十种报春花属植物的叶绿体基因组研究
| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 第一章 前言 | 第11-20页 |
| 1.1 点地梅属和报春花属植物的研究 | 第11-14页 |
| 1.1.1 点地梅属植物的研究概况 | 第11页 |
| 1.1.2 报春花属植物的研究概况 | 第11-12页 |
| 1.1.3 报春花属植物的分类学和系统发育研究 | 第12-14页 |
| 1.2 植物叶绿体基因组 | 第14-15页 |
| 1.3 叶绿体基因组测序的主要方法 | 第15-16页 |
| 1.4 基于二代测序技术的叶绿体基因组测序 | 第16-17页 |
| 1.5 基于叶绿体基因组的系统发育研究 | 第17-18页 |
| 1.6 本研究的目的与意义 | 第18-20页 |
| 1.6.1 研究目的 | 第18-19页 |
| 1.6.2 研究意义 | 第19-20页 |
| 第二章 材料和方法 | 第20-27页 |
| 2.1 植物材料 | 第20页 |
| 2.2 叶绿体基因组序列的确定 | 第20-23页 |
| 2.2.1 基因组DNA的提取 | 第20-21页 |
| 2.2.2 DNA建库测序 | 第21页 |
| 2.2.3 叶绿体基因组组装 | 第21-22页 |
| 2.2.4 叶绿体基因组验证 | 第22-23页 |
| 2.2.5 叶绿体基因组注释 | 第23页 |
| 2.3 叶绿体基因组的相关分析 | 第23-27页 |
| 2.3.1 密码子使用分析 | 第23页 |
| 2.3.2 重复序列以及SSR分析 | 第23-24页 |
| 2.3.3 IR/SC的边界比较分析 | 第24页 |
| 2.3.4 序列分化分析 | 第24页 |
| 2.3.5 共线性分析 | 第24-25页 |
| 2.3.6 系统发育分析 | 第25-27页 |
| 第三章 研究结果 | 第27-50页 |
| 3.1 秦巴点地梅叶绿体基因组序列分析 | 第27-32页 |
| 3.1.1 基因组DNA高通量测序结果 | 第27页 |
| 3.1.2 叶绿体基因组组装以及注释 | 第27-28页 |
| 3.1.3 叶绿体基因组特征 | 第28-29页 |
| 3.1.4 密码子使用分析 | 第29-31页 |
| 3.1.5 重复序列以及SSR分析 | 第31-32页 |
| 3.2 十种报春花属植物的比较叶绿体基因组学分析 | 第32-45页 |
| 3.2.1 基因组DNA高通量测序结果 | 第32页 |
| 3.2.2 叶绿体基因组组装以及注释 | 第32-35页 |
| 3.2.3 叶绿体基因组特征 | 第35-37页 |
| 3.2.4 密码子使用分析 | 第37-38页 |
| 3.2.5 重复序列以及SSR分析 | 第38-41页 |
| 3.2.6 IR/SC边界比较分析 | 第41-42页 |
| 3.2.7 共线性分析 | 第42-43页 |
| 3.2.8 序列分化分析 | 第43-45页 |
| 3.3 十种报春花属植物的系统发育分析 | 第45-50页 |
| 3.3.1 报春花属系统发育位置的确定 | 第45-48页 |
| 3.3.2 属内系统发育关系 | 第48-50页 |
| 第四章 讨论 | 第50-55页 |
| 4.1 报春花属植物叶绿体基因组的进化 | 第50-53页 |
| 4.1.1 基因组成 | 第50页 |
| 4.1.2 IR/SC的边界比较 | 第50-51页 |
| 4.1.3 密码子使用 | 第51页 |
| 4.1.4 重复序列以及SSR | 第51-52页 |
| 4.1.5 序列分化 | 第52-53页 |
| 4.2 报春花属植物的系统发育关系 | 第53-55页 |
| 第五章 总结与展望 | 第55-57页 |
| 5.1 总结 | 第55-56页 |
| 5.2 展望 | 第56-57页 |
| 参考文献 | 第57-67页 |
| 附录 | 第67-74页 |
| 攻读硕士学位期间取得的学术成果 | 第74-75页 |
| 致谢 | 第75-76页 |
