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马铃薯晚疫病菌miRNA分析及Dicer基因功能研究

摘要第1-8页
ABSTRACT第8-11页
一、前言第11-28页
 (一) 马铃薯生产和晚疫病第11-17页
  1. 我国马铃薯生产现状第11页
  2. 马铃薯晚疫病第11-12页
   ·马铃薯晚疫病的起源、流行及危害第11-12页
   ·P.infestans群体结构第12页
  3. 马铃薯晚疫病防治第12-14页
   ·马铃薯抗病育种研究第12-13页
   ·化学防治第13页
   ·生物防治第13-14页
  4. P.infestans的侵染循环第14-17页
 (二) 马铃薯晚疫病菌第17-22页
  1. P.infestans分类地位第17页
  2. P.infestans形态结构第17-19页
  3. 卵菌与真菌的区别第19-20页
  4. P.infestans生理特征第20-21页
  5. P.infestans生殖方式第21-22页
 (三) P.infestans的基因组测序第22-23页
 (四) 非编码RNA的调控作用第23-27页
 (五) 研究内容和意义第27-28页
二、实验材料和方法第28-44页
 (一) 样品的采集第28-30页
 (二) P.infestans分离及保存第30-31页
  1. 组织分离第30页
  2. 单孢分离第30页
  3. 菌种保存第30-31页
 (三) P.infestans最适生长条件测定第31-32页
 (四) 不同发育阶段菌体的培养第32-33页
 (五) P.infestans致病力测定第33-36页
  1. 马铃薯植株准备第33页
  2. 播种及接种第33-34页
  3. 统计马铃薯植株叶片发病指数第34-36页
 (六) P.infestans小RNA深度测序第36-41页
  1. 样品收集第36-37页
  2. RNA提取及浓度检测第37页
  3. 小RNA测序流程第37-41页
 (七) 利用体外siRNA饲喂沉默DCL1和DCL2第41-42页
 (八) Stem-loop Q-PCR实验第42-44页
三、实验结果第44-67页
 (一) P.infestans不同生长阶段菌体的收集以及RNA的分离第44-46页
 (二) 小RNA测序结果第46-63页
  1. 序列文库制备和数据分析第46-50页
  2. 小RNA在P.infestans染色体上的分布情况第50-53页
  3. 预测已知保守的miRNA和新的miRNA第53-58页
  4. miRNA和相应靶基因功能的识别第58-60页
  5. 调节ABC转运蛋白基因的miRNA第60-63页
 (三) 孢子囊芽管的萌发和生长需要Dicer1(DCL1)的功能第63-67页
四、讨论第67-70页
参考文献第70-78页
附录1 培养基配方第78-81页
附录2 甲醛变性胶配方第81-82页
附录3 小RNA测序相关试剂,仪器第82-84页
附录4 文中涉及的miRNA序列信息第84-86页
致谢第86-87页
附图第87-94页

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