 |
| 参考文献 | 第110-125页 |
| 附录 | 第125-140页 |
| 附录I 培养基配方 | 第125-126页 |
| 附录II 附表 | 第126-133页 |
| 附录III 图版与说明 | 第133-139页 |
| 附录IV 个人简介及发表论文列表 | 第139-140页 |
| 致谢 | 第140-141页 |
