摘要 | 第5-6页 |
abstract | 第6页 |
第1章 前言 | 第9-22页 |
1.1 差异共表达方法研究现状 | 第9-11页 |
1.2 胶质瘤研究现状 | 第11-18页 |
1.2.1 胶质瘤分子分级研究现状 | 第11-15页 |
1.2.2 胶质瘤分子标记物研究现状 | 第15-18页 |
1.2.2.1 IDH突变 | 第15-16页 |
1.2.2.2 MGMT启动子甲基化 | 第16-17页 |
1.2.2.3 ARTX突变和TERT改变 | 第17页 |
1.2.2.4 1p/19q缺失 | 第17-18页 |
1.3 疾病关系背景知识 | 第18-21页 |
1.3.1 疾病相关关系研究现状 | 第18-19页 |
1.3.2 常见的疾病数据库与其他数据库 | 第19-21页 |
1.4 本课题的目的及意义 | 第21-22页 |
第2章 整合差异共表达方法识别胶质瘤分类的三个转录因子 | 第22-32页 |
2.1 简介 | 第22页 |
2.2 数据来源和预处理 | 第22-24页 |
2.3 方法 | 第24-26页 |
2.3.1 差异共表达分析和差异调控分析 | 第24-25页 |
2.3.2 分类方法 | 第25页 |
2.3.3 生存分析 | 第25-26页 |
2.4 结果和讨论 | 第26-31页 |
2.4.1 88个种子基因的分类效能和临床相关性 | 第26-27页 |
2.4.2 差异调控分析相关的分子标签的识别和临床相关性 | 第27-29页 |
2.4.3 验证集中三个转录因子分类的预后价值的确认 | 第29-31页 |
2.5 本章小结 | 第31-32页 |
第3章 3-TF-signature功能研究 | 第32-38页 |
3.1 简介 | 第32页 |
3.2 数据 | 第32页 |
3.2.1 药靶数据 | 第32页 |
3.2.2 其他胶质瘤分子分级研究中的分子标签 | 第32页 |
3.3 方法 | 第32-33页 |
3.3.1 调控网络构建 | 第32-33页 |
3.4 结果与讨论 | 第33-36页 |
3.4.1 DRA-siganture在胶质瘤亚型中的表达情况 | 第33页 |
3.4.2 3-TF-signature与其他研究中分子标签功能比较 | 第33-35页 |
3.4.3 3-TF-signature调控网络分析 | 第35-36页 |
3.5 本章小结 | 第36-38页 |
第4章 疾病相关关系数据库 | 第38-48页 |
4.1 简介 | 第38-40页 |
4.2 数据库中数据的处理 | 第40页 |
4.2.1 基因表达数据 | 第40页 |
4.2.2 通路 | 第40页 |
4.2.3 疾病基因和药物 | 第40页 |
4.3 数据库内容 | 第40-41页 |
4.3.1 疾病相关关系 | 第40-41页 |
4.3.2 相似疾病对共同的属性 | 第41页 |
4.4 网页 | 第41-44页 |
4.5 查询 | 第44-47页 |
4.6 安装实现 | 第47页 |
4.7 本章小结 | 第47-48页 |
第5章 结论与展望 | 第48-50页 |
5.1 结论 | 第48页 |
5.2 展望 | 第48-50页 |
参考文献 | 第50-65页 |
致谢 | 第65-66页 |
附录 | 第66-118页 |
附录Ⅰ 附图 | 第66-74页 |
附录Ⅱ 附表 | 第74-118页 |
科研成果 | 第118页 |