| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-12页 |
| 第一章 综述 | 第12-20页 |
| ·草菇简介 | 第12-13页 |
| ·经济价值 | 第12页 |
| ·营养价值 | 第12页 |
| ·药用价值 | 第12-13页 |
| ·草菇采后生理生化 | 第13-14页 |
| ·呼吸作用 | 第13页 |
| ·酶化学反应 | 第13-14页 |
| ·草菇开伞 | 第14页 |
| ·基因表达谱研究进展 | 第14-16页 |
| ·用基因表达谱研究组织变化和生理代谢 | 第14-15页 |
| ·用表达谱研究疾病 | 第15-16页 |
| ·用表达谱研究肿瘤和癌症 | 第16页 |
| ·数字基因表达谱介绍 | 第16-19页 |
| ·数字基因表达谱原理 | 第17页 |
| ·Solexa 测序技术 | 第17-18页 |
| ·数字基因表达谱分析方法 | 第18-19页 |
| ·研究意义 | 第19-20页 |
| 第二章 不同贮藏期的草菇菌柄的RNA 的提取 | 第20-25页 |
| ·实验材料与方法 | 第20-22页 |
| ·实验菌株 | 第20页 |
| ·培养基 | 第20页 |
| ·原种瓶培养基配方与草菇种植地 | 第20页 |
| ·仪器设备 | 第20页 |
| ·实验技术路线 | 第20页 |
| ·不同时期的草菇菌柄的采摘 | 第20-22页 |
| ·不同时期草菇菌柄RNA 提取方法 | 第22页 |
| ·RNA 样品质量分析 | 第22页 |
| ·结果与讨论 | 第22-25页 |
| 第三章 数字化基因表达谱测序 | 第25-38页 |
| ·实验材料 | 第25页 |
| ·实验设备与试剂 | 第25页 |
| ·实验步骤 | 第25-26页 |
| ·测序结果分析 | 第26-38页 |
| ·测序结果分析路线 | 第26页 |
| ·测序质量评估 | 第26-28页 |
| ·测序饱和度分析 | 第28-30页 |
| ·Clean Tags 分析 | 第30-38页 |
| 第四章 差异表达基因的筛选及分析 | 第38-71页 |
| ·差异表达基因的筛选方法 | 第38-39页 |
| ·差异表达基因的分析 | 第39-66页 |
| ·采后1.5h 与采后0 h 的草菇菌柄表达谱差异分析 | 第39-53页 |
| ·采后伸长期草菇菌柄与采后0h 草菇菌柄的表达谱差异分析 | 第53-63页 |
| ·采后成熟期草菇菌柄与采后0h 草菇菌柄的表达谱差异分析 | 第63-66页 |
| ·聚类分析和特征基因分析 | 第66-71页 |
| ·采后1.5h 的特征基因 | 第67-68页 |
| ·采后成熟期的特征基因 | 第68-71页 |
| 第五章 差异极大的基因分析 | 第71-77页 |
| ·采后1.5h 与采后0h 差异极大的基因分析与讨论 | 第71-73页 |
| ·只在采后0h 菌柄中表达的基因 | 第71页 |
| ·只在采后1.5 h 菌柄中表达的基因 | 第71-72页 |
| ·讨论 | 第72-73页 |
| ·采后伸长期与采后1.5h 差异极大的基因分析与讨论 | 第73-74页 |
| ·只在采后1.5h 表达的基因 | 第73页 |
| ·只在采后伸长期中表达的基因 | 第73-74页 |
| ·讨论 | 第74页 |
| ·采后成熟期与采后伸长期差异极大的基因分析与讨论 | 第74-75页 |
| ·只在采后伸长期表达的基因 | 第74页 |
| ·只在采后成熟期表达的基因 | 第74-75页 |
| ·讨论 | 第75页 |
| ·本章小结 | 第75-77页 |
| 第六章 编码酶活的基因的变化 | 第77-89页 |
| ·编码抗氧化相关酶活的基因的变化 | 第77-82页 |
| ·超氧化物歧化酶 | 第77-79页 |
| ·过氧化物酶 | 第79-81页 |
| ·过氧化氢酶 | 第81-82页 |
| ·编码蛋白酶的基因的变化 | 第82-88页 |
| ·本章小结 | 第88-89页 |
| 第七章 氨基酸代谢分析 | 第89-94页 |
| ·赖氨酸代谢 | 第89-90页 |
| ·苏氨酸代谢 | 第90页 |
| ·甲硫氨酸代谢 | 第90-91页 |
| ·缬氨酸和异亮氨酸代谢 | 第91-92页 |
| ·亮氨酸代谢 | 第92-93页 |
| ·本章小结 | 第93-94页 |
| 参考文献 | 第94-99页 |
| 致谢 | 第99页 |
