首页--农业科学论文--林业论文--森林树种论文--特用阔叶树类论文--橡胶树论文

巴西橡胶树冷胁迫诱导DNA甲基化修饰研究

摘要第4-7页
Abstract第7-9页
1 引言第13-32页
    1.1 巴西橡胶树寒害及低温响应基因冷应答机制研究现状第13-15页
        1.1.1 巴西橡胶树寒害生理生化研究现状第13-14页
        1.1.2 巴西橡胶树寒害分子生物学研究现状第14-15页
    1.2 植物冷应答机制及表观遗传学研究现状第15-19页
        1.2.1 植物冷应答机制第15-17页
        1.2.2 植物冷应答的表观遗传学第17-19页
    1.3 DNA的甲基化和去甲基化第19-24页
        1.3.1 DNA甲基化第19-21页
        1.3.2 DNA去甲基化第21-24页
    1.4 DNA的甲基化研究方法第24-27页
        1.4.1 全基因组甲基化水平分析第24-26页
        1.4.2 亚硫酸氢盐修饰法研究DNA甲基化水平第26-27页
    1.5 高通量测序应用DNA甲基化研究第27-29页
        1.5.1 简化全基因组甲基化测序-RRBS技术第27-28页
        1.5.2 RRBS技术相关高通量软件介绍第28-29页
    1.6 研究目的和意义第29-31页
    1.7 技术路线第31-32页
2 实验材料与方法第32-52页
    2.1 实验材料第32-34页
        2.1.1 植物材料第32-33页
        2.1.2 载体质粒和菌株第33页
        2.1.3 实验试剂第33页
        2.1.4 实验仪器设备第33-34页
    2.2 实验方法第34-52页
        2.2.1 巴西橡胶树DNA和RNA分离第34-35页
        2.2.2 巴西橡胶树无性系Reyan7-33-97组培苗长期低温处理表型及甲基化MCA扩增扫描第35-37页
        2.2.3 低温信号途径相关基因及DNA甲基化转移酶基因的组织特异性表达分析,各种低温处理样品中的表达分析第37-40页
        2.2.4 巴西橡胶树低温信号途径基因HbICE1、HbCBF2和甲基化转移酶HbMET基因5'端启动子CpG岛的生物信息学分析第40页
        2.2.5 巴西橡胶树HbICE1、HbCBFs和HbMET基因5'端启动子CpG岛在长时间低温处理样品和多品种样品中甲基化状态分析第40-41页
        2.2.6 巴西橡胶树低温信号途径相关基因及DNA甲基化转移酶基因在多品种样品中不同季节的表达分析第41-42页
        2.2.7 巴西橡胶树长时间低温胁迫的全基因组两例RNA-seq分析第42-44页
        2.2.8 巴西橡胶树长时间低温胁迫的全基因组两例RRBS分析第44-46页
        2.2.9 基于RRBS与表达谱测序的巴西橡胶树长时间低温胁迫处理的DNA甲基化与基因表达贯穿分析第46-47页
        2.2.10 基于贯穿分析全基因组内甲基化程度与基因的表达量间相关性基因的表达水平验证第47-49页
        2.2.11 DNA去甲基化相关基因的在各种低温样品和多品种样品中的表达分析第49-51页
        2.2.12 巴西橡胶树HbDME3、HbROS1和HbROS2基因5'端启动子CpG岛在各种低温样品和多品种样品中甲基化模式分析第51-52页
3 结果与分析第52-114页
    3.1 巴西橡胶树低温信号途径相关基因及DNA甲基化转移酶基因的组织特异性表达分析第52-53页
        3.1.1 RNA及cDNA检测第52页
        3.1.2 巴西橡胶树不同组织中低温信号途径相关基因及DNA甲基化转移酶基因的表达规律第52-53页
    3.2 巴西橡胶树无性系Reyan7-33-97组培苗长期低温处理表型及甲基化MCA扩增扫描第53-56页
        3.2.1 巴西橡胶树无性系Reyan7-33-97组培苗长期低温处理表型第53-54页
        3.2.2 巴西橡胶树无性系Reyan7-33-97组培苗长期低温处理后全基因组甲基化MCA扩增扫描第54-56页
    3.3 巴西橡胶树长时间低温胁迫的全基因组两例RRBS分析第56-63页
    3.4 巴西橡胶树低温信号途径相关基因及DNA甲基化转移酶基因在各种低温处理样品中的表达分析第63-67页
        3.4.1 巴西橡胶树低温信号途径相关基因及DNA甲基化转移酶基因短期冷处理后的基因表达分析第63-66页
        3.4.2 巴西橡胶树低温信号途径相关基因及DNA甲基化转移酶基因长期冷处理后的基因表达分析第66-67页
    3.5 巴西橡胶树低温信号途径基因HbICE1、HbCBF2和甲基化转移酶HbMET基因5'端启动子CpG岛的生物信息学分析第67-70页
    3.6 巴西橡胶树HbICE1、HbCBF2和HbMET基因5'端启动子CpG岛在长时间低温处理样品和多品种样品中的甲基化状态分析第70-79页
        3.6.1 巴西橡胶树HbICE1、HbCBF2和HbMET基因5'端启动子CpG岛在长时间低温处理样品中的甲基化状态分析第70-75页
        3.6.2 不同品种的巴西橡胶树HbICE1和HbMET基因5'端启动子CpG岛在不同地理位置和季节中的甲基化状态分析第75-79页
    3.7 DNA去甲基化相关基因家族在长时间低温样品中的表达分析第79-80页
    3.8 巴西橡胶树HbDME3、HbROS1和HbROS2基因5'端启动子CpG岛在长时间低温胁迫样品中甲基化模式分析第80-82页
    3.9 巴西橡胶树长时间低温胁迫的全基因组两例RNA-seq分析第82-93页
    3.10 基于RRBS与表达谱测序的巴西橡胶树长期低温胁迫处理的DNA甲基化与基因表达贯穿分析第93-108页
    3.11 不同品种的巴西橡胶树低温信号途径相关基因和DNA甲基化相关基因在不同地理位置和季节中表达分析第108-109页
    3.12 DNA去甲基化相关基因家族在短时间不同低温样品和不同季节多品种样品中的表达分析,及组织特异性表达分析第109-114页
4 讨论第114-119页
5 结论第119-120页
参考文献第120-129页
科研成果及项目支持第129-130页
致谢第130-131页

论文共131页,点击 下载论文
上一篇:橡胶树乙烯刺激产胶品种差异的分子基础
下一篇:日本血吸虫感染小鼠树突状细胞免疫功能的动态与机制研究