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短命植物小拟南芥全长cDNA文库的构建、测序及EST分析

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
主要缩略词第9-13页
引言第13-14页
第一章 文献综述第14-24页
    1.1 植物耐盐机制研究进展第14-15页
    1.2 短命植物的形态与耐盐性第15-16页
    1.3 构建全长 cDNA 文库的意义第16页
    1.4 Gateway 技术构建文库的原理第16-18页
    1.5 均一化文库构建研究进展第18-19页
    1.6 表达序列标签(EST)第19-21页
    1.7 两个耐盐相关基因的研究进展第21-23页
        1.7.1 Na+/H+逆向转运蛋白基因 NHX第21页
        1.7.2 类钙调素蛋白基因 CML13第21-23页
    1.8 本研究的目的和意义第23-24页
第二章 小拟南芥均一化全长 cDNA 文库的构建第24-37页
    2.1 材料和试剂第24页
        2.1.1 植物材料第24页
        2.1.2 主要试剂第24页
    2.2 方法第24-31页
        2.2.1 种子萌发及幼苗处理第24页
        2.2.2 总 RNA 的提取和 mRNA 的分离第24-25页
        2.2.3 全长 cDNA 初始文库的构建第25-29页
        2.2.4 均一化全长 cDNA 文库的构建第29-30页
        2.2.5 文库质量鉴定第30页
        2.2.6 文库均一化效果检测第30-31页
    2.3 结果与分析第31-35页
        2.3.1 小拟南芥叶片的总 RNA 和 mRNA第31页
        2.3.2 全长 cDNA 初始文库容量测定第31-33页
        2.3.3 均一化全长 cDNA 文库容量测定第33-34页
        2.3.4 cDNA 文库均一化效果检测第34-35页
    2.4 讨论第35-36页
    2.5 小结第36-37页
第三章 均一化全长 cDNA 文库随机克隆测序及序列分析第37-51页
    3.1 材料第37页
        3.1.1 植物材料第37页
        3.1.2 主要试剂及菌株第37页
    3.2 方法第37-38页
        3.2.1 均一化全长 cDNA 文库测序第37页
        3.2.2 文库中 ESTs 生物信息学分析第37页
        3.2.3 文库中 16 个 contigs 的表达分析第37-38页
    3.3 结果与分析第38-49页
        3.3.1 EST 序列测定、编辑和装配第38-40页
        3.3.2 Unigenes 功能注释和分类第40-45页
        3.3.3 文库中 16 个 contigs 的表达分析第45-49页
    3.4 讨论第49-50页
    3.5 结论第50-51页
第四章 小拟南芥 OpNHX1 基因的表达与功能分析第51-63页
    4.1 材料第51-53页
        4.1.1 植物材料第51页
        4.1.2 主要试剂第51页
        4.1.3 培养基的配制第51-52页
        4.1.4 菌株与质粒第52-53页
    4.2 方法第53-55页
        4.2.1 扩增 OpNHX1 基因的全长第53-54页
        4.2.2 OpNHX1 基因的生物信息学分析第54页
        4.2.3 OpNHX1 基因表达分析第54页
        4.2.4 构建过量表达载体及转基因拟南芥耐盐性分析第54-55页
        4.2.5 OpNHX1 在酵母中的功能验证第55页
    4.3 结果与分析第55-61页
        4.3.1 OpNHX1 全长基因的克隆第55-56页
        4.3.2 OpNHX1 基因的序列分析第56-58页
        4.3.3 OpNHX1 基因的组织表达模式第58-59页
        4.3.4 OpNHX1 基因的诱导表达分析第59页
        4.3.5 转基因拟南芥耐盐性分析第59-60页
        4.3.6 OpNHX1 在酵母突变体中的功能互补验证第60-61页
    4.4 讨论第61-62页
    4.5 结论第62-63页
第五章 小拟南芥 OpCML13 基因的克隆与分析第63-75页
    5.1 材料第63页
        5.1.1 植物材料第63页
        5.1.2 试剂第63页
    5.2 方法第63-67页
        5.2.1 小拟南芥的培养及 RNA 提取第63页
        5.2.2 小拟南芥 OpCML13 基因的克隆第63-65页
        5.2.3 OpCML13 基因的生物信息学分析第65页
        5.2.4 OpCML13 基因组织表达分析第65页
        5.2.5 OpCML13 基因逆境胁迫表达分析第65-66页
        5.2.6 过量表达载体 p35S:OpCML13 的构建第66-67页
    5.3 结果与分析第67-73页
        5.3.1 OpCML13 基因的克隆第67页
        5.3.2 OpCML13 基因的生物信息学分析第67-71页
        5.3.3 OpCML13 基因组织表达分析第71-72页
        5.3.4 OpCML13 基因的逆境胁迫表达分析第72页
        5.3.5 p35S:OpCML13 植物过量表达载体的构建第72-73页
    5.4 讨论第73-74页
    5.5 小结第74-75页
参考文献第75-81页
附录 1 文库中 16 个 contigs 表达分析的引物第81-82页
附录 2 文库中 894 个 ESTs 信息总汇第82页
附录 3 文库中 unigenes 的 KEGG pathway 分类情况第82-83页
致谢第83-84页
作者简介第84-85页
附件第85页

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