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A型流感病毒NS1抑制剂的计算机辅助设计

摘要第1-7页
Abstract第7-13页
第一章 引言第13-24页
   ·抗A 型流感病毒药物作用靶点第13-19页
     ·M2 蛋白靶点第13-14页
     ·NA 蛋白靶点第14页
     ·NP 蛋白靶点第14-15页
     ·HA 蛋白靶点第15页
     ·RdRp 靶点第15-16页
     ·NS1A 蛋白靶点第16-19页
       ·NS1A 结构特征第17-18页
       ·NS1A 与dsRNA 的结合模式第18-19页
   ·计算机辅助药物设计第19-22页
     ·同源建模第20-21页
     ·分子动力学模拟第21页
     ·分子对接与虚拟筛选第21-22页
   ·本研究的目的意义第22-24页
第二章 NS1 蛋白结构的同源建模及其活性位点分析第24-32页
   ·材料和方法第24-25页
     ·服务器与软件第24页
     ·蛋白质晶体结构与序列第24页
     ·同源建模第24-25页
     ·模型优化第25页
     ·NS1 蛋白活性位点分析第25页
       ·NS1 蛋白氨基酸序列的多序列比对第25页
       ·NS1 蛋白活性位点的确定第25页
   ·结果第25-31页
     ·建模及优化结果第25-26页
     ·模型评估结果第26-28页
     ·NS1 蛋白活性位点分析结果第28-31页
       ·NS1 蛋白氨基酸序列的多序列比对第28-29页
       ·NS1 蛋白活性位点的确定第29-31页
   ·讨论第31-32页
第三章 已知NS1 蛋白抑制剂的作用模式分析第32-46页
   ·材料和方法第32-34页
     ·服务器第32页
     ·软件及使用模块第32页
     ·受体NS1 蛋白结构的准备第32页
     ·抑制剂结构模型的搭建第32页
     ·抑制剂与NS1 蛋白靶点的分子对接第32-33页
     ·分子动力学模拟第33页
     ·抑制剂与关键氨基酸结合能以及相互作用能计算第33-34页
   ·结果第34-44页
     ·分子对接结果第34-36页
     ·分子动力学模拟体系的稳定性第36-37页
     ·结合能计算结果第37-38页
     ·抑制剂与关键氨基酸相互作用能结算结果第38-41页
     ·抑制剂结合模式分析第41-44页
   ·讨论第44-46页
第四章 A 型流感病毒NS1 蛋白抑制剂的虚拟筛选第46-56页
   ·材料与方法第46-47页
     ·服务器第46页
     ·软件及使用模块第46页
     ·蛋白质晶体结构第46页
     ·候选化合物数据库第46页
     ·化合物数据库的处理第46页
     ·受体结构的准备及靶点的确定第46-47页
     ·先导化合物结合模式初步分析第47页
   ·结果第47-54页
     ·初步筛选结果第47-50页
     ·精细对接结果第50-51页
     ·先导化合物结合模式初步分析结果第51-54页
   ·讨论第54-56页
第五章 结论第56-57页
参考文献第57-63页
致谢第63-64页
作者简历第64页

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