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Agrobacterium tumefaciens GW4加砷条件下的比较蛋白质组学研究

目录第1-7页
摘要第7-9页
Abstract第9-11页
缩略语表第11-12页
1 前言第12-26页
   ·砷与砷污染第12-13页
     ·砷及其化合物第12页
     ·砷的毒性与砷污染第12-13页
   ·微生物砷抗性机制研究进展第13-16页
     ·微生物砷氧化第13-15页
       ·As(Ⅲ)氧化分子机制第13-15页
       ·As(Ⅲ)氧化和反硝化偶联供能第15页
     ·细胞质As(Ⅴ)还原第15页
     ·呼吸性As(Ⅴ)还原第15-16页
     ·As(Ⅲ)甲基化第16页
   ·砷与磷代谢第16-18页
     ·微生物磷运输系统第16-17页
     ·微生物砷与磷代谢的关系第17-18页
   ·土壤杆菌属(Agrobacterium)研究概况第18页
   ·蛋白质组学研究进展第18-25页
     ·基因组、转录组和蛋白质组之间的关系第18-20页
       ·蛋白质组学第18-19页
       ·转录组和蛋白质组学第19页
       ·代谢组和蛋白质组学第19-20页
     ·蛋白质组学的研究范畴第20页
     ·蛋白质组学的研究策略第20-21页
     ·蛋白质组分析技术第21-24页
       ·依赖于分离的方法第21-23页
       ·不依赖于分离的方法第23-24页
     ·微生物蛋白质组学第24-25页
       ·加砷条件下的微生物蛋白质组学研究第24-25页
   ·课题的立题背景及研究目的第25-26页
2 材料与方法第26-39页
   ·实验材料第26-27页
     ·菌株的来源第26页
     ·培养基配制及主要的成分第26页
     ·抗生素及砷氧化曲线测定所用试剂第26-27页
     ·引物第27页
   ·试剂和仪器第27-30页
     ·主要试剂第27-28页
     ·主要试剂的配制第28-29页
       ·双向电泳试剂配方第28-29页
       ·SDS-PAGE所用溶液第29页
     ·常用仪器第29-30页
   ·实验方法第30-39页
     ·DNA操作的方法第30页
       ·细菌总DNA的提取第30页
       ·PCR扩增第30页
     ·TAS-990原子吸收分光光度计及操作规程第30-32页
     ·生长曲线的测定第32页
     ·砷氧化曲线的测定第32页
     ·双向电泳实验操作第32-35页
       ·双向电泳样品制备第32页
       ·蛋白定量(Bradford法)第32-33页
       ·等电聚焦第33-34页
       ·SDS-PAGE第34页
       ·硝酸银染色(质谱兼容)第34-35页
       ·考马斯亮蓝染色(改良版Neuhoff CCB)第35页
     ·图像扫描及分析第35页
     ·A. tumefaciens GW4总RNA的提取第35-36页
     ·实时荧光定量PCR(real-time PCR)第36-39页
       ·RNA的定量及质量检测第36页
       ·RNA样品中DNA的消化第36页
       ·RNA的反转录PCR第36-37页
       ·实时荧光定量PCR反应第37-39页
3 结果与讨论第39-58页
   ·A.tumefaciens GW4菌株的蛋白质组学研究第39-41页
     ·双向电泳材料的选取第39页
     ·生长曲线及砷氧化曲线的建立第39-41页
   ·理论蛋白质图谱分析第41-42页
   ·双向电泳图谱建立第42-46页
   ·差异蛋白的质谱鉴定第46-47页
   ·差异蛋白功能分析第47-48页
   ·碳水化合物代谢相关蛋白变化分析第48-50页
     ·TCA循环第49-50页
     ·丙酮酸的去向第50页
   ·氨基酸代谢相关蛋白变化分析第50-51页
   ·砷磷相关蛋白变化分析第51-58页
     ·As(Ⅴ)还原酶ArsC第53页
     ·钼喋呤生物合成蛋白MoeA第53-54页
     ·FAD依赖的嘧啶核苷酸二硫化物氧化还原酶第54-55页
     ·硫酸盐ABC转运子底物结合蛋白Sbp第55-56页
     ·砷和磷运输相关蛋白第56-58页
4 总结第58-59页
参考文献第59-66页
致谢第66-67页
附录第67-68页

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