| 摘要 | 第1-8页 |
| ABSTRACT | 第8-16页 |
| 第一章 文献综述 | 第16-37页 |
| ·本研究候选基因研究进展 | 第16-32页 |
| ·神经肽Y（NPY） | 第16-17页 |
| ·刺鼠相关蛋白（AGRP） | 第17-21页 |
| ·可卡因－安非他明转录体（CART） | 第21-23页 |
| ·阿片-黑素皮质素原（POMC） | 第23-25页 |
| ·黒素皮质素受体基因（MCR）的研究 | 第25-27页 |
| ·Ghrelin | 第27-29页 |
| ·单胺系统 | 第29-32页 |
| ·家畜分子遗传标记技术 | 第32-35页 |
| ·问题与展望 | 第35-37页 |
| 第二章 材料与方法 | 第37-50页 |
| ·试验材料 | 第37-40页 |
| ·试验动物样本来源 | 第37页 |
| ·试验数据的收集 | 第37页 |
| ·试验主要试剂 | 第37-38页 |
| ·溶液与缓冲液 | 第38页 |
| ·仪器设备 | 第38-39页 |
| ·主要试剂和溶液的配制 | 第39-40页 |
| ·试验方法 | 第40-48页 |
| ·血样的采集 | 第40页 |
| ·牛全血基因组DNA 的提取 | 第40-41页 |
| ·PCR 反应所用引物的设计 | 第41-44页 |
| ·DNA 质量的检测、纯化及浓度计算 | 第44-46页 |
| ·扩增产物的PCR-RFLP 分析 | 第46页 |
| ·图像分析 | 第46页 |
| ·扩增产物的PCR-SSCP 分析 | 第46-47页 |
| ·测序 | 第47-48页 |
| ·资料的统计与分析 | 第48-50页 |
| ·基因频率和基因型频率的计算 | 第48页 |
| ·基因频率和基因型频率的差异显著性检验（χ~2 独立性检验） | 第48页 |
| ·位点遗传纯合度（Ho）、杂合度（He）和有效等位基因数（Ne） | 第48页 |
| ·多态信息含量（polymorphism information content, PIC） | 第48-49页 |
| ·单倍型分析（haplotype analysis） | 第49页 |
| ·相关分析统计模型 | 第49-50页 |
| 第三章 候选基因遗传变异检测 | 第50-61页 |
| ·牛基因组DNA 样品的检测 | 第50页 |
| ·AGRP 基因SNP 检测 | 第50-52页 |
| ·PCR 扩增结果 | 第50-51页 |
| ·PCR-SSCP 结果 | 第51页 |
| ·A2 MspI 限制性酶切结果 | 第51-52页 |
| ·CART 基因SNP 检测 | 第52-53页 |
| ·PCR 扩增结果 | 第52页 |
| ·PCR-SSCP 结果 | 第52-53页 |
| ·POMC 基因SNP 检测 | 第53页 |
| ·PCR 扩增结果 | 第53页 |
| ·PCR-SSCP 结果 | 第53页 |
| ·MC3R 基因SNP 检测 | 第53-55页 |
| ·PCR 扩增结果 | 第53-54页 |
| ·PCR-SSCP 结果 | 第54-55页 |
| ·MC4R 基因SNP 检测 | 第55-57页 |
| ·PCR 扩增结果 | 第55-56页 |
| ·PCR-SSCP 结果 | 第56页 |
| ·PCR-RFLP 结果 | 第56-57页 |
| ·Ghrelin 基因SNP 检测 | 第57-58页 |
| ·PCR 扩增结果 | 第57页 |
| ·PCR-SSCP 结果 | 第57-58页 |
| ·HTR1B 基因 SNP 检测 | 第58-59页 |
| ·PCR 扩增结果 | 第58-59页 |
| ·PCR-SSCP 结果 | 第59页 |
| ·HTR2A 基因遗传变异检测 | 第59-61页 |
| ·PCR 扩增结果 | 第59-60页 |
| ·PCR-SSCP 结果 | 第60-61页 |
| 第四章 候选基因多态基因座的群体遗传学分析 | 第61-81页 |
| ·AGRP 基因群体遗传结构分析 | 第61-63页 |
