| 摘要 | 第5-8页 |
| Abstract | 第8-12页 |
| 第一章 绪论 | 第18-28页 |
| 1.1 有孔虫简介 | 第18页 |
| 1.2 本论文研究背景 | 第18-23页 |
| 1.2.1 有孔虫多样性调查的困境 | 第18-19页 |
| 1.2.2 分子生物学在有孔虫研究中的应用 | 第19-21页 |
| 1.2.3 DNA条形码技术 | 第21-22页 |
| 1.2.4 高通量测序技术对有孔虫分子多样性评估的作用 | 第22-23页 |
| 1.3 研究区域概况 | 第23-26页 |
| 1.3.1 青岛湾潮间带 | 第23页 |
| 1.3.2 胶州湾 | 第23-24页 |
| 1.3.3 黄海 | 第24-25页 |
| 1.3.4 热带西太平洋海山区 | 第25-26页 |
| 1.4 国内外高通量测序技术在有孔虫类群中的研究现状 | 第26-27页 |
| 1.5 研究目的 | 第27-28页 |
| 第二章 材料与方法 | 第28-40页 |
| 2.1 试剂准备 | 第28页 |
| 2.2 仪器准备 | 第28页 |
| 2.3 方法学研究 | 第28-30页 |
| 2.3.1 活体有孔虫采集 | 第28-29页 |
| 2.3.2 染色处理 | 第29页 |
| 2.3.3 DNA检测 | 第29-30页 |
| 2.4 分子多样性及其环境特征研究 | 第30-40页 |
| 2.4.1 沉积物样品采集及处理 | 第30-35页 |
| 2.4.2 环境因子测定 | 第35页 |
| 2.4.3 环境样品总DNA提取 | 第35页 |
| 2.4.4 PCR扩增 | 第35-36页 |
| 2.4.5 文库构建及上机测序 | 第36页 |
| 2.4.6 测序数据预处理及质控 | 第36-37页 |
| 2.4.7 OTU聚类分析及物种注释 | 第37-38页 |
| 2.4.8 样品复杂度分析(AlphaDiversity) | 第38页 |
| 2.4.9 多样品比较分析(BetaDiversity) | 第38-39页 |
| 2.4.10 环境因子关联分析 | 第39-40页 |
| 第三章 结果 | 第40-132页 |
| 3.1 方法学研究 | 第40-41页 |
| 3.2 青岛湾潮间带底栖有孔虫分子多样性月变动及与环境关系 | 第41-54页 |
| 3.2.1 四种环境因子的月变动 | 第41-42页 |
| 3.2.2 有孔虫分子多样性及月变动 | 第42-43页 |
| 3.2.3 青岛湾底栖有孔虫群落构成 | 第43-47页 |
| 3.2.4 Alpha多样性分析 | 第47-51页 |
| 3.2.5 样品聚类分析 | 第51-52页 |
| 3.2.6 环境因子关联分析 | 第52-54页 |
| 3.3 胶州湾浅海陆架底栖有孔虫分子多样性季节变动及与环境关系 | 第54-76页 |
| 3.3.1 环境因子测定 | 第54-56页 |
| 3.3.2 有孔虫分子多样性及季节变动 | 第56-57页 |
| 3.3.3 胶州湾底栖有孔虫群落构成 | 第57-63页 |
| 3.3.4 Alpha多样性分析 | 第63-71页 |
| 3.3.5 Beta多样性分析 | 第71-74页 |
| 3.3.6 环境因子关联分析 | 第74-76页 |
| 3.4 黄海陆架区分子底栖有孔虫分子多样性受pH变动的影响 | 第76-117页 |
| 3.4.1 环境因子测定 | 第76-77页 |
| 3.4.2 有孔虫分子多样性 | 第77-83页 |
| 3.4.3 黄海底栖有孔虫群落构成 | 第83-101页 |
| 3.4.4 Alpha多样性分析 | 第101-114页 |
| 3.4.5 样品聚类分析 | 第114-117页 |
| 3.4.6 环境因子关联分析 | 第117页 |
| 3.5 热带西太平洋海山区底栖有孔虫分子多样性及与环境关系 | 第117-132页 |
| 3.5.1 环境因子测定 | 第117-118页 |
| 3.5.2 有孔虫分子多样性 | 第118-121页 |
| 3.5.3 海山区底栖有孔虫群落构成 | 第121-125页 |
| 3.5.4 Alpha多样性分析 | 第125-127页 |
| 3.5.5 Beta多样性分析 | 第127-129页 |
| 3.5.6 环境因子关联分析 | 第129-132页 |
| 第四章 讨论 | 第132-144页 |
| 4.1 方法学研究 | 第132-133页 |
| 4.2 潮间带底栖有孔虫分子多样性 | 第133-135页 |
| 4.3 浅海陆架底栖有孔虫分子多样性 | 第135-136页 |
| 4.4 黄海陆架区底栖有孔虫分子多样性对pH及培养时间的响应 | 第136-138页 |
| 4.5 热带西太平洋海山区底栖有孔虫分子多样性 | 第138-140页 |
| 4.6 DNA条形码 | 第140-144页 |
| 4.6.1 DNA条形码的应用 | 第140-141页 |
| 4.6.2 DNA条形码的准确性 | 第141-142页 |
| 4.6.3 条形码技术存在的问题 | 第142页 |
| 4.6.4 有孔虫条形码数据库 | 第142-144页 |
| 第五章 总结与展望 | 第144-148页 |
| 5.1 方法学研究部分 | 第144页 |
| 5.2 青岛湾潮间带底栖有孔虫分子多样性月变动及与环境关系 | 第144-145页 |
| 5.3 胶州湾浅海陆架底栖有孔虫分子多样性季节变动及与环境关系 | 第145页 |
| 5.4 黄海陆架区底栖有孔虫分子多样性受pH变动的影响 | 第145-146页 |
| 5.5 热带西太平洋海山区底栖有孔虫分子多样性及与环境关系 | 第146-147页 |
| 5.6 研究存在的问题 | 第147-148页 |
| 参考文献 | 第148-166页 |
| 致谢 | 第166-168页 |
| 作者简历及攻读学位期间发表的学术论文与研究成果 | 第168-169页 |
