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水稻环状RNA实验鉴定方法的优化及应用

致谢第7-8页
摘要第8-9页
Abstract第9页
第一章 绪论第10-31页
    1.1 环状RNA的简介第10-21页
        1.1.1 环状RNA的初次发现第11页
        1.1.2 环状RNA的大规模发现第11-12页
        1.1.3 环状RNA的分类与形成机制第12-16页
        1.1.4 环状RNA的生物学功能第16-21页
    1.2 环状RNA实验验证方法简介第21-23页
        1.2.1 环状RNA的富集第21页
        1.2.2 环状RNA的实验鉴定第21-23页
    1.3 环状RNA生物信息学分析方法简介第23-29页
        1.3.1 环状RNA生物信息学算法分类第23-25页
        1.3.2 环状RNA数据库第25-26页
        1.3.3 环状RNA鉴定过程中存在的挑战第26-29页
    1.4 研究内容和目的意义第29-31页
第二章 环状RNA实验方法体系(RT-PCR)的优化第31-39页
    2.1 实验材料第31-32页
    2.2 实验方法第32-34页
        2.2.1 RNase R消化流程的优化第32-33页
        2.2.2 RT-PCR程序的优化第33-34页
    2.3 结果与分析第34-36页
        2.3.1 两种RNase R消化方案富集环状RNA效果比较第34-35页
        2.3.2 Touch down PCR提高对环状RNA扩增的特异性第35-36页
    2.4 小结和讨论第36-39页
第三章 水稻中环状RNA的鉴定第39-55页
    3.1 实验材料第39页
    3.2 实验方法第39-46页
        3.2.1 针对水稻中环状RNA全长实验方法的探索第39-42页
        3.2.2 针对水稻中环状RNA可变环化实验方法的探索第42-44页
        3.2.3 针对水稻中融合转录本实验方法的探索第44-46页
    3.3 结果与分析第46-52页
        3.3.1 获得水稻中环状RNA的全长第46-47页
        3.3.2 水稻中存在通过可变环化形成的环状RNA第47-49页
        3.3.3 水稻中存在非GT/AG剪接信号的环状RNA第49-50页
        3.3.4 水稻中可能存在通过融合方式形成的环状RNA第50-52页
    3.4 小结与讨论第52-55页
参考文献第55-59页
硕士期间发表的论文第59页

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