| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-9页 |
| 第一章 绪论 | 第13-24页 |
| 1 立题背景 | 第13-14页 |
| 2 国内外研究现状 | 第14-21页 |
| 2.1 土壤钾素概况 | 第14-15页 |
| 2.2 植物钾素营养及基因型差异 | 第15-17页 |
| 2.2.1 钾在植物中的作用及基因型差异 | 第15-16页 |
| 2.2.2 烟草钾素营养基因型差异 | 第16-17页 |
| 2.3 施钾量对烟草含钾量及品质等相关性状的影响 | 第17-19页 |
| 2.4 关联分析 | 第19-21页 |
| 2.4.1 关联分析的基本原理及方法 | 第19-20页 |
| 2.4.2 关联分析在烟草中的应用与进展 | 第20-21页 |
| 3 研究内容与技术路线 | 第21-24页 |
| 3.1 研究内容 | 第21-23页 |
| 3.1.1 不同施钾水平下烟草含钾量及相关性状差异 | 第21页 |
| 3.1.2 不同施钾水平下烟草含钾量的全基因组关联分析 | 第21-22页 |
| 3.1.3 不同施钾水平下烟草品质化学成分的全基因组关联分析 | 第22-23页 |
| 3.2 技术路线 | 第23-24页 |
| 第二章 不同施钾水平下烟草含钾量及相关性状差异 | 第24-36页 |
| 1 材料与方法 | 第24-29页 |
| 1.1 供试材料 | 第24-28页 |
| 1.2 试验设计与处理 | 第28页 |
| 1.3 样品采集与制备 | 第28页 |
| 1.4 测定项目及方法 | 第28-29页 |
| 1.5 数据处理 | 第29页 |
| 2 结果与分析 | 第29-33页 |
| 2.1 不同施钾水平下烟叶含钾量的基因型差异 | 第29-31页 |
| 2.1.1 烟叶含钾量的基因型差异 | 第29-31页 |
| 2.1.2 含钾量的方差分析 | 第31页 |
| 2.2 不同施钾水平下烟叶品质化学成分的基因型差异 | 第31-32页 |
| 2.3 烟叶含钾量与其他品质化学成分的相关性分析 | 第32-33页 |
| 3 讨论 | 第33-34页 |
| 3.1 含钾量及品质化学成分的基因型差异 | 第33-34页 |
| 3.2 施钾水平对含钾量及其他品质化学成分的影响 | 第34页 |
| 4 小结 | 第34-36页 |
| 第三章 不同施钾水平下烟草含钾量的全基因组关联分析 | 第36-53页 |
| 1 材料与方法 | 第36-38页 |
| 1.1 含钾量表型数据获取 | 第36页 |
| 1.2 测序流程 | 第36-37页 |
| 1.2.1 DNA的提取与检测 | 第36-37页 |
| 1.2.2 文库构建与库检 | 第37页 |
| 1.2.3 上机测序 | 第37页 |
| 1.3 测序数据质控 | 第37页 |
| 1.4 比对参考基因组 | 第37-38页 |
| 1.5 数据处理 | 第38页 |
| 1.5.1 表型数据 | 第38页 |
| 1.5.2 基因型数据 | 第38页 |
| 1.6 全基因组关联分析 | 第38页 |
| 2 结果与分析 | 第38-50页 |
| 2.1 SNP变异检测和注释 | 第38-41页 |
| 2.2 种质资源遗传多样性与遗传结构分析 | 第41-46页 |
| 2.2.1 烟草群体进化树分析 | 第42-43页 |
| 2.2.2 烟草群体主成分分析 | 第43-44页 |
| 2.2.3 烟草群体遗传结构 | 第44-46页 |
| 2.3 烟叶含钾量的关联分析 | 第46-50页 |
| 2.3.1 不同施钾水平下含钾量表型变异统计分析 | 第46-47页 |
| 2.3.2 烟叶含钾量的全基因组关联分析 | 第47-48页 |
| 2.3.3 目标性状关联基因功能注释 | 第48-50页 |
| 3 讨论 | 第50-51页 |
| 3.1 群体遗传结构与烟草种质资源利用 | 第50页 |
| 3.2 遗传结构对含钾量关联分析的影响 | 第50-51页 |
| 4 小结 | 第51-53页 |
| 第四章 不同施钾水平下烟草品质化学成分的全基因组关联分析 | 第53-70页 |
| 1 材料与方法 | 第53-54页 |
| 1.1 数据获取 | 第53-54页 |
| 1.1.1 表型数据获取 | 第54页 |
| 1.1.2 基因型数据获取 | 第54页 |
| 1.2 数据处理 | 第54页 |
| 1.2.1 表型数据 | 第54页 |
| 1.2.2 基因型数据 | 第54页 |
| 1.3 不同施钾水平下品质化学成分的全基因组关联分析 | 第54页 |
| 2 结果与分析 | 第54-67页 |
| 2.1 施钾水平对烟叶品质化学成分的影响分析 | 第54-55页 |
| 2.2 不同施钾水平下烟叶品质化学成分表型变异统计分析 | 第55-60页 |
| 2.3 不同施钾水平下烟叶品质化学成分全基因组关联分析 | 第60-64页 |
| 2.4 候选基因功能注释 | 第64-67页 |
| 3 讨论 | 第67-69页 |
| 3.1 基于SNP的关联分析在烟草中的应用 | 第67-68页 |
| 3.2 关联候选基因的功能推测 | 第68-69页 |
| 4 小结 | 第69-70页 |
| 第五章 全文主要结论和研究展望 | 第70-72页 |
| 1 全文主要结论 | 第70-71页 |
| 2 研究展望 | 第71-72页 |
| 参考文献 | 第72-80页 |
| 致谢 | 第80-82页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第82页 |
