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利用转录组测序分析大豆矮小突变体中差异表达基因

导师评阅表第3-6页
摘要第6-7页
Abstract第7页
目录第8-10页
主要缩略表第10-11页
引言第11-12页
第一章 文献综述第12-27页
    1.1 大豆的起源第12页
    1.2 大豆在国内外的现状第12-14页
    1.3 大豆产量研究进展第14-18页
        1.3.1 栽培技术在大豆生产中的作用第14-15页
        1.3.2 传统育种在大豆高产中的作用第15页
        1.3.3 分子标记技术在大豆高产中的运用第15-17页
        1.3.4 大豆产量的重要农业性状 QTL 的研究第17-18页
    1.4 作物矮生性状的遗传研究第18-20页
        1.4.1 水稻矮生性状的遗传研究第19页
        1.4.2 小麦矮生性状的遗传研究第19页
        1.4.3 玉米矮生性状的遗传研究第19-20页
        1.4.4 大豆矮生性状的遗传研究第20页
        1.4.5 其他作物矮生性状的研究第20页
    1.5 植物激素与矮化第20-25页
        1.5.1 赤霉素的合成与转导第21-22页
        1.5.2 赤霉素对植物株高的调控第22-23页
        1.5.3 油菜素内酯的合成与转导第23-24页
        1.5.4 油菜素内酯对株高的调控第24页
        1.5.5 生长素的合成与转导第24-25页
        1.5.6 生长素对株高的调控第25页
    1.6 转录组测序技术(RNA-Seq)研究进展第25-26页
        1.6.1 转录组测序技术第25页
        1.6.2 数字化表达谱的研究第25页
        1.6.3 RNA-Seq 技术的过程及优势第25-26页
    1.7 本研究的目的及意义第26-27页
第二章 实验材料与方法第27-33页
    2.1 实验材料第27页
        2.1.1 植物材料第27页
        2.1.2 主要生物试剂以及仪器第27页
        2.1.3 半定量 RT-PCR 与实时荧光定量 PCR 引物第27页
    2.2 试验方法第27-33页
        2.2.1 大豆矮小突变体 Gmdwarf1 表型观察第27-28页
        2.2.2 Total RNA 的提取第28页
        2.2.3 RNA 纯度测定以及电泳检测第28页
        2.2.4 转录组测序第28-29页
        2.2.5 转录组文库的生物信息学分析第29-31页
        2.2.6 cDNA 第一链反转录的合成第31-32页
        2.2.7 半定量 RT-PCR 和 qRT-PCR 实验验证分析第32页
        2.2.8 差异表达基因的生物信息学初步分析第32-33页
第三章 结果与分析第33-43页
    3.1 大豆矮小突变体 Gmdwarf1 表型观察第33-34页
        3.1.1 大豆矮小突变体 Gmdwarf1 与大豆野生型表型对比第33页
        3.1.2 GA3及 IAA 处理大豆野生型和 Gmdwarf1 的表型观察第33-34页
    3.2 Total RNA 的提取结果检测第34页
    3.3 RNA-Seq 测序结果及分析第34-40页
        3.3.1 RNA-Seq 测序结果统计第34-36页
        3.3.2 差异表达基因的筛选第36-39页
        3.3.3 Gene ontology 功能的显著性富集以及 pathway 分析第39-40页
    3.4 半定量 RT-PCR 和 qRT-PCR 实验验证分析第40-41页
    3.5 Glyma19g01590 基因的生物信息学初步分析第41-43页
第四章 讨论与结论第43-45页
    4.1 大豆矮小突变体 Gmdwarf1 为赤霉素合成缺陷型第43页
    4.2 RNA-Seq 测序数据显示在大豆矮小突变体 Gmdwarf1 中存在多个差异表达基因第43-44页
    4.3 Glyma19g01590 基因表达受赤霉素的调节第44页
    结论第44-45页
参考文献第45-51页
致谢第51-52页
作者简介第52页

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