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巴西橡胶树snoRNA的发掘鉴定及其在胶乳再生中的作用研究

摘要第4-5页
Abstract第5页
1 前言第9-22页
    1.1 SnoRNA的种类与结构第9-13页
        1.1.1 C/D box snoRNA第9-11页
        1.1.2 H/ACA box snoRNA第11-13页
        1.1.3 ScaRNA第13页
    1.2 SnoRNA的基因组织形式第13-15页
        1.2.1 独立转录的snoRNA基因第14-15页
        1.2.2 内含子编码的snoRNA基因第15页
        1.2.3 SnoRNA基因簇第15页
    1.3 SnoRNA研究现状第15-18页
        1.3.1 SnoRNA的发掘第16页
        1.3.2 SnoRNA的其它功能第16-18页
    1.4 橡胶树中胶乳再生研究现状第18-20页
        1.4.1 橡胶树胶乳再生第19页
        1.4.2 核酸代谢在胶乳再生中的作用第19-20页
    1.5 研究的目的和意义第20-21页
    1.6 本研究的技术路线第21-22页
2 材料与方法第22-33页
    2.1 材料与试剂第22-23页
        2.1.1 植物材料第22页
        2.1.2 生化试剂第22页
        2.1.3 主要仪器第22-23页
        2.1.4 试剂配制第23页
    2.2 实验方法第23-33页
        2.2.1 巴西橡胶树胶乳和叶片细胞核RNA的提取第23-25页
        2.2.2 转录组测序样品的制备第25页
        2.2.3 NcRNA测序结果分析第25-26页
        2.2.4 巴西橡胶树胶乳和树叶总RNA的提取(SDS法)第26-27页
        2.2.5 半定量分析第27-30页
        2.2.6 胶乳高表达snoRNAs的表达分析第30-31页
        2.2.7 SnoRNAs生物信息学分析第31页
        2.2.8 胶乳再生研究第31-33页
3 结果与分析第33-58页
    3.1 橡胶树橡胶树叶片和胶乳核内总RNA质量检测第33-34页
    3.2 转录组分析和snoRNA的发掘第34-41页
        3.2.1 转录组分析第34-35页
        3.2.2 橡胶树rRNA序列上可能的修饰位点第35-37页
        3.2.3 SnoRNA的发掘第37-41页
    3.3 橡胶树snoRNAS的表达分析第41-44页
        3.2.1 Total RNA质量检测第41页
        3.2.2 橡胶树snoRNAs的半定量PCR验证第41-44页
    3.4 生物信息学预测snoRNAS的靶位点第44-48页
    3.5 乳管特异性表达snoRNAs的表达量与胶乳产量、TSC/C的相关性分析第48-54页
        3.5.1 杂交组合中单株胶乳产量、TSC以及树围的测定第48-50页
        3.5.2 乳管特异性表达snoRNAs的表达量与生理数据的相关性分析第50-54页
    3.6 SnoRNA在胶乳再生中的作用研究第54-58页
4 讨论第58-62页
    4.1 橡胶树snoRNA的发掘鉴定分析第58页
    4.2 典型snoRNA对ncRNA修饰功能的分析第58-59页
    4.3 Orphan snoRNA的可能功能分析第59-60页
    4.4 SnoRNA在生理过程中的研究分析第60-62页
5 结论第62-63页
参考文献第63-69页
缩略词表第69-70页
附录第70-71页
致谢第71页

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