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玉米大斑病菌MAPK级联途径中STK2基因的功能研究

摘要第1-5页
Abstract第5-11页
1 引言第11-14页
2 材料和方法第14-35页
   ·试验材料第14-17页
     ·菌株和质粒第14页
     ·主要试剂第14页
     ·供试培养基及试剂配制第14-16页
     ·主要仪器第16-17页
   ·玉米大斑病菌STK2 基因侧翼序列的获得第17-21页
     ·玉米大斑病菌基因组DNA 的提取第17页
     ·模板DNA 的制备和引物的设计第17-18页
     ·Genome walking PCR 扩增第18-19页
     ·DNA 片段的纯化第19页
     ·PCR 产物与pMD18-T 载体的连接第19页
     ·大肠杆菌感受态细胞的制备第19-20页
     ·连接产物转化感受态细胞第20页
     ·PCR 验证阳性克隆第20页
     ·碱裂解法小量提取质粒第20-21页
     ·质粒样本测序分析第21页
   ·基因的拼结及结构预测分析第21页
   ·STK2 基因编码蛋白的结构预测分析第21页
   ·STK2 基因敲除转化子的获得第21-26页
     ·STK2 同源重组载体的构建第21-23页
     ·重组基因片段的制备第23页
     ·原生质体的制备第23-24页
     ·原生质体的纯化第24页
     ·原生质体的活力测定及释放方式观察第24页
     ·原生质体转化第24页
     ·原生质体的再生第24页
     ·转化子的筛选第24-25页
     ·转化子基因组DNA 的提取第25页
     ·转化子的PCR 筛选第25-26页
   ·STK2 基因敲除转化子的Southern 验证第26-27页
     ·探针制备第26页
     ·限制性内切酶酶切基因组第26页
     ·电转移第26页
     ·Southern Blot第26-27页
     ·免疫检测第27页
   ·玉米大斑病菌STK2 基因敲除突变体Δstk2 的生物学性状分析第27-29页
     ·Δstk2 突变菌株菌落形态的观察、菌丝形态的显微观察和菌落生长速度 测定第27页
     ·Δstk2 突变菌株产毒力的测定第27-28页
     ·Δstk2 突变菌株致病力测定第28页
     ·Δstk2 突变菌株的组织病理学观察第28页
     ·Δstk2 突变体菌株的漆酶活性检测第28页
     ·Δstk2 突变菌株高渗条件下菌丝形态的显微观察第28-29页
   ·STK2 基因在毕赤酵母中的表达第29-33页
     ·病菌基因组RNA 的提取第29页
     ·反转录体系及第一链cDNA 的合成第29-30页
     ·真核表达载体的构建第30页
     ·重组质粒的线性化第30-31页
     ·电击法转化毕赤酵母第31页
     ·PEG 介导法转化毕赤酵母第31页
     ·筛选G418 抗性菌株第31-32页
     ·PCR 法验证重组转化子第32页
     ·重组基因在酵母中的小量诱导表达第32页
     ·浓缩沉淀蛋白质第32-33页
     ·SDS-PAGE第33页
   ·玉米大斑病菌STKK2 基因片段的克隆第33-34页
     ·引物设计第33页
     ·STKK2 同源片段的扩增第33页
     ·STKK2 同源片段的延伸第33-34页
     ·扩增产物的克隆、测序、同源性分析第34页
   ·玉米大斑病菌STKK2 基因片段的生物信息学分析第34页
   ·玉米大斑病菌STKKK2 基因的拷贝数分析第34-35页
     ·探针制备第34页
     ·基因组酶切第34页
     ·转膜、杂交、免疫检测第34-35页
3 结果与分析第35-71页
   ·STK2 基因侧翼序列的获得第35-38页
   ·STK2 基因启动子区分析第38-42页
     ·CpG 岛预测第40页
     ·内含子/外显子剪切位点识别第40-42页
   ·STK2 基因编码蛋白质的一级结构分析第42-44页
     ·蛋白质理化性质分析第42页
     ·STK2 基因的信号肽预测第42-43页
     ·STK2 基因跨膜结构域的预测第43页
     ·玉米大斑病菌STK2 基因编码氨基酸序列疏水性/亲水性分析第43-44页
     ·玉米大斑病菌STK2 基因编码氨基酸序列的磷酸化位点分析第44页
   ·STK2 基因编码蛋白质的二级结构分析第44-45页
   ·STK2 基因编码蛋白质的保守结构域分析第45-46页
   ·STK2 基因编码蛋白质的三级结构分析第46-49页
   ·STK2 基因编码蛋白质同源性分析第49页
   ·STK2 的同源重组第49-60页
     ·STK2 基因同源重组载体构建及验证第49-51页
     ·重组DNA 片段的PCR 扩增第51-52页
     ·玉米大斑病菌原生质体活力的测定第52页
     ·原生质体的释放方式的观察第52-53页
     ·玉米大斑病菌对潮霉素敏感性测定第53-54页
     ·STK2 基因同源重组载体转化第54页
     ·STK2 基因同源重组转化子筛选与鉴定第54-55页
     ·Δstk2 突变菌株性状观察第55-56页
     ·Δstk2 突变菌株的生长速度确定第56-57页
     ·Δstk2 突变菌株的组织病理学试验第57-58页
     ·Δstk2 突变菌株在洋葱表皮上附着胞诱导第58页
     ·Δstk2 突变菌株粗毒素生物学活性的测定第58-59页
     ·Δstk2 突变菌株的致病力第59页
     ·Δstk2 突变体菌株高渗胁迫下的生长形态第59-60页
   ·STK2 基因在毕赤酵母中的表达第60-64页
     ·真核表达载体的构建第60-61页
     ·MD 筛选转化子第61页
     ·YPD-G418 筛选高拷贝转化子第61-62页
     ·PCR 鉴定重组转化子第62页
     ·SDS-PAGE 电泳第62-64页
   ·STKK2 基因片段的克隆及生物信息学的初步分析第64-71页
     ·STKK2 基因同源片段的获得第64-65页
     ·STKK2 基因同源片段的延伸第65-67页
     ·STKK2 基因的ORF 预测第67-68页
     ·STKK2 基因转录终止信号预测分析第68页
     ·STKK2 基因保守结构域分析第68-69页
     ·STKK2 基因编码蛋白质的三级结构分析第69页
     ·STKK2 基因的同源进化分析第69-70页
     ·Southern blot 验证STKK2 基因的拷贝数第70-71页
4 讨论第71-74页
   ·原生质体转化技术第71页
   ·Genome walking 技术获得已知基因片段的侧翼序列第71-72页
   ·STK2 基因在酵母中的表达第72-73页
   ·STK2 基因敲除突变体的研究第73-74页
5 结论第74-75页
参考文献第75-81页
在读期间发表的学术论文第81-82页
作者简历第82-83页
致谢第83页

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