摘要 | 第7-10页 |
Abstract | 第10-12页 |
缩写名词表 | 第13-14页 |
1. 前言 | 第14-36页 |
1.1 玉米研究的重要性 | 第14-15页 |
1.2 郑58和昌7-2的特点 | 第15-16页 |
1.3 野生玉米材料的研究进展 | 第16-23页 |
1.3.1 野生玉米材料分类和特点 | 第16-18页 |
1.3.2 Parviglumis的特点的研究进展 | 第18-20页 |
1.3.3 Tripsacum的特征和研究进展 | 第20-23页 |
1.4 大片段克隆载体的研究进展 | 第23-27页 |
1.5 BAC文库的应用 | 第27-34页 |
1.5.1 基因的图位克隆 | 第27页 |
1.5.2 物理图谱的构建 | 第27-30页 |
1.5.3 全基因组测序 | 第30页 |
1.5.4 比较基因组学研究 | 第30-33页 |
1.5.5 BAC文库的新用途 | 第33-34页 |
1.6 本研究的目的和意义 | 第34-36页 |
2. 材料和方法 | 第36-48页 |
2.1 玉米材料 | 第36页 |
2.2 BAC载体 | 第36页 |
2.3 BAC载体的制备 | 第36-38页 |
2.4 玉米基因组DNA包埋块的制备 | 第38页 |
2.5 预先部分酶解 | 第38-39页 |
2.6 高分子量DNA片段的制备 | 第39-40页 |
2.7 BAC文库的构建 | 第40-41页 |
2.8 文库的质量检测 | 第41-47页 |
2.8.1 平均插入片段的检测 | 第41页 |
2.8.2 探针的制备 | 第41-43页 |
2.8.3 筛选两个野生玉米的BAC文库 | 第43-45页 |
2.8.4 BAC末端测序和FPC组装 | 第45-46页 |
2.8.5 BESs和克隆的定位 | 第46-47页 |
2.8.6 细胞器污染率的估算 | 第47页 |
2.9 文库的复制 | 第47-48页 |
3. 结果与分析 | 第48-76页 |
3.1 BAC载体的制备 | 第48-49页 |
3.2 预先部分酶解玉米基因组DNA | 第49-54页 |
3.3 高分子量DNA片段的制备 | 第54-59页 |
3.4 BAC文库的制备和质量检测 | 第59-65页 |
3.5 BAC文库的筛选 | 第65-70页 |
3.5.1 同位素标记探针筛选两个野生玉米文库 | 第65-66页 |
3.5.2 杂交结果的验证 | 第66-70页 |
3.6 BAC末端测序以及contig的拼装 | 第70-73页 |
3.7 利用BESs将部分BAC克隆锚定到玉米B73参考序列上 | 第73-76页 |
4. 讨论 | 第76-83页 |
4.1 BAC文库的构建 | 第76-77页 |
4.2 BAC文库基因组覆盖度的估计 | 第77-79页 |
4.3 对这些BAC文库资源的利用 | 第79-82页 |
4.4 本实验以外的BAC文库构建 | 第82-83页 |
参考文献 | 第83-95页 |
附录1 部分实验体系及步骤 | 第95-104页 |
附1.1 Plasmid DNA purification using QIAGEN plasmid Midi Kit | 第95-96页 |
附1.2 植物基因组DNA包埋块制备时需要的试剂 | 第96页 |
附1.3 BAC克隆质粒的手工小量提取 | 第96-97页 |
附1.4 制备基因探针PCR反应体系 | 第97-99页 |
附1.5 杂交膜的制备 | 第99-100页 |
附1.6 DIG High Prime DNA Labeling and Detection Starter Kit I(Roche) | 第100-102页 |
附1.7 96孔板提取BAC质粒 | 第102-104页 |
附录2 附表 | 第104-121页 |
附录3 简历 | 第121-123页 |
致谢 | 第123-124页 |