致谢 | 第7-8页 |
摘要 | 第8-9页 |
Abstract | 第9页 |
第一章 绪论 | 第10-31页 |
1.1 环状RNA的简介 | 第10-21页 |
1.1.1 环状RNA的初次发现 | 第11页 |
1.1.2 环状RNA的大规模发现 | 第11-12页 |
1.1.3 环状RNA的分类与形成机制 | 第12-16页 |
1.1.4 环状RNA的生物学功能 | 第16-21页 |
1.2 环状RNA实验验证方法简介 | 第21-23页 |
1.2.1 环状RNA的富集 | 第21页 |
1.2.2 环状RNA的实验鉴定 | 第21-23页 |
1.3 环状RNA生物信息学分析方法简介 | 第23-29页 |
1.3.1 环状RNA生物信息学算法分类 | 第23-25页 |
1.3.2 环状RNA数据库 | 第25-26页 |
1.3.3 环状RNA鉴定过程中存在的挑战 | 第26-29页 |
1.4 研究内容和目的意义 | 第29-31页 |
第二章 环状RNA实验方法体系(RT-PCR)的优化 | 第31-39页 |
2.1 实验材料 | 第31-32页 |
2.2 实验方法 | 第32-34页 |
2.2.1 RNase R消化流程的优化 | 第32-33页 |
2.2.2 RT-PCR程序的优化 | 第33-34页 |
2.3 结果与分析 | 第34-36页 |
2.3.1 两种RNase R消化方案富集环状RNA效果比较 | 第34-35页 |
2.3.2 Touch down PCR提高对环状RNA扩增的特异性 | 第35-36页 |
2.4 小结和讨论 | 第36-39页 |
第三章 水稻中环状RNA的鉴定 | 第39-55页 |
3.1 实验材料 | 第39页 |
3.2 实验方法 | 第39-46页 |
3.2.1 针对水稻中环状RNA全长实验方法的探索 | 第39-42页 |
3.2.2 针对水稻中环状RNA可变环化实验方法的探索 | 第42-44页 |
3.2.3 针对水稻中融合转录本实验方法的探索 | 第44-46页 |
3.3 结果与分析 | 第46-52页 |
3.3.1 获得水稻中环状RNA的全长 | 第46-47页 |
3.3.2 水稻中存在通过可变环化形成的环状RNA | 第47-49页 |
3.3.3 水稻中存在非GT/AG剪接信号的环状RNA | 第49-50页 |
3.3.4 水稻中可能存在通过融合方式形成的环状RNA | 第50-52页 |
3.4 小结与讨论 | 第52-55页 |
参考文献 | 第55-59页 |
硕士期间发表的论文 | 第59页 |