摘要 | 第1-7页 |
Abstract | 第7-11页 |
第一章 绪论 | 第11-19页 |
·蛭弧菌简介:发现,形态,分类 | 第11-12页 |
·蛭弧菌分离纯化 | 第12页 |
·应用现状和前景 | 第12-13页 |
·预防水生动物细菌性疾病 | 第12-13页 |
·作为饵料添加剂的应用 | 第13页 |
·在水质调控中的应用 | 第13页 |
·蛭弧菌的分子生物学研究进展 | 第13-15页 |
·本研究的立题依据 | 第15-19页 |
第二章 蛭弧菌基因组 DNA 制备 | 第19-27页 |
·引言 | 第19页 |
·材料,溶液和仪器 | 第19-21页 |
·材料 | 第19页 |
·仪器 | 第19-20页 |
·溶液和培养基 | 第20-21页 |
·试验方法 | 第21-23页 |
·菌体制备 | 第21-22页 |
·基因组DNA 制备 | 第22-23页 |
·结果与讨论 | 第23-26页 |
·BD 存活检测 | 第23-24页 |
·宿主残留检测 | 第24页 |
·反复冻融法提取基因组DNA | 第24-25页 |
·试剂盒提取基因组DNA | 第25页 |
·修正化学法和快速灭菌法 | 第25-26页 |
·讨论 | 第26-27页 |
第三章 蛭弧菌16s rRNA 基因的扩增 | 第27-31页 |
·引言 | 第27页 |
·材料,试剂和仪器 | 第27页 |
·材料 | 第27页 |
·试剂 | 第27页 |
·仪器 | 第27页 |
·试验方法 | 第27-29页 |
·PCR 模板处理 | 第27-28页 |
·引物特异性分析 | 第28页 |
·PCR 反应体系 | 第28-29页 |
·结果与分析 | 第29-30页 |
·引物特异性分析 | 第29页 |
·扩增结果 | 第29-30页 |
·讨论 | 第30-31页 |
第四章 蛭弧菌16s-ITS 基因的扩增 | 第31-36页 |
·引言 | 第31页 |
·材料,药品和仪器 | 第31-32页 |
·材料 | 第31页 |
·试剂 | 第31-32页 |
·仪器 | 第32页 |
·试验方法 | 第32-33页 |
·引物特异性分析 | 第32页 |
·退火温度优化 | 第32页 |
·Mg~(2+)优化 | 第32-33页 |
·PCR 扩增BD 基因 | 第33页 |
·结果与分析 | 第33-35页 |
·引物特异性分析 | 第33页 |
·退火温度优化 | 第33页 |
·Mg~(2+)优化 | 第33-35页 |
·PCR 扩增BD 16s-ITS 基因 | 第35页 |
·讨论 | 第35-36页 |
第五章 克隆制备和检测 | 第36-50页 |
·引言 | 第36-37页 |
·材料和仪器 | 第37-39页 |
·菌种 | 第37页 |
·培养基和试剂 | 第37-39页 |
·仪器 | 第39页 |
·实验方法 | 第39-43页 |
·PCR 产物的切胶纯化和定量 | 第39-40页 |
·感受态DH5α制备 | 第40页 |
·连接反应 | 第40-41页 |
·转化感受态大肠杆菌DH5α | 第41页 |
·蓝白斑筛选 | 第41页 |
·菌落PCR(20μL 体系) | 第41-42页 |
·克隆的酶切检测 | 第42-43页 |
·结果与分析 | 第43-48页 |
·PCR,切胶纯化和定量 | 第43页 |
·克隆统计 | 第43-44页 |
·菌落PCR 检测白斑 | 第44-45页 |
·质粒抽提和定量 | 第45-46页 |
·酶切分析 | 第46-48页 |
·双酶切电泳结果 | 第48页 |
·讨论 | 第48-50页 |
第六章 测序,进化分析和菌种鉴定 | 第50-65页 |
·引言 | 第50页 |
·实验方法 | 第50-52页 |
·PCR 产物直接测序引物的选定 | 第50-51页 |
·测序克隆测序 | 第51页 |
·提交序列 | 第51页 |
·进化分析和菌株鉴定 | 第51页 |
·16s-ITS 序列提交 | 第51页 |
·16s-ITS 基因的拼接 | 第51-52页 |
·序列BLAST,进化树构建 | 第52页 |
·结果与分析 | 第52-62页 |
·测序引物验证 | 第52-53页 |
·16s rRNA 基因序列 | 第53-55页 |
·16s rRNA 基因提交序列 | 第55页 |
·基于16s rRNA 基因的进化分析 | 第55-56页 |
·16s-ITS 基因提交序列 | 第56-57页 |
·全长16s 基因和ITS 基因拼接序列 | 第57-62页 |
·基于ITS 的进化分析和菌种鉴定 | 第62页 |
·小结 | 第62-65页 |
第七章 dHPLC 用于检测蛭弧菌多样性的初步研究 | 第65-76页 |
·引言 | 第65页 |
·材料,溶液和仪器 | 第65-66页 |
·材料 | 第65-66页 |
·溶液 | 第66页 |
·仪器 | 第66页 |
·方法 | 第66-67页 |
·测试样品的选择 | 第66页 |
·电泳条件的确定 | 第66-67页 |
·dHPLC | 第67页 |
·结果与分析 | 第67-75页 |
·样品的选择 | 第67-68页 |
·样品制备 | 第68-69页 |
·dHPLC 结果 | 第69-75页 |
·讨论 | 第75-76页 |
结论与展望 | 第76-77页 |
参考文献 | 第77-82页 |
攻读硕士学位期间取得的研究成果 | 第82-83页 |
致谢 | 第83页 |