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基于二代测序分析揭示肝癌起源与转移的新机制

中文摘要第4-8页
Abstract第8-12页
缩略语/符号说明第17-18页
前言第18-27页
    研究现状、成果第18-25页
    研究目的、方法第25-27页
一、肝癌细胞相关外泌体在肝癌发生和转移中的作用第27-67页
    1.1 对象和方法第27-47页
        1.1.1 肝癌细胞系、实验动物及肝癌患者临床样本第27-28页
        1.1.2 主要仪器和试剂耗材第28-32页
        1.1.3 主要溶液配制第32-34页
        1.1.4 主要引物序列第34-35页
        1.1.5 实验方法第35-47页
    1.2 结果第47-61页
        1.2.1 外泌体的分离和制备第47页
        1.2.2 Rab27a在肝细胞肝癌细胞系中的表达第47-48页
        1.2.3 肝癌临床样本中Rab27a的表达及其与临床预后的关系第48-50页
        1.2.4 内源性抑制Rab27a的表达对肝癌细胞MHCC97H迁移侵袭能力的调控作用第50-52页
        1.2.5 MHCC97H肝癌细胞外泌体对HLE肝癌细胞趋化侵袭能力的调控作用第52-54页
        1.2.6 肝癌细胞通过外泌体的摄取发生上皮间充质转化进而实现促侵袭效应第54-56页
        1.2.7 MHCC97H肝癌细胞外泌体可以调控AML-12 细胞的DNA损伤修复过程第56-57页
        1.2.8 Rab27a降表达促进MHCC97H肝癌细胞在小鼠体内发生肝内播散及肺转移第57-59页
        1.2.9 MHCC97H肝癌细胞外泌体促进小鼠肝脏原位肿瘤的术后复发第59-60页
        1.2.10 肝癌细胞外泌体可以直接诱导正常小鼠肝脏产生肿瘤第60-61页
    1.3 讨论第61-66页
        1.3.1 Rab27a调控肝癌exosomes的分泌第61-62页
        1.3.2 肝癌细胞相关exosomes可以促进肿瘤细胞发生EMT转化第62-63页
        1.3.3 肝癌细胞相关exosomes可以促进肿瘤细胞的侵袭转移能力第63-64页
        1.3.4 肝癌细胞相关exosomes可以调控正常肝细胞的DNA损伤修复第64-66页
    1.4 小结第66-67页
二、单细胞测序揭示肝癌的不同起源第67-95页
    2.1 对象和方法第68-81页
        2.1.1 实验动物第68页
        2.1.2 主要仪器和试剂耗材第68-69页
        2.1.3 主要溶液配制第69-70页
        2.1.4 主要引物序列第70-71页
        2.1.5 实验方法第71-81页
    2.2 结果第81-91页
        2.2.1 骨髓移植小鼠原位肝癌模型的建立第81-83页
        2.2.2 冰冻组织免疫荧光验证肝癌的骨髓起源第83-84页
        2.2.3 小鼠肝脏原位肿瘤单细胞分离第84-85页
        2.2.4 MALBAC单细胞扩增质检与全基因组文库质检第85-86页
        2.2.5 小鼠肝脏肿瘤单细胞基因拷贝数变化揭示小鼠肝癌的起源与进化过程第86-88页
        2.2.6 小鼠肝癌细胞基因拷贝数的变化模式具有异质性第88-89页
        2.2.7 小鼠单细胞CNAs揭示肝癌细胞的进化过程第89页
        2.2.8 基于单细胞CNAs绘制小鼠肝癌模型的Humming distance第89-90页
        2.2.9 去除骨髓间充质干细胞对小鼠肝癌发生发展的影响第90-91页
    2.3 讨论第91-94页
        2.3.1 BMSCs的多向分化能力第91页
        2.3.2 多重刺激因子诱发骨髓释放BMSCs参与肿瘤的发生与发展第91-92页
        2.3.3 BMSCs是多种实体肿瘤的最初起源第92-94页
    2.4 小结第94-95页
三、肝癌干细胞的基因拷贝数变异揭示肝癌的进化过程第95-114页
    3.1 对象和方法第95-99页
        3.1.1 实验动物及肝癌患者临床样本第95-96页
        3.1.2 主要仪器和试剂耗材第96页
        3.1.3 主要溶液配制第96页
        3.1.4 主要引物序列第96-97页
        3.1.5 实验方法第97-99页
    3.2 结果第99-107页
        3.2.1 应用干细胞标记物CD44和CD90对肝癌组织中的肿瘤细胞进行分群富集第99-100页
        3.2.2 肝癌组织中的CD44+CD90+细胞群具有体外成球能力第100-101页
        3.2.3 肝癌组织中的CD44+CD90+细胞群具有体外分化能力第101-102页
        3.2.4 CNAs揭示CD44+CD90+肿瘤干细胞在小肝癌发生发展过程中的作用第102-103页
        3.2.5 CNAs揭示CD44+CD90+肿瘤干细胞在肝癌复发过程中的作用第103-104页
        3.2.6 肿瘤单细胞CNAs揭示肝癌患者异质性第104-106页
        3.2.7 肝癌细胞CNAs的复杂程度可作为评估肿瘤恶性程度的潜在指标第106-107页
    3.3 讨论第107-113页
        3.3.1 肝癌干细胞标记物的选择第107-110页
        3.3.2 肝癌干细胞贯穿肝癌发生发展并造成了肝癌的异质性第110-112页
        3.3.3 肝癌患者的单细胞CNAs可作为预测其恶性程度的潜在指标第112-113页
    3.4 小结第113-114页
四、混合型肝癌的基因组学研究第114-130页
    4.1 对象和方法第114-118页
        4.1.1 临床样本第114-115页
        4.1.2 主要仪器和试剂耗材第115页
        4.1.3 实验方法第115-118页
    4.2 结果第118-126页
        4.2.1 cHCC-ICC患者的临床分类第118页
        4.2.2 不同类型cHCC-ICC肿瘤样本的研究方案第118-120页
        4.2.3 外显子测序结果揭示cHCC-ICC的高频突变基因第120-121页
        4.2.4 基于测序所得高频突变基因绘制信号通路富集图第121-122页
        4.2.5 通过对23例cHCC-ICC患者进行全基因组拷贝数变化分析第122-123页
        4.2.6 单细胞CNAs揭示cHCC-ICC的肿瘤内部异质性第123-124页
        4.2.7 单细胞PCR突变验证揭示cHCC-ICC肿瘤的单克隆起源第124-126页
    4.3 讨论第126-128页
        4.3.1 cHCC-ICC的研究背景第126-127页
        4.3.2 cHCC-ICC的流行病学特征第127页
        4.3.3 cHCC-ICC的遗传学和分子特征研究第127-128页
    4.4 小结第128-130页
全文结论第130-131页
论文创新点第131-133页
参考文献第133-154页
发表论文和参加科研情况说明第154-155页
综述 肿瘤干细胞与肿瘤微环境在恶性肿瘤发生发展中的作用第155-181页
    综述参考文献第168-181页
致谢第181-183页
个人简历第183页

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