| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-11页 |
| 第一章 绪论 | 第11-17页 |
| ·研究背景及研究意义 | 第11-12页 |
| ·研究背景 | 第11页 |
| ·研究意义 | 第11-12页 |
| ·研究现状 | 第12-15页 |
| ·基因表达数据分析的研究现状 | 第12-13页 |
| ·基因调控网络研究 | 第13页 |
| ·再生核希尔伯特空间条件独立性研究现状 | 第13-15页 |
| ·论文的主要内容及安排 | 第15-17页 |
| ·论文的主要内容 | 第15-16页 |
| ·论文的主要安排 | 第16-17页 |
| 第二章 核方法介绍 | 第17-22页 |
| ·引言 | 第17页 |
| ·内积和半正定矩阵 | 第17-18页 |
| ·希尔伯特空间及其性质 | 第17-18页 |
| ·Gram 矩阵 | 第18页 |
| ·再生核希尔伯特空间介绍 | 第18-21页 |
| ·本章小结 | 第21-22页 |
| 第三章 RKHS 上的协方差算子与独立性、条件独立性 | 第22-36页 |
| ·引言 | 第22页 |
| ·RKHS 上的（互）协方差算子 | 第22-24页 |
| ·协方差算子与条件独立性 | 第24-25页 |
| ·条件独立性问题 | 第24页 |
| ·条件（互）协方差算子 | 第24-25页 |
| ·条件独立性与降维 | 第25-27页 |
| ·基于样本的估计量 | 第27-31页 |
| ·基于样本的条件协方差算子 | 第27-28页 |
| ·Gram 矩阵表示 | 第28-29页 |
| ·协方差算子的度量 | 第29-31页 |
| ·仿真实验 | 第31-35页 |
| ·基本实验 | 第31-34页 |
| ·扩展实验 | 第34-35页 |
| ·本章小结 | 第35-36页 |
| 第四章 基于 HILBERT-SCHMIDT 范数的统计独立性度量 | 第36-56页 |
| ·引言 | 第36页 |
| ·知识准备 | 第36-38页 |
| ·HILBERT-SCHMIDT 独立性准则 | 第38-41页 |
| ·Hilbert-Schmidt 独立性准则的概念 | 第38-39页 |
| ·经验准则 | 第39-41页 |
| ·使用 HSIC 的独立性检验 | 第41-49页 |
| ·独立性检验 | 第41-43页 |
| ·基于 HSIC 的独立性检验的实验 | 第43-49页 |
| ·条件独立性度量 | 第49-55页 |
| ·条件协方差的知识回顾 | 第49-50页 |
| ·基于 RKHS 的条件独立性描述 | 第50-55页 |
| ·本章小结 | 第55-56页 |
| 第五章 基于核方法的时间序列因果性推断 | 第56-69页 |
| ·引言 | 第56页 |
| ·时间序列数据的因果性推断算法 | 第56-61页 |
| ·Granger 因果性 | 第56-57页 |
| ·Granger 因果性的推广--基于核方法的时间序列因果性推断 | 第57-58页 |
| ·实验测试 | 第58-61页 |
| ·基于条件独立性检验的系统辨识 | 第61-68页 |
| ·系统辨识方法 | 第61-65页 |
| ·实验测试 | 第65-68页 |
| ·本章小结 | 第68-69页 |
| 第六章 基于统计独立性方法的基因调控网络结构辨识 | 第69-77页 |
| ·引言 | 第69页 |
| ·数据与方法 | 第69-71页 |
| ·问题和数据描述 | 第69-70页 |
| ·基于 HSIC 的生物系统结构辨识方法 | 第70-71页 |
| ·实验设计 | 第71-73页 |
| ·基因调控关系的辨识步骤 | 第71-72页 |
| ·辨识结果的合并 | 第72页 |
| ·评价标准 | 第72-73页 |
| ·结果分析 | 第73-75页 |
| ·结果的准确性分析----统计分析 | 第73-75页 |
| ·计算效率分析 | 第75页 |
| ·本章小结 | 第75-77页 |
| 第七章 总结与展望 | 第77-79页 |
| ·总结 | 第77-78页 |
| ·展望 | 第78-79页 |
| 致谢 | 第79-80页 |
| 参考文献 | 第80-84页 |
| 附录 | 第84-85页 |
