| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 缩略语表 | 第13-14页 |
| 1 前言 | 第14-25页 |
| 1.1 高粱、苏丹草以及高丹草的主要性状 | 第14-15页 |
| 1.1.1 高粱的主要农艺性状 | 第14页 |
| 1.1.2 苏丹草的主要农艺性状 | 第14页 |
| 1.1.3 高丹草的杂种优势表现 | 第14-15页 |
| 1.2 高丹草应用前景分析 | 第15-17页 |
| 1.2.1 用于养鱼 | 第16页 |
| 1.2.2 用于养牛、羊、鹿、兔、鹅等 | 第16页 |
| 1.2.3 用于水土保持与治理 | 第16-17页 |
| 1.3 杂种优势概念及其在禾本科作物上的应用 | 第17-18页 |
| 1.3.1 玉米杂种优势 | 第17-18页 |
| 1.3.2 水稻杂种优势 | 第18页 |
| 1.3.3 小麦杂种优势 | 第18页 |
| 1.4 杂种优势机理的遗传假说 | 第18-20页 |
| 1.4.1 显性假说 | 第19页 |
| 1.4.2 超显性假说 | 第19页 |
| 1.4.3 上位性假说 | 第19页 |
| 1.4.4 杂种优势研究的新方向 | 第19-20页 |
| 1.5 杂种优势的研究方法 | 第20-23页 |
| 1.5.1 QTL定位 | 第20页 |
| 1.5.2 转录组学 | 第20-22页 |
| 1.5.3 蛋白组学 | 第22-23页 |
| 1.5.4 表观遗传学 | 第23页 |
| 1.6 本研究的目的与意义 | 第23-25页 |
| 2 高丹草杂种及其亲本叶片基因差异表达研究 | 第25-55页 |
| 2.1 材料与方法 | 第26-32页 |
| 2.1.1 供试材料 | 第26-27页 |
| 2.1.2 田间种植及农艺性状测定 | 第27-28页 |
| 2.1.3 cDNA-AFLP分析和统计 | 第28-31页 |
| 2.1.3.1 总RNA的提取 | 第28页 |
| 2.1.3.2 双链cDNA的合成 | 第28-29页 |
| 2.1.3.3 cDNA-AFLP差异表达分析 | 第29-31页 |
| 2.1.4 分子标记数据处理方法 | 第31页 |
| 2.1.5 TDF的回收及测序 | 第31-32页 |
| 2.1.5.1 差异片段回收及再扩增 | 第31页 |
| 2.1.5.2 再扩增产物的纯化回收 | 第31页 |
| 2.1.5.3 TDF的测序及序列比对 | 第31-32页 |
| 2.1.6 半定量RT-PCR验证 | 第32页 |
| 2.2 结果与分析 | 第32-53页 |
| 2.2.1 杂种优势分析 | 第32-35页 |
| 2.2.2 cDNA-AFLP分析结果 | 第35-38页 |
| 2.2.2.1 总RNA提取质量 | 第35-36页 |
| 2.2.2.2 单链及双链cDNA合成质量 | 第36页 |
| 2.2.2.3 预扩增及选择性扩增产物质量 | 第36-38页 |
| 2.2.3 高丹草杂种及其亲本间的基因表达谱分析 | 第38-42页 |
| 2.2.3.1 基因组间杂种及其亲本间的基因表达谱分析 | 第38-40页 |
| 2.2.3.2 TDF差异展示类型与杂种表现和杂种优势的相关分析 | 第40-41页 |
| 2.2.3.3 单个差异表达的TDF与杂种表现和杂种优势的关系 | 第41-42页 |
| 2.2.4 差异片段的回收、测序与功能预测 | 第42-51页 |
| 2.2.4.1 差异表达基因片段的回收与测序 | 第42-43页 |
| 2.2.4.2 差异表达基因片段的纯化 | 第43页 |
| 2.2.4.3 测序TDF的BLAST结果和功能预测 | 第43-51页 |
| 2.2.5 半定量RT-PCR | 第51-53页 |
| 2.3 小结 | 第53-55页 |
| 2.3.1 高丹草杂种与亲本之间的基因差异表达 | 第53-54页 |
| 2.3.2 差异条带的回收及测序 | 第54页 |
| 2.3.3 半定量RT-PCR | 第54-55页 |
| 3 高丹草杂种及其亲本转录组分析 | 第55-99页 |
| 3.1 材料与方法 | 第56-61页 |
| 3.1.1 植株材料 | 第56页 |
| 3.1.2 样品采集 | 第56页 |
| 3.1.3 mRNA高通量测序 | 第56-57页 |
| 3.1.4 测序数据分析 | 第57-61页 |
| 3.2 试验结果 | 第61-97页 |
| 3.2.1 高丹草及其亲本农艺性状表现 | 第61-62页 |
| 3.2.2 测序数据及其质量控制 | 第62-65页 |
| 3.2.3 转录组数据与参考基因组序列比对 | 第65-68页 |
| 3.2.4 转录组文库质量评估 | 第68-72页 |
| 3.2.5 SNP分析 | 第72-78页 |
| 3.2.6 可变剪接事件预测 | 第78-80页 |
| 3.2.7 新基因分析 | 第80-82页 |
| 3.2.8 差异表达分析 | 第82-96页 |
| 3.2.9 荧光定量PCR验证结果 | 第96-97页 |
| 3.3 小结 | 第97-99页 |
| 4 结论与讨论 | 第99-101页 |
| 4.1 结论 | 第99-100页 |
| 4.2 创新点 | 第100页 |
| 4.3 下一步工作计划 | 第100-101页 |
| 致谢 | 第101-102页 |
| 参考文献 | 第102-117页 |
| 作者简介 | 第117页 |
