| 摘要 | 第4-8页 |
| ABSTRACT | 第8-12页 |
| 第1章 文献综述 | 第16-68页 |
| 1.1 母源基因组在早期胚胎发育过程中的功能研究综述 | 第16-35页 |
| 1.1.1 母源基因组在合子基因组激活前对早期胚胎发育的调控 | 第17-20页 |
| 1.1.2 母源基因组在合子基因组激活后对胚胎发育的调控 | 第20-21页 |
| 1.1.3 母源效应基因的研究进展 | 第21-35页 |
| 1.2 哺乳动物孤雌生殖的研究进展 | 第35-40页 |
| 1.2.1 哺乳动物卵母细胞孤雌激活的原理 | 第35-37页 |
| 1.2.2 哺乳动物卵母细胞孤雌激活技术 | 第37页 |
| 1.2.3 哺乳动物孤雌生殖的应用 | 第37-40页 |
| 1.3 蛋白质组学在哺乳动物早期胚胎发育过程中的研究进展 | 第40-55页 |
| 1.3.1 蛋白质组学技术 | 第40-45页 |
| 1.3.2 生殖细胞的蛋白质组研究 | 第45-47页 |
| 1.3.3 体外受精和孤雌胚胎的蛋白质组学 | 第47-48页 |
| 1.3.4 母源因子的蛋白质组学研究 | 第48-55页 |
| 1.4 转录组学在哺乳动物早期胚胎发育过程中的研究综述 | 第55-65页 |
| 1.4.1 牛早期胚胎发育过程中的基因表达的特点和规律 | 第56-60页 |
| 1.4.2 单细胞转录组测序技术研究进展 | 第60-62页 |
| 1.4.3 转录组学在哺乳动物早期胚胎发育过程中的研究进展 | 第62-65页 |
| 1.5 本课题的目的、研究意义和技术路线 | 第65-68页 |
| 第2章 水牛卵母细胞孤雌激活前后的定量蛋白质组学研究 | 第68-96页 |
| 2.1 材料和方法 | 第68-75页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第68-70页 |
| 2.1.2 实验方法 | 第70-75页 |
| 2.1.3 本章试验数据的统计分析 | 第75页 |
| 2.2 结果与分析 | 第75-91页 |
| 2.2.1 使用串联质量标签对水牛卵母细胞孤雌激活前后进行定量蛋白质组学分析 | 第75-80页 |
| 2.2.2 差异表达蛋白质的基因本体论(GO)分析 | 第80-84页 |
| 2.2.3 差异表达蛋白质的KEGG通路分析 | 第84-89页 |
| 2.2.4 蛋白质组学数据的验证 | 第89-91页 |
| 2.3 讨论 | 第91-94页 |
| 2.4 小结 | 第94-96页 |
| 第3章 水牛孤雌胚胎在附植前发育各个阶段的单细胞/单胚胎转录组学研究 | 第96-122页 |
| 3.1 材料和方法 | 第96-101页 |
| 3.1.1 实验材料和方法 | 第96-97页 |
| 3.1.2 实验方法 | 第97-101页 |
| 3.2 结果与分析 | 第101-119页 |
| 3.2.1 水牛卵母细胞和孤雌生殖附植前胚胎发育各阶段胚胎的差异表达基因的鉴定 | 第101-109页 |
| 3.2.2 差异表达基因的聚类分析 | 第109-114页 |
| 3.2.3 特定模块的关键基因的识别和互作关系的可视化作图 | 第114-117页 |
| 3.2.4 孤雌生殖水牛胚胎发育过程中阶段特定模块的基因参与的信号通路 | 第117-118页 |
| 3.2.5 qRT-PCR验证 | 第118-119页 |
| 3.3 讨论 | 第119-121页 |
| 3.4 小结 | 第121-122页 |
| 第4章 参与水牛早期胚胎合子基因组激活的母源表达蛋白质或基因的初步鉴定 | 第122-134页 |
| 4.1 材料和方法 | 第122-123页 |
| 4.1.1 实验材料和方法 | 第122-123页 |
| 4.1.2 生物信息学分析工具 | 第123页 |
| 4.2 结果与分析 | 第123-131页 |
| 4.2.1 水牛卵母细胞孤雌激活后附植前胚胎的转录图谱的相关性和层次分析 | 第123-128页 |
| 4.2.2 水牛孤雌胚胎蛋白质组中鉴定的候选母源蛋白质NPM2和NLRP5的mRNA表达规律分析 | 第128-131页 |
| 4.3 讨论 | 第131-132页 |
| 4.4 小结 | 第132-134页 |
| 第5章 关键基因和蛋白质的跨物种同源性分析 | 第134-145页 |
| 5.1 材料和方法 | 第134页 |
| 5.1.1 实验材料和方法 | 第134页 |
| 5.1.2 生物信息学分析工具 | 第134页 |
| 5.2 结果与分析 | 第134-143页 |
| 5.2.1 水牛孤雌激活前后差异表达蛋白质的跨物种的同源性比对、ID转换和注释分析 | 第134-138页 |
| 5.2.2 水牛孤雌胚胎各阶段差异表达的关键基因(Hub genes)的同源性比对、ID转换和注释分析 | 第138-143页 |
| 5.3 讨论 | 第143-144页 |
| 5.4 小结 | 第144-145页 |
| 全文总结和研究展望 | 第145-149页 |
| 参考文献 | 第149-174页 |
| 附录 | 第174-195页 |
| 致谢 | 第195-196页 |
| 攻读学位期间发表论文情况 | 第196-197页 |
