| 摘要 | 第3-5页 |
| ABSTRACT | 第5-6页 |
| 1 前言 | 第10-26页 |
| 1.1 转录组学概述及研究进展 | 第10-16页 |
| 1.1.1 转录组学概述及应用 | 第10-12页 |
| 1.1.2 转录组测序与基因表达谱的区别 | 第12页 |
| 1.1.3 转录组测序平台的发展 | 第12-14页 |
| 1.1.4 Illumina/Solexa测序的原理及应用 | 第14-15页 |
| 1.1.5 鱼类性腺的转录组学研究 | 第15-16页 |
| 1.2 性别决定和分化 | 第16-19页 |
| 1.2.1 遗传物质性别决定 | 第16-18页 |
| 1.2.2 环境因素性别决定 | 第18-19页 |
| 1.2.3 动物的性别分化和性腺发育 | 第19页 |
| 1.3 鱼类性别决定和分化 | 第19-22页 |
| 1.3.1 鱼类性别决定类型 | 第19页 |
| 1.3.2 鱼类性别分化相关基因及调控通路 | 第19-22页 |
| 1.4 Wnt4基因的研究现状 | 第22-23页 |
| 1.5 本研究的立项依据和目的意义 | 第23-26页 |
| 2 材料与方法 | 第26-42页 |
| 2.1 材料 | 第26-28页 |
| 2.1.1 实验动物 | 第26页 |
| 2.1.2 主要试剂及仪器设备 | 第26-27页 |
| 2.1.3 溶液的配制 | 第27-28页 |
| 2.2 试验方法 | 第28-42页 |
| 2.2.1 组织切片观察 | 第28-32页 |
| 2.2.2 RNA样品制备及质量检测 | 第32-33页 |
| 2.2.3 cDNA文库构建 | 第33页 |
| 2.2.4 上机测序及序列组装 | 第33页 |
| 2.2.5 功能注释 | 第33-34页 |
| 2.2.6 差异基因分析 | 第34页 |
| 2.2.7 转录组文库与qRT-PCR验证 | 第34-36页 |
| 2.2.8 Wnt4基因的扩增 | 第36-38页 |
| 2.2.9 泥鳅wnt4基因序列分析和进化树的构建 | 第38页 |
| 2.2.10 实验中所用引物 | 第38-42页 |
| 3 结果与分析 | 第42-66页 |
| 3.1 组织切片观察发育时期结果 | 第42-43页 |
| 3.2 转录组测序 | 第43-56页 |
| 3.2.1 RNA提取结果 | 第43页 |
| 3.2.2 RNA质量检测结果 | 第43-44页 |
| 3.2.3 转录组测序结果分析 | 第44-46页 |
| 3.2.4 转录组unigene的功能注释 | 第46-47页 |
| 3.2.5 基因表达概况 | 第47-49页 |
| 3.2.6 GO分类 | 第49页 |
| 3.2.7 KEGG分类 | 第49-51页 |
| 3.2.8 KOG分类 | 第51-52页 |
| 3.2.9 CDS预测和蛋白序列翻译 | 第52-53页 |
| 3.2.10 差异基因表达水平聚类分析 | 第53-54页 |
| 3.2.11 样品间相关性分析 | 第54页 |
| 3.2.12 差异基因分析 | 第54-56页 |
| 3.3 qRT-PCR验证 | 第56页 |
| 3.4 Wnt4基因的生物信息学分析 | 第56-66页 |
| 3.4.1 泥鳅Wnt4基因的序列分析 | 第56-58页 |
| 3.4.2 泥鳅Wnt4基因的同源性分析 | 第58-61页 |
| 3.4.3 泥鳅Wnt4基因系统发育树分析 | 第61-62页 |
| 3.4.4 泥鳅Wnt4基因的亲水性分析 | 第62页 |
| 3.4.5 泥鳅WNT4氨基酸的跨膜特性 | 第62-63页 |
| 3.4.6 泥鳅Wnt4基因的信号肽分析 | 第63-64页 |
| 3.4.7 泥鳅WNT4蛋白质结构分析 | 第64-66页 |
| 4 讨论 | 第66-72页 |
| 4.1 组织形态学观察 | 第66页 |
| 4.2 转录组测序结果 | 第66页 |
| 4.3 转录组数据的分析和验证 | 第66-69页 |
| 4.4 Wnt4的生物信息学分析 | 第69-72页 |
| 参考文献 | 第72-82页 |
| 致谢 | 第82-84页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文目录 | 第84-86页 |