| 摘要 | 第5-7页 |
| abstract | 第7-8页 |
| 1 绪论 | 第11-27页 |
| 1.1 引言 | 第11-12页 |
| 1.2 蛋白质基础理论知识 | 第12-20页 |
| 1.2.1 蛋白质的层次性结构 | 第12-16页 |
| 1.2.2 蛋白质结构类 | 第16-20页 |
| 1.3 蛋白质结构类预测概述 | 第20-24页 |
| 1.3.1 蛋白质结构类预测问题 | 第20页 |
| 1.3.2 蛋白质结构类预测国内外研究现状 | 第20-24页 |
| 1.4 本文的主要工作 | 第24-27页 |
| 2 材料和方法 | 第27-37页 |
| 2.1 数据集 | 第27-29页 |
| 2.2 分类算法 | 第29-31页 |
| 2.3 分类算法的性能评估 | 第31-34页 |
| 2.3.1 分类算法性能评估方法 | 第31-33页 |
| 2.3.2 分类算法的性能评估指标 | 第33-34页 |
| 2.4 本章小结 | 第34-37页 |
| 3 基于二级结构信息的蛋白质结构类预测方法 | 第37-63页 |
| 3.1 引言 | 第37页 |
| 3.2 基于二级结构信息的蛋白质特征表示方法 | 第37-48页 |
| 3.2.1 蛋白质二级结构预测 | 第37-39页 |
| 3.2.2 蛋白质特征表示 | 第39-46页 |
| 3.2.3 特征选择 | 第46-48页 |
| 3.3 蛋白质结构类预测分类算法设计 | 第48-50页 |
| 3.4 结果与讨论 | 第50-61页 |
| 3.4.1 本章蛋白质结构类预测方法的结果 | 第50-53页 |
| 3.4.2 特征分析 | 第53-55页 |
| 3.4.3 与现有其它方法比较 | 第55-57页 |
| 3.4.4 多种分类算法预测比较 | 第57-58页 |
| 3.4.5 罕见二级结构特征对蛋白质结构类预测性能的影响 | 第58-61页 |
| 3.5 本章小结 | 第61-63页 |
| 4 基于序列进化信息的蛋白质结构类预测方法 | 第63-89页 |
| 4.1 引言 | 第63-64页 |
| 4.2 基于序列进化信息的蛋白质序列特征表示方法 | 第64-69页 |
| 4.2.1 位置特异性打分矩阵 | 第64-66页 |
| 4.2.2 蛋白质序列特征表示 | 第66-69页 |
| 4.3 蛋白质结构类预测分类算法设计 | 第69-70页 |
| 4.4 结果与讨论 | 第70-78页 |
| 4.4.1 五种序列表示方法的比较 | 第70-74页 |
| 4.4.2 特征分析 | 第74-75页 |
| 4.4.3 与现有其它方法比较 | 第75-77页 |
| 4.4.4 多种分类算法预测比较 | 第77-78页 |
| 4.5 融合二级结构信息和进化信息预测蛋白质结构类 | 第78-86页 |
| 4.5.1 蛋白质序列特征表示 | 第78-81页 |
| 4.5.2 结果与讨论 | 第81-86页 |
| 4.6 本章小结 | 第86-89页 |
| 5 总结与展望 | 第89-93页 |
| 5.1 工作总结 | 第89-90页 |
| 5.2 研究展望 | 第90-93页 |
| 参考文献 | 第93-105页 |
| 附录 | 第105-113页 |
| 致谢 | 第113-115页 |
| 个人简历 | 第115-117页 |
| 攻读博士学位期间学术论文完成情况 | 第117页 |