摘要 | 第1-7页 |
Abstract | 第7-13页 |
第一章 引言 | 第13-24页 |
·抗A 型流感病毒药物作用靶点 | 第13-19页 |
·M2 蛋白靶点 | 第13-14页 |
·NA 蛋白靶点 | 第14页 |
·NP 蛋白靶点 | 第14-15页 |
·HA 蛋白靶点 | 第15页 |
·RdRp 靶点 | 第15-16页 |
·NS1A 蛋白靶点 | 第16-19页 |
·NS1A 结构特征 | 第17-18页 |
·NS1A 与dsRNA 的结合模式 | 第18-19页 |
·计算机辅助药物设计 | 第19-22页 |
·同源建模 | 第20-21页 |
·分子动力学模拟 | 第21页 |
·分子对接与虚拟筛选 | 第21-22页 |
·本研究的目的意义 | 第22-24页 |
第二章 NS1 蛋白结构的同源建模及其活性位点分析 | 第24-32页 |
·材料和方法 | 第24-25页 |
·服务器与软件 | 第24页 |
·蛋白质晶体结构与序列 | 第24页 |
·同源建模 | 第24-25页 |
·模型优化 | 第25页 |
·NS1 蛋白活性位点分析 | 第25页 |
·NS1 蛋白氨基酸序列的多序列比对 | 第25页 |
·NS1 蛋白活性位点的确定 | 第25页 |
·结果 | 第25-31页 |
·建模及优化结果 | 第25-26页 |
·模型评估结果 | 第26-28页 |
·NS1 蛋白活性位点分析结果 | 第28-31页 |
·NS1 蛋白氨基酸序列的多序列比对 | 第28-29页 |
·NS1 蛋白活性位点的确定 | 第29-31页 |
·讨论 | 第31-32页 |
第三章 已知NS1 蛋白抑制剂的作用模式分析 | 第32-46页 |
·材料和方法 | 第32-34页 |
·服务器 | 第32页 |
·软件及使用模块 | 第32页 |
·受体NS1 蛋白结构的准备 | 第32页 |
·抑制剂结构模型的搭建 | 第32页 |
·抑制剂与NS1 蛋白靶点的分子对接 | 第32-33页 |
·分子动力学模拟 | 第33页 |
·抑制剂与关键氨基酸结合能以及相互作用能计算 | 第33-34页 |
·结果 | 第34-44页 |
·分子对接结果 | 第34-36页 |
·分子动力学模拟体系的稳定性 | 第36-37页 |
·结合能计算结果 | 第37-38页 |
·抑制剂与关键氨基酸相互作用能结算结果 | 第38-41页 |
·抑制剂结合模式分析 | 第41-44页 |
·讨论 | 第44-46页 |
第四章 A 型流感病毒NS1 蛋白抑制剂的虚拟筛选 | 第46-56页 |
·材料与方法 | 第46-47页 |
·服务器 | 第46页 |
·软件及使用模块 | 第46页 |
·蛋白质晶体结构 | 第46页 |
·候选化合物数据库 | 第46页 |
·化合物数据库的处理 | 第46页 |
·受体结构的准备及靶点的确定 | 第46-47页 |
·先导化合物结合模式初步分析 | 第47页 |
·结果 | 第47-54页 |
·初步筛选结果 | 第47-50页 |
·精细对接结果 | 第50-51页 |
·先导化合物结合模式初步分析结果 | 第51-54页 |
·讨论 | 第54-56页 |
第五章 结论 | 第56-57页 |
参考文献 | 第57-63页 |
致谢 | 第63-64页 |
作者简历 | 第64页 |