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烟草雌、雄配子和早期胚胎的转录谱研究

摘要第1-8页
ABSTRACT第8-11页
缩写符号第11-16页
1 前言第16-37页
   ·植物雌雄配子的表达谱研究第16-26页
     ·植物精细胞研究进展第16-21页
     ·受精前卵细胞中的基因表达研究第21-24页
     ·植物雌配子体对胚胎和胚乳早期发育的影响第24-26页
   ·早期胚胎发生中表达的基因第26-28页
   ·胚胎发生由母本基因控制到合子基因控制的转换第28-31页
     ·动物中对MZT的研究第28-30页
     ·被子植物中MZT的研究第30-31页
   ·少量材料的cDNA扩增第31-34页
   ·构建全长cDNA文库的意义和技术第34-36页
   ·本论文的基础、研究目的及意义第36-37页
2 精细胞,卵细胞,合子和二胞原胚CDNA文库构建第37-56页
   ·引言第37-38页
   ·植物材料、试剂与仪器第38-39页
     ·植物材料第38页
     ·主要试剂、仪器第38-39页
   ·实验方法与步骤第39-46页
     ·烟草精细胞、卵细胞、合子和二胞原胚的分离第39-40页
     ·mRNA的提取第40页
     ·逆转录第40-41页
     ·LD-PCR扩增cDNA第41-42页
     ·蛋白酶K消化第42页
     ·Sfi Ⅰ酶切第42-43页
     ·酶切后cDNA片段的分级分离第43页
     ·与λ TriplEx2载体连接第43-44页
     ·包装菌种的准备第44页
     ·文库包装第44页
     ·滴定文库第44-45页
     ·重组效率的鉴定第45页
     ·PCR鉴定文库中插入片断的长度第45-46页
   ·结果与分析第46-54页
     ·细胞的分离第46页
     ·烟草精细胞文库构建结果cDNA扩增第46-48页
       ·cDNA扩增第46-47页
       ·cDNA的分级分离第47页
       ·文库滴度,插入片断长度与重组率鉴定第47-48页
     ·烟草卵细胞文库构建结果第48-50页
       ·cDNA扩增第48-49页
       ·cDNA的分级分离第49页
       ·文库滴度,插入片断长度与重组率鉴定第49-50页
     ·烟草合子cDNA文库构建结果第50-52页
       ·cDNA扩增第50-51页
       ·cDNA的分级分离第51-52页
       ·文库滴度,插入片断长度与重组率鉴定第52页
     ·烟草二胞原胚cDNA文库构建结果第52-54页
       ·cDNA扩增第52-53页
       ·cDNA的分级分离第53页
       ·文库滴度,插入片断长度与重组率鉴定第53-54页
   ·讨论第54-56页
3 CDNA文库测序及生物信息学分析第56-71页
   ·引言第56页
   ·材料、试剂与仪器第56-57页
   ·实验方法与步骤第57页
     ·将噬菌体转化为pTriplEx2质粒第57页
     ·随机挑选克隆测序第57页
   ·序列的生物信息学分析及结果第57-67页
     ·EST数据的生物信息学分析流程第57-58页
     ·EST整体分析结果第58-61页
     ·精细胞文库中EST分析第61-63页
     ·卵细胞文库EST分析第63-64页
     ·合子文库EST分析第64-66页
     ·二胞原胚EST分析第66-67页
   ·讨论第67-71页
     ·精细胞转录谱的特点第67-68页
     ·卵细胞转录谱的特点第68-69页
     ·受精前后从卵细胞到合子和二胞原胚的过程中转录谱的变化第69-71页
4 RT-PCR验证部分EST在烟草中的表达模式第71-87页
   ·引言第71页
   ·材料、试剂与仪器第71-72页
     ·植物材料第71页
     ·试剂与仪器第71-72页
   ·实验方法与步骤第72-76页
     ·烟草精细胞、卵细胞、合子和二胞原胚cDNA的扩增第72-74页
       ·烟草精细胞、卵细胞、合子和二胞原胚的分离第72页
       ·烟草精细胞,卵细胞,合子和二胞原胚mRNA提取第72页
       ·分离细胞的cDNA SUPER-SMART扩增第72-74页
     ·烟草雌蕊、花药、茎尖、叶、根cDNA的制备第74-76页
       ·RNA提取第74-75页
       ·RNA乙二醛变性胶电泳第75页
       ·DNase处理去除RNA样品中的DNA第75页
       ·逆转录获得cDNA第75-76页
     ·RT-PCR检测各个文库中部分EST的表达模式第76页
   ·实验结果第76-83页
     ·烟草雌蕊、花药、茎尖、叶、根RNA提取结果第76-77页
     ·House-keeping基因调整PCR条件第77页
     ·烟草精细胞文库中部分contig的表达模式第77-79页
     ·烟草卵细胞文库中部分contig的表达模式第79-81页
     ·烟草合子文库中部分contig的表达模式第81-82页
     ·烟草二胞原胚文库中部分contig的表达模式第82-83页
   ·讨论第83-87页
     ·烟草精细胞中存在大量优势表达的基因第83页
     ·早期胚胎发生过程中母本控制到合子控制的转换(MZT)第83-85页
       ·卵细胞中部分优势表达的基因在受精后降解第83-84页
       ·合子中存在受精后新转录产生的转录本第84-85页
     ·二胞原胚中未发现分裂后产生的新基因第85-87页
5 合子优势表达基因的克隆和表达模式研究第87-106页
   ·引言第87-88页
   ·实验材料,试剂和仪器第88-89页
   ·RACE扩增合子新转录基因的5’端第89-94页
     ·烟草5'RACE cDNA POOL构建第89-90页
       ·RNA提取第89页
       ·5'RACE cDNA pool的制备第89-90页
     ·目的基因cDNA 5'端序列的获得第90-94页
   ·Genome walking获得NtDynamin基因的启动子第94-98页
     ·烟草Genome walking文库的构建第94-96页
       ·烟草基因组提取第94-95页
       ·基因组的质量检测第95页
       ·酶切基因组DNA第95页
       ·纯化酶切后的DNA第95-96页
       ·将接头连接至基因组DNA第96页
     ·Dynamin基因的启动子的获得第96-98页
   ·Dynamin启动子分析第98-101页
     ·启动子融合报告基因(GFP和GUS)载体的构建第98-99页
     ·拟南芥浸花法转基因和烟草叶盘法转基因第99-101页
       ·农杆菌电击感受态的制备及电击转化第99页
       ·农杆菌的制备第99-100页
       ·拟南芥浸花法转基因第100页
       ·烟草无菌叶的制备及与农杆菌共培养第100页
       ·烟草转化叶片的筛选,抗性苗的切取和生根筛选第100-101页
       ·确定烟草阳性植株,转入土中培养第101页
       ·GUS染色方法第101页
   ·实验结果与分析第101-104页
     ·5'-RACE结果第101-102页
     ·Genome walking得到NtDynamin基因启动子第102页
     ·NtDynamin启动子在拟南芥的表达模式第102-104页
   ·讨论第104-106页
6 总讨论第106-109页
在读期间发表与投稿论文第109-110页
参考文献第110-121页
致谢第121页

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