摘要 | 第4-5页 |
Abstract | 第5页 |
1 前言 | 第9-22页 |
1.1 SnoRNA的种类与结构 | 第9-13页 |
1.1.1 C/D box snoRNA | 第9-11页 |
1.1.2 H/ACA box snoRNA | 第11-13页 |
1.1.3 ScaRNA | 第13页 |
1.2 SnoRNA的基因组织形式 | 第13-15页 |
1.2.1 独立转录的snoRNA基因 | 第14-15页 |
1.2.2 内含子编码的snoRNA基因 | 第15页 |
1.2.3 SnoRNA基因簇 | 第15页 |
1.3 SnoRNA研究现状 | 第15-18页 |
1.3.1 SnoRNA的发掘 | 第16页 |
1.3.2 SnoRNA的其它功能 | 第16-18页 |
1.4 橡胶树中胶乳再生研究现状 | 第18-20页 |
1.4.1 橡胶树胶乳再生 | 第19页 |
1.4.2 核酸代谢在胶乳再生中的作用 | 第19-20页 |
1.5 研究的目的和意义 | 第20-21页 |
1.6 本研究的技术路线 | 第21-22页 |
2 材料与方法 | 第22-33页 |
2.1 材料与试剂 | 第22-23页 |
2.1.1 植物材料 | 第22页 |
2.1.2 生化试剂 | 第22页 |
2.1.3 主要仪器 | 第22-23页 |
2.1.4 试剂配制 | 第23页 |
2.2 实验方法 | 第23-33页 |
2.2.1 巴西橡胶树胶乳和叶片细胞核RNA的提取 | 第23-25页 |
2.2.2 转录组测序样品的制备 | 第25页 |
2.2.3 NcRNA测序结果分析 | 第25-26页 |
2.2.4 巴西橡胶树胶乳和树叶总RNA的提取(SDS法) | 第26-27页 |
2.2.5 半定量分析 | 第27-30页 |
2.2.6 胶乳高表达snoRNAs的表达分析 | 第30-31页 |
2.2.7 SnoRNAs生物信息学分析 | 第31页 |
2.2.8 胶乳再生研究 | 第31-33页 |
3 结果与分析 | 第33-58页 |
3.1 橡胶树橡胶树叶片和胶乳核内总RNA质量检测 | 第33-34页 |
3.2 转录组分析和snoRNA的发掘 | 第34-41页 |
3.2.1 转录组分析 | 第34-35页 |
3.2.2 橡胶树rRNA序列上可能的修饰位点 | 第35-37页 |
3.2.3 SnoRNA的发掘 | 第37-41页 |
3.3 橡胶树snoRNAS的表达分析 | 第41-44页 |
3.2.1 Total RNA质量检测 | 第41页 |
3.2.2 橡胶树snoRNAs的半定量PCR验证 | 第41-44页 |
3.4 生物信息学预测snoRNAS的靶位点 | 第44-48页 |
3.5 乳管特异性表达snoRNAs的表达量与胶乳产量、TSC/C的相关性分析 | 第48-54页 |
3.5.1 杂交组合中单株胶乳产量、TSC以及树围的测定 | 第48-50页 |
3.5.2 乳管特异性表达snoRNAs的表达量与生理数据的相关性分析 | 第50-54页 |
3.6 SnoRNA在胶乳再生中的作用研究 | 第54-58页 |
4 讨论 | 第58-62页 |
4.1 橡胶树snoRNA的发掘鉴定分析 | 第58页 |
4.2 典型snoRNA对ncRNA修饰功能的分析 | 第58-59页 |
4.3 Orphan snoRNA的可能功能分析 | 第59-60页 |
4.4 SnoRNA在生理过程中的研究分析 | 第60-62页 |
5 结论 | 第62-63页 |
参考文献 | 第63-69页 |
缩略词表 | 第69-70页 |
附录 | 第70-71页 |
致谢 | 第71页 |