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耐丁草胺菌株BUT-6~T的筛选及其多相分类研究

摘要第8-9页
ABSTRACT第9-10页
缩略语表第11-12页
前言第12-13页
第一章 文献综述第13-31页
    1 除草剂丁草胺对环境的影响及研究进展第13-19页
        1.1 丁草胺基本情况第13-14页
            1.1.1 丁草胺简介、化学结构式和系统命名第13页
            1.1.2 丁草胺的理化性质和毒性第13-14页
            1.1.3 丁草胺作用机理和应用范围第14页
        1.2 丁草胺对土壤及水体生态安全的影响第14-15页
        1.3 国内外对丁草胺的微生物降解研究现状第15-16页
        1.4 微生物对有机物的耐受性及微生物催化的研究进展第16-19页
            1.4.1 有机物化合物的毒性和微生物应对机制第16-18页
            1.4.2 耐受高浓度化合物的微生物的应用第18-19页
    2 微生物多相分类法概述第19-23页
        2.1 微生物分类学发展历史第19-20页
        2.2 传统表型特征分类第20-21页
        2.3 细胞化学组成分类第21-22页
            2.3.1 细胞壁化学成分分析第21页
            2.3.2 全细胞脂肪酸分析第21页
            2.3.3 醌组分分析第21页
            2.3.4 极性酯成分分析第21-22页
            2.3.5 全细胞可溶性蛋白及核糖体蛋白电泳图谱分析第22页
        2.4 遗传学鉴定分类第22-23页
            2.4.1 原核生物16S rRNA基因序列分析第22页
            2.4.2 基因组DNA的G+C mol%测定第22-23页
            2.4.3 DNA-DNA杂交第23页
    3 总结与展望第23-25页
    参考文献第25-31页
第二章 耐丁草胺的菌株BUT-6~T的筛选分离第31-45页
    1 材料与方法第31-36页
        1.1 土壤样品、培养基、试剂和实验设备第31-32页
            1.1.1 土壤样品第31页
            1.1.2 材料和试剂第31页
            1.1.3 培养基第31-32页
            1.1.4 实验设备第32页
        1.2 菌株分离过程第32页
        1.3 菌株生长特性第32-33页
        1.4 菌株16S rRNA序列的测定第33-36页
            1.4.1 基因组DNA的提取方法第33页
            1.4.2 PCR扩增16S rRNA序列并纯化第33-35页
            1.4.3 PCR回收产物的T-A克隆测序第35-36页
        1.5 菌株系统发育关系的研究第36页
    2 结果与分析第36-41页
        2.1 分离污泥样品中耐受丁草胺的菌株第36-37页
        2.2 菌株BUT-6~T 的生长特性第37页
        2.3 菌株BUT-6~T 16S rRNA核酸序列扩增第37-38页
        2.4 菌株BUT-6~T的系统发育分析第38-41页
    3 本章小结第41-43页
    参考文献第43-45页
第三章 耐丁草胺的菌株BUT-6~T的分类地位研究第45-75页
    1 材料与方法第45-57页
        1.1 供试菌株第45页
        1.2 试剂和培养基第45-46页
        1.3 实验设备第46页
        1.4 菌株表型特征分析第46-49页
            1.4.1 菌落形态学特征第46页
            1.4.2 单细胞形态特征第46页
            1.4.3 革兰氏染色第46页
            1.4.4 芽胞染色第46-47页
            1.4.5 鞭毛染色第47页
            1.4.6 菌株的运动性观察第47页
            1.4.7 菌株API检测分析第47-48页
            1.4.8 其他生理生化参数分析第48-49页
        1.5 菌株化学成分分析第49-50页
            1.5.1 细胞脂肪酸分析第49页
            1.5.2 呼吸醌组成分析第49-50页
            1.5.3 极性脂组成分析第50页
            1.5.4 细胞壁氨基酸类型分析第50页
            1.5.5 细菌类胡萝卜素检测第50页
        1.6 菌株基因特征分析第50-57页
            1.6.1 16S rRNA基因序列、系统进化关系的分析第50-51页
            1.6.2 基因组G+C mol%的测定第51页
            1.6.3 DNA-DNA杂交第51-57页
    2 结果与分析第57-70页
        2.1 菌株表型特征分析第57-62页
            2.1.1 BUT-6~T菌落及细胞形态第57页
            2.1.2 BUT-6~T和T.aquaticus PYM5-11~TAPI系统测定结果比较第57-61页
            2.1.3 其他生理生化分析结果第61页
            2.1.4 BUT-6~T与T.aquaticus PYM5-11~T总体表观差异第61-62页
        2.2 菌株BUT-6~T化学分类特征分析结果第62-66页
            2.2.1 菌株脂肪酸组成第62-64页
            2.2.2 菌株醌组分第64-65页
            2.2.3 菌株极性脂组分第65页
            2.2.4 细胞壁氨基酸类型第65-66页
            2.2.5 菌株类胡萝卜素检测结果第66页
        2.3 菌株基因特征分析结果第66-70页
            2.3.1 16S rRNA基因序列和系统进化关系第66页
            2.3.2 菌株总DNA G+Cmol%第66-67页
            2.3.3 DNA-DNA杂交同源性结果第67-70页
    3 本章小结第70-73页
    参考文献第73-75页
全文总结第75-77页
论文创新点第77-79页
附录一 培养基及试剂第79-83页
附录二 抗生素药敏纸片名称和浓度第83-85页
附录三 API 50CH成分第85-87页
附录四 APIID 32GN成分第87-89页
附录五 16S rRNA核酸序列第89-91页
附录六 发表论文第91-93页
致谢第93页

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