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宿主细胞对小反刍兽疫病毒天然免疫应答机制的研究

摘要第5-6页
abstract第6-7页
第一章 引言第15-26页
    1.1 国内外研究进展第15-25页
        1.1.1 PPRV的分子病原学特点第15-20页
            1.1.1.1 PPRV的分布第15页
            1.1.1.2 PPRV感染的宿主范围第15-16页
            1.1.1.3 病毒的传播及扩散第16页
            1.1.1.4 病毒的分子生物学特征第16-19页
            1.1.1.5 疫苗第19-20页
        1.1.2 宿主对PPRV的天然免疫应答第20-21页
        1.1.3 干扰素的抗病毒作用第21-22页
        1.1.4 自噬相关蛋白在天然免疫中的作用第22-23页
        1.1.5 病毒唑(ribavirin)在抗病毒临床中的应用第23-24页
        1.1.6 宿主细胞黏着斑蛋白对病毒复制的影响第24-25页
    1.2 研究的目的与意义第25-26页
第二章 PPRV基因组遗传进化的特征第26-43页
    2.1 实验材料第26-29页
        2.1.1 PPRV基因组序列第26-27页
        2.1.2 宿主密码子数据第27-29页
    2.2 实验方法第29-31页
        2.2.1 PPRV基因核苷酸使用偏嗜性的分析第29页
        2.2.2 PPRV基因密码子使用偏嗜性的分析第29-30页
        2.2.3 PPRV与宿主密码子使用的相似性第30页
        2.2.4 PPRV核衣壳蛋白(N)二级结构的分析第30-31页
    2.3 实验结果第31-41页
        2.3.1 PPRV在基因水平上核苷酸使用模式第31-34页
        2.3.2 PPRV不同基因在密码子使用模式上与宿主的适应性第34-35页
        2.3.3 PPRV不同基因同义密码子使用的特点第35-38页
        2.3.4 PPRVN蛋白高级结构的分析第38页
        2.3.5 密码子使用对于PPRVN蛋白折叠构象的影响第38-39页
        2.3.6 翻译速率在两种不同折叠构象连接处的变化第39-41页
    2.4 讨论第41-43页
第三章 宿主细胞抗PPRV感染的天然免疫应答第43-61页
    3.1 实验耗材、试剂及其配制方法第43-46页
        3.1.1 细胞、病毒、质粒和引物第43页
        3.1.2 主要溶液的配置第43-46页
        3.1.3 实验设备第46页
    3.2 实验方法第46-51页
        3.2.1 PPRV在HEK293T细胞中的增殖第46页
        3.2.2 PPRV感染HEK293T细胞后激活IFN及ISG第46页
        3.2.3 外源IFN的抗病毒作用第46-47页
            3.2.3.1 IFNalpha2b的抗病毒作用第47页
            3.2.3.2 IFNλ3的抗病毒作用第47页
        3.2.4 Jakinhibitor抑制IFN通路第47-48页
            3.2.4.1 Jakinhibitor抑制内源性的IFN通路第47页
            3.2.4.2 Jakinhibitor抑制外源性的IFN通路第47-48页
        3.2.5 PPRV激活Atg13基因的转录第48页
        3.2.6 Atg13蛋白对PPRV复制的调控作用第48-49页
            3.2.6.1 过表达Atg13基因对PPRV复制的影响作用第48-49页
            3.2.6.2 敲低Atg13基因对I型IFN信号通路的影响作用第49页
        3.2.7 Atg13蛋白激活产生的IFN抑制PPRV的作用第49页
        3.2.8 荧光定量PCR第49-50页
        3.2.9 CCK8检测药物对细胞的毒性实验第50页
        3.2.10 统计学分析第50-51页
    3.3 实验结果第51-59页
        3.3.1 PPRV在HEK293T细胞中的增殖第51页
        3.3.2 PPRV感染HEK293T细胞后可激活产生IFN-β、IFN-λ3及相关ISG第51-52页
        3.3.3 外源IFN的抗病毒作用第52-54页
            3.3.3.1 IFN-alpha-2b在HEK293T细胞中的抗PPRV感染作用第52-54页
