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5株蛭弧菌的16S-ITS序列及dHPLC多态性的初步分析

摘要第1-7页
Abstract第7-11页
第一章 绪论第11-19页
   ·蛭弧菌简介:发现,形态,分类第11-12页
   ·蛭弧菌分离纯化第12页
   ·应用现状和前景第12-13页
     ·预防水生动物细菌性疾病第12-13页
     ·作为饵料添加剂的应用第13页
     ·在水质调控中的应用第13页
   ·蛭弧菌的分子生物学研究进展第13-15页
   ·本研究的立题依据第15-19页
第二章 蛭弧菌基因组 DNA 制备第19-27页
   ·引言第19页
   ·材料,溶液和仪器第19-21页
     ·材料第19页
     ·仪器第19-20页
     ·溶液和培养基第20-21页
   ·试验方法第21-23页
     ·菌体制备第21-22页
     ·基因组DNA 制备第22-23页
   ·结果与讨论第23-26页
     ·BD 存活检测第23-24页
     ·宿主残留检测第24页
     ·反复冻融法提取基因组DNA第24-25页
     ·试剂盒提取基因组DNA第25页
     ·修正化学法和快速灭菌法第25-26页
   ·讨论第26-27页
第三章 蛭弧菌16s rRNA 基因的扩增第27-31页
   ·引言第27页
   ·材料,试剂和仪器第27页
     ·材料第27页
     ·试剂第27页
     ·仪器第27页
   ·试验方法第27-29页
     ·PCR 模板处理第27-28页
     ·引物特异性分析第28页
     ·PCR 反应体系第28-29页
   ·结果与分析第29-30页
     ·引物特异性分析第29页
     ·扩增结果第29-30页
   ·讨论第30-31页
第四章 蛭弧菌16s-ITS 基因的扩增第31-36页
   ·引言第31页
   ·材料,药品和仪器第31-32页
     ·材料第31页
     ·试剂第31-32页
     ·仪器第32页
   ·试验方法第32-33页
     ·引物特异性分析第32页
     ·退火温度优化第32页
     ·Mg~(2+)优化第32-33页
     ·PCR 扩增BD 基因第33页
   ·结果与分析第33-35页
     ·引物特异性分析第33页
     ·退火温度优化第33页
     ·Mg~(2+)优化第33-35页
     ·PCR 扩增BD 16s-ITS 基因第35页
   ·讨论第35-36页
第五章 克隆制备和检测第36-50页
   ·引言第36-37页
   ·材料和仪器第37-39页
     ·菌种第37页
     ·培养基和试剂第37-39页
     ·仪器第39页
   ·实验方法第39-43页
     ·PCR 产物的切胶纯化和定量第39-40页
     ·感受态DH5α制备第40页
     ·连接反应第40-41页
     ·转化感受态大肠杆菌DH5α第41页
     ·蓝白斑筛选第41页
     ·菌落PCR(20μL 体系)第41-42页
     ·克隆的酶切检测第42-43页
   ·结果与分析第43-48页
     ·PCR,切胶纯化和定量第43页
     ·克隆统计第43-44页
     ·菌落PCR 检测白斑第44-45页
     ·质粒抽提和定量第45-46页
     ·酶切分析第46-48页
     ·双酶切电泳结果第48页
   ·讨论第48-50页
第六章 测序,进化分析和菌种鉴定第50-65页
   ·引言第50页
   ·实验方法第50-52页
     ·PCR 产物直接测序引物的选定第50-51页
     ·测序克隆测序第51页
     ·提交序列第51页
     ·进化分析和菌株鉴定第51页
     ·16s-ITS 序列提交第51页
     ·16s-ITS 基因的拼接第51-52页
     ·序列BLAST,进化树构建第52页
   ·结果与分析第52-62页
     ·测序引物验证第52-53页
     ·16s rRNA 基因序列第53-55页
     ·16s rRNA 基因提交序列第55页
     ·基于16s rRNA 基因的进化分析第55-56页
     ·16s-ITS 基因提交序列第56-57页
     ·全长16s 基因和ITS 基因拼接序列第57-62页
     ·基于ITS 的进化分析和菌种鉴定第62页
   ·小结第62-65页
第七章 dHPLC 用于检测蛭弧菌多样性的初步研究第65-76页
   ·引言第65页
   ·材料,溶液和仪器第65-66页
     ·材料第65-66页
     ·溶液第66页
     ·仪器第66页
   ·方法第66-67页
     ·测试样品的选择第66页
     ·电泳条件的确定第66-67页
     ·dHPLC第67页
   ·结果与分析第67-75页
     ·样品的选择第67-68页
     ·样品制备第68-69页
     ·dHPLC 结果第69-75页
   ·讨论第75-76页
结论与展望第76-77页
参考文献第77-82页
攻读硕士学位期间取得的研究成果第82-83页
致谢第83页

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