摘要 | 第4-6页 |
Abstract | 第6-7页 |
英文缩写词表 | 第10-11页 |
1 绪论 | 第11-20页 |
1.1 肝癌的概述 | 第11-13页 |
1.1.1 肝癌的流行现状 | 第11页 |
1.1.2 肝癌的危险因素及预防 | 第11-12页 |
1.1.3 肝癌的分子发病机制 | 第12页 |
1.1.4 肝癌的诊断及治疗 | 第12-13页 |
1.2 环状RNA概述 | 第13-20页 |
1.2.1 环状RNA的研究历史 | 第13-14页 |
1.2.2 环状RNA的种类 | 第14页 |
1.2.3 环状RNA的生物来源 | 第14-16页 |
1.2.4 环状RNA的特征 | 第16-17页 |
1.2.5 环状RNA的功能 | 第17-19页 |
1.2.6 环状RNA与肿瘤的关系 | 第19-20页 |
2 材料与方法 | 第20-29页 |
2.1 实验材料 | 第20-21页 |
2.1.1 标本采集与处理 | 第20页 |
2.1.2 主要试剂 | 第20-21页 |
2.1.3 主要仪器 | 第21页 |
2.2 实验方法 | 第21-29页 |
2.2.1 环状RNA及mRNA芯片数据的获得 | 第21-22页 |
2.2.2 芯片数据处理 | 第22-23页 |
2.2.3 环状RNA及mRNA基因调控网络的构建 | 第23-24页 |
2.2.4 差异表达环状RNA的验证 | 第24-28页 |
2.2.5 环状RNA与肝癌临床病理特征的关系 | 第28-29页 |
3 实验结果 | 第29-48页 |
3.1 肝癌组织环状RNA和MRNA表达谱的筛选 | 第29-35页 |
3.1.1 芯片杂交用总RNA质量检测 | 第29-30页 |
3.1.2 数据的标准化 | 第30页 |
3.1.3 差异基因表达谱统计 | 第30-32页 |
3.1.4 差异基因表达谱的可视化展示 | 第32-34页 |
3.1.5 环状RNA种类及在染色体上的分布 | 第34-35页 |
3.2 差异基因的GO功能注释及PATHWAY分析 | 第35-36页 |
3.3 环状RNA调控网络的构建 | 第36-44页 |
3.3.1 全局circRNAs-miRNA调控网络的构建 | 第36-37页 |
3.3.2 circRNA-miRNA-mRNA调控网络的构建 | 第37-43页 |
3.3.3 circRNA-miRNA-mRNA功能模块的构建 | 第43-44页 |
3.4 环状RNA的验证 | 第44-48页 |
4 讨论 | 第48-52页 |
5 结论 | 第52-53页 |
附录 | 第53-55页 |
参考文献 | 第55-63页 |
作者简介 | 第63-64页 |
致谢 | 第64页 |