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家蚕茧丝产量相关基因的挖掘与分析

摘要第6-8页
Abstract第8-9页
第1章 绪论第15-23页
    1.1 研究背景及意义第15页
    1.2 茧丝产量的研究现状第15-17页
        1.2.1 家蚕茧丝性状概述第15页
        1.2.2 分子生物学技术在茧丝性状研究中的应用第15-16页
        1.2.3 家蚕数量性状QTL定位研究第16页
        1.2.4 家蚕茧丝性状在基因组学水平上的研究第16-17页
    1.3 丝腺相关基因第17-19页
        1.3.1 家蚕丝腺的构造及生理功能第17-18页
        1.3.2 丝蛋白基因的研究进展第18-19页
    1.4 家蚕丝蛋白基因的转录调控第19-21页
        1.4.1 丝素基因的顺式调控元件第20页
        1.4.2 丝蛋白基因的反式作用因子第20-21页
    1.5 基因组定点编辑技术第21-22页
        1.5.1 CRISPR/Cas 技术第21页
        1.5.2 CRISPR/Cas 技术的优点以及应用第21-22页
    1.6 本研究目的和意义第22-23页
第2章 两种不同产丝量家蚕丝腺的转录组比较分析第23-41页
    2.1 前言第23页
    2.2 材料与试剂第23-26页
        2.2.1 家蚕第23页
        2.2.2 主要实验仪器和设备第23-24页
        2.2.3 主要试剂第24页
        2.2.4 常用溶液的配制第24-26页
    2.3 实验方法第26-31页
        2.3.1 样品准备第26页
        2.3.2 RNA提取和文库构建第26-27页
        2.3.3 转录组测序和质量控制第27页
        2.3.4 差异表达基因的分析第27页
        2.3.5 GO功能注释和KEGG富集通路分析第27页
        2.3.6 反转录反应第27-28页
        2.3.7 cDNA扩增反应及电泳检测第28页
        2.3.8 切胶回收第28-29页
        2.3.9 PCR产物的连接、转化及克隆测序第29-30页
        2.3.10 qRT-PCR验证分析第30-31页
    2.4 实验结果第31-38页
        2.4.1 转录组测序结果的概述第31-32页
        2.4.2 丝腺中的差异表达基因(DEGs)第32页
        2.4.3 KEGG,GO注释和富集分析第32-34页
        2.4.4 qRT-PCR的结果分析第34-38页
    2.5 讨论第38-41页
        2.5.1 丝腺中的富集通路主要于蛋白质的合成有关第38页
        2.5.2 差异表达基因在L10中上调第38-39页
        2.5.3 差异表达基因在JS中上调第39-41页
第3章 丝蛋白合成相关转录因子分析第41-49页
    3.1 前言第41页
    3.2 材料方法第41-42页
        3.2.1 转录因子数据及通路相关基因的获取第41页
        3.2.2 靶标基因富集分析第41-42页
        3.2.3 实验材料第42页
        3.2.4 实验试剂及仪器设备第42页
        3.2.5 实验方法第42页
    3.3 结果讨论第42-46页
        3.3.1 果蝇转录因子及其靶标基因的通路注释第42-44页
        3.3.2 同源蛋白寻找同源基因的转录因子第44-46页
    3.4 trx基因表达模式的测定第46页
    3.5 丝腺因子(SGF1)表达谱的测定第46-49页
第4章 基因trx和SGF1的功能验证第49-59页
    4.1 前言第49页
    4.2 实验材料、试剂和设备第49页
        4.2.1 实验材料第49页
        4.2.2 主要试剂和试验仪器第49页
    4.3 实验方法第49-54页
        4.3.0 靶点选择与克隆测序引物设计第49页
        4.3.1 家蚕基因组DNA的提取以及突变检测第49-50页
        4.3.2 sgRNA靶点选择及sgRNA模板获得第50页
        4.3.3 克隆测序第50-51页
        4.3.4 质粒抽提第51页
        4.3.5 体外转录Cas9 mRNA第51-52页
        4.3.6 sgRNA的合成与纯化第52页
        4.3.7 构建质粒第52-54页
        4.3.8 显微注射第54页
    4.4 结果与分析第54-57页
        4.4.1 trx 和 SGF1 的 g RNA 转基因家蚕获得第54-55页
        4.4.2 trx 和 SGF1 的 g RNA 转基因家蚕与表达 Cas9 转基因家蚕杂交第55-57页
    4.5 讨论与展望第57-59页
第5章 茧丝相关基因的时空差异表达比较分析第59-65页
    5.1 前言第59页
    5.2 材料与试剂第59页
        5.2.1 主要实验仪器第59页
        5.2.2 主要试剂第59页
        5.2.3 常用溶液的配制第59页
    5.3 方法第59-60页
        5.3.1 材料准备第59页
        5.3.2 茧层中丝胶含量的比较第59-60页
        5.3.3 家蚕中、后部丝腺总RNA的提取第60页
        5.3.4 反转录反应以及设计cDNA扩增引物第60页
        5.3.5 扩增区片段克隆测序验证第60页
        5.3.6 qRT-PCR技术分析丝腺基因在L10与JS中的表达第60页
    5.4 实验结果与讨论第60-63页
        5.4.1 qRT-PCRPCR的结果分析第60-62页
        5.4.2 丝胶率在L10与JS中的比较第62-63页
    5.5 讨论第63-65页
结论第65-67页
参考文献第67-77页
攻读硕士学位期间发表的学术论文第77-78页
致谢第78页

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