            3.3.3.2 IFN-λ3在HEK293T细胞中的抗PPRV感染作用第54页
        3.3.4 Jakinhibitor抑制IFN通路第54-55页
            3.3.4.1 Jakinhibitor抑制内源性的IFN通路第54-55页
            3.3.4.2 Jakinhibitor抑制外源性的IFN通路第55页
        3.3.5 细胞毒性实验第55-56页
        3.3.6 PPRV激活Atg13基因的转录第56-57页
        3.3.7 过表达Atg13基因对PPRV复制的影响作用第57页
        3.3.8 敲低Atg13基因对I型IFN信号通路的影响第57-58页
        3.3.9 Atg13蛋白激活产生的IFN对PPRV的抑制作用第58-59页
    3.4 讨论第59-61页
第四章 病毒唑和霉酚酸的抗PPRV作用第61-71页
    4.1 实验材料第61-62页
        4.1.1 细胞、病毒第61页
        4.1.2 实验耗材、试剂及其配制方法第61-62页
        4.1.3 实验设备第62页
    4.2 实验方法第62-64页
        4.2.1 药物毒性实验第62页
        4.2.2 Ribavirin抑制病毒增殖实验第62-64页
            4.2.2.1 Ribavirin抑制PPRV增殖的作用第62-63页
            4.2.2.2 Ribavirin抑制PPRV增殖作用的时间-效应关系第63页
            4.2.2.3 Ribavirin抑制PPRV增殖作用的剂量-效应关系第63页
            4.2.2.4 确定Ribavirin作用72h的最佳抗病毒作用浓度第63页
            4.2.2.5 Guanosine抑制ribavirin抗PPRV增殖作用第63-64页
        4.2.3 Mycophenolic抑制PPRV增殖作用第64页
            4.2.3.1 Mycophenolic抑制PPRV增殖作用第64页
            4.2.3.2 Guansine抑制Mycophenolic抗PPRV增殖作用第64页
        4.2.4 荧光定量PCR第64页
        4.2.5 统计学分析第64页
    4.3 结果第64-69页
        4.3.1 药物毒性实验第64-65页
        4.3.2 Ribavirin抑制PPRV增殖的作用及最佳作用浓度第65-66页
        4.3.3 Ribavirin抑制PPRV增殖的时间效应第66页
        4.3.4 确定Ribavirin对PPRV作用的最佳浓度第66-67页
        4.3.5 Ribavirin-Guanosine抑制病毒增殖实验第67页
        4.3.6 Mycophenolic抑制PPRV增殖作用第67-68页
        4.3.7 Guansine抑制Mycophenolic抗PPRV/Nigeria75/1增殖作用第68-69页
    4.4 讨论第69-71页
第五章 细胞内黏着斑蛋白对病毒复制的影响第71-80页
    5.1 实验材料第71-72页
        5.1.1 细胞、病毒及质粒第71页
        5.1.2 实验耗材、试剂及其配制方法第71-72页
        5.1.3 实验设备第72页
    5.2 实验方法第72-76页
        5.2.1 敲除质粒的构建第72-74页
        5.2.2 基因敲除细胞系构建第74页
        5.2.3 敲除细胞系的鉴定第74页
        5.2.4 细胞分选第74页
        5.2.5 Western-blot检测第74-75页
        5.2.6 单克隆细胞的PCR及测序鉴定第75页
        5.2.7 细胞迁移实验第75页
        5.2.8 PPRV在Vero细胞中的增殖实验第75页
        5.2.9 统计学分析第75-76页
    5.3 实验结果第76-78页
        5.3.1 vinculin敲除质粒的构建第76页
        5.3.2 基因敲除细胞系第76页
        5.3.3 敲除细胞系的PCR及测序鉴定第76页
        5.3.4 Western-blot检测第76-77页
        5.3.5 细胞迁移实验第77-78页
        5.3.6 PPRV在Vero细胞中的增殖实验第78页
    5.4 讨论第78-80页
第六章 全文结论第80-81页
参考文献第81-93页
致谢第93-94页
作者简历第94页

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