| 摘要 | 第3-6页 |
| ABSTRACT | 第6-9页 |
| 第一章 绪论 | 第13-54页 |
| 1.1 小分子及靶点的研究概况 | 第13-28页 |
| 1.1.1 小分子及靶蛋白质发现研究的意义 | 第13-15页 |
| 1.1.2 小分子靶蛋白发现的方法 | 第15-28页 |
| 1.2 蛋白质芯片概述 | 第28-32页 |
| 1.2.1 蛋白质芯片介绍 | 第28-30页 |
| 1.2.2 蛋白质组芯片在小分子靶点发现中的应用 | 第30-32页 |
| 1.3 第二信使环二鸟苷酸(c-di-GMP)信号分子的研究概述 | 第32-47页 |
| 1.3.1 c-di-GMP信号分子是一种重要的核苷酸第二信使 | 第32-43页 |
| 1.3.2 c-di-GMP参与众多重要的生理途径 | 第43-46页 |
| 1.3.3 c-di-GMP的研究前景 | 第46-47页 |
| 1.4 中药青蒿素及其衍生物的研究概述 | 第47-52页 |
| 1.4.1 青蒿素及其衍生物的概述 | 第47页 |
| 1.4.2 青蒿素及其衍生物的活性作用 | 第47-51页 |
| 1.4.3 青蒿素及其衍生物的研究前景 | 第51-52页 |
| 1.5 本论文研究的目的、内容和意义 | 第52-54页 |
| 第二章 材料与方法 | 第54-81页 |
| 2.1 实验试剂、材料和仪器 | 第54-56页 |
| 2.1.1 实验试剂 | 第54-55页 |
| 2.1.2 实验耗材 | 第55页 |
| 2.1.3 实验仪器 | 第55页 |
| 2.1.4 主要溶液 | 第55页 |
| 2.1.5 细胞系 | 第55-56页 |
| 2.2 实验方法 | 第56-81页 |
| 2.2.1 小分子和芯片反应 | 第56-57页 |
| 2.2.2 候选蛋白质的克隆、表达和纯化 | 第57-65页 |
| 2.2.3 候选蛋白质与c-di-GMP/DHA的结合验证 | 第65-69页 |
| 2.2.4 候选蛋白质EthR/PpnK体外活性受c-di-GMP的影响 | 第69-71页 |
| 2.2.5 耻垢分枝杆菌的dgc/ethr过表达菌株和ethr的敲除菌株的构建 | 第71-74页 |
| 2.2.6 耻垢分枝杆菌中c-di-GMP的提取及检测 | 第74页 |
| 2.2.7 候选蛋白质EthR体内活性受c-di-GMP的影响 | 第74-75页 |
| 2.2.8 序列比对及对接结构模拟 | 第75-76页 |
| 2.2.9 耻垢分枝杆菌相关表型实验 | 第76-81页 |
| 第三章 基于蛋白质组芯片技术探寻c-di-GMP在结核分枝杆菌中的作用靶蛋白及功能研究 | 第81-142页 |
| 3.1 引言 | 第81-90页 |
| 3.1.1 肺结核病的现状 | 第81-83页 |
| 3.1.2 结核分枝杆菌的信号转导 | 第83-85页 |
| 3.1.3 分枝杆菌中的c-di-GMP的研究概况 | 第85-89页 |
| 3.1.4 本章研究路线 | 第89-90页 |
| 3.2 实验结果和讨论 | 第90-138页 |
| 3.2.1 基于蛋白质芯片的c-di-GMP靶点发现 | 第90-92页 |
| 3.2.2 c-di-GMP与候选靶点的体外验证 | 第92-96页 |
| 3.2.3 c-di-GMP调节ethr-etha途径 | 第96-107页 |
| 3.2.4 c-di-GMP调控耻垢分枝杆菌对ETH的耐药性 | 第107-117页 |
| 3.2.5 c-di-GMP与 EthR的结合机制 | 第117-128页 |
| 3.2.6 c-di-GMP调节PpnK活性 | 第128-129页 |
| 3.2.7 c-di-GMP影响耻垢分枝杆菌的其他表型 | 第129-138页 |
| 3.3 本章小结 | 第138-142页 |
| 第四章 基于人蛋白质组芯片技术初步探寻双氢青蒿素的药物作用靶蛋白 | 第142-152页 |
| 4.1 引言 | 第142-144页 |
| 4.1.1 双氢青蒿素的研究进展 | 第142-143页 |
| 4.1.2 青蒿素及其衍生物在系统性红斑狼疮疾病的研究概述 | 第143-144页 |
| 4.2 实验结果和讨论 | 第144-151页 |
| 4.2.1 生物素标记的双氢青蒿素探针的合成 | 第144-145页 |
| 4.2.2 基于蛋白质芯片的双氢青蒿素靶蛋白发现 | 第145-146页 |
| 4.2.3 生物信息学分析双氢青蒿素的靶点及调控途径 | 第146-148页 |
| 4.2.4 双氢青蒿素与候选靶点的结合验证 | 第148-151页 |
| 4.3 本章小结 | 第151-152页 |
| 第五章 基于蛋白质组芯片技术探寻小分子靶蛋白及机制研究的流程标准化 | 第152-157页 |
| 5.1 引言 | 第152-153页 |
| 5.1.1 基于人蛋白质组芯片技术系统性发现三氧化二砷的药物靶点 | 第152-153页 |
| 5.2 标准化流程 | 第153-156页 |
| 5.3 本章小结 | 第156-157页 |
| 第六章 总结与展望 | 第157-163页 |
| 6.1 研究内容总结 | 第157-159页 |
| 6.2 本研究的创新点 | 第159页 |
| 6.3 展望 | 第159-163页 |
| 附录一 与c-di-GMP相互作用的蛋白质 | 第163-167页 |
| 附录二 与双氢青蒿素相互作用的蛋白质 | 第167-174页 |
| 附录三 相关菌株和引物 | 第174-176页 |
| 附录四 主要仪器 | 第176-178页 |
| 附录五 主要溶液 | 第178-184页 |
| 致谢 | 第184-186页 |
| 攻读博士学位期间主要研究成果 | 第186-189页 |