| ·A0 基因座 | 第61-62页 |
| ·A2 基因座 | 第62-63页 |
| ·AGRP 基因单倍型频率 | 第63页 |
| ·CART 基因群体遗传结构分析 | 第63-68页 |
| ·C1 基因座 | 第63-65页 |
| ·C2 基因座 | 第65-66页 |
| ·C3 基因座 | 第66-67页 |
| ·C4 基因座 | 第67-68页 |
| ·POMC 基因群体遗传结构分析 | 第68-70页 |
| ·MC3R 基因群体遗传结构分析 | 第70-75页 |
| ·MC3R1 基因座 | 第70-72页 |
| ·MC3R2 基因座 | 第72-73页 |
| ·MC3R3 基因座 | 第73-74页 |
| ·MC3R 基因单倍型分析 | 第74-75页 |
| ·MC4R 基因群体遗传结构分析 | 第75-77页 |
| ·MC4R4 基因座 | 第75页 |
| ·MC4R5 基因座 | 第75-77页 |
| ·MC4R 基因单倍型分析 | 第77页 |
| ·Ghrelin 基因群体遗传结构分析 | 第77-78页 |
| ·HTR1B 基因群体遗传结构分析 | 第78-81页 |
| 第五章 候选基因多态性与南阳牛、秦川牛和郏县红牛生长性状相关分析 | 第81-99页 |
| ·南阳牛群体内各基因多态基因座与生长性状的相关分析 | 第81-90页 |
| ·南阳牛群体内AGRP 基因多态基因座与生长性状的相关分析 | 第81页 |
| ·南阳牛群体内CART 基因多态基因座与生长性状的相关分析 | 第81-84页 |
| ·南阳牛群体内POMC 基因多态基因座与生长发育性状的分析 | 第84-85页 |
| ·南阳牛群体内MC3R 基因多态基因座与生长性状的相关分析 | 第85-87页 |
| ·南阳牛群体内MC4R 基因多态基因座与生长性状的相关分析 | 第87-90页 |
| ·南阳牛群体内Ghrelin 基因多态基因座与生长性状的相关分析 | 第90页 |
| ·秦川牛群体内各基因多态基因座与生长性状的相关分析 | 第90-96页 |
| ·秦川牛群体内AGRP 基因多态基因座与生长性状的相关分析 | 第90-91页 |
| ·秦川牛群体内POMC 基因多态基因座与生长性状的相关分析 | 第91-92页 |
| ·秦川牛群体内CART 基因多态基因座与生长性状的相关分析 | 第92-94页 |
| ·秦川牛群体内MC3R 基因多态基因座与生长性状的相关分析 | 第94-95页 |
| ·秦川牛群体内MC4R 基因多态基因座与生长性状的相关分析 | 第95-96页 |
| ·秦川牛群体内Ghrelin 基因多态基因座与生长性状的相关分析 | 第96页 |
| ·郏县红牛群体内基因多态性与生长性状的相关分析 | 第96-99页 |
| ·郏县红牛群体内POMC 基因多态基因座与生长性状的相关分析 | 第96-97页 |
| ·郟县红牛群体内MC4R 基因多态基因座与生长性状的相关分析 | 第97-98页 |
| ·郏县红牛群体内Ghrelin 基因多态基因座与生长性状的相关分析 | 第98-99页 |
| 第六章 讨论与结论 | 第99-107页 |
| ·讨论 | 第99-105页 |
| ·聚丙烯酰胺凝胶中DNA 的染色方法 | 第99页 |
| ·AGRP 基因多态性及其与生长性状相关分析 | 第99-100页 |
| ·CART 基因多态性及其与生长性状相关分析 | 第100-101页 |
| ·POMC 基因多态性及其与生长性状相关分析 | 第101-102页 |
| ·MC3R 多态性及其与生长性状相关分析 | 第102页 |
| ·MC4R 基因多态性及其与生长性状相关分析 | 第102-103页 |
| ·Ghrelin 基因多态性及其与生长性状相关分析 | 第103-104页 |
| ·HTR1B 基因多态性及其与生长性状相关分析 | 第104-105页 |
| ·结论 | 第105-106页 |
| ·本研究创新点 | 第106-107页 |
| 参考文献 | 第107-122页 |
| 致谢 | 第122-123页 |
| 作者简介 | 第123-124页 |
