| 致谢 | 第4-5页 |
| 中文摘要 | 第5-6页 |
| ABSTRACT | 第6页 |
| 第1章 引言 | 第10-22页 |
| 1.1 研究背景 | 第10-20页 |
| 1.1.1 肿瘤生物标志物 | 第10-12页 |
| 1.1.2 转录因子作为癌症治疗的新靶标 | 第12-15页 |
| 1.1.3 三阴性乳腺癌 | 第15-16页 |
| 1.1.4 精准医疗 | 第16-17页 |
| 1.1.5 RNA-Seq技术 | 第17-20页 |
| 1.2 研究目的及意义 | 第20-22页 |
| 1.2.1 研究的目的 | 第20页 |
| 1.2.2 研究的意义 | 第20-22页 |
| 第2章 材料及方法 | 第22-42页 |
| 2.1 实验材料 | 第22-27页 |
| 2.1.1 不同的细胞系 | 第22页 |
| 2.1.2 培养基及附加因子 | 第22页 |
| 2.1.3 质粒合成信息 | 第22-23页 |
| 2.1.4 基因敲除的siRNA序列 | 第23页 |
| 2.1.5 引物序列 | 第23-24页 |
| 2.1.6 生化试剂 | 第24-26页 |
| 2.1.7 实验耗材 | 第26页 |
| 2.1.8 仪器设备 | 第26-27页 |
| 2.2 实验方法 | 第27-42页 |
| 2.2.1 细胞的培养 | 第27-28页 |
| 2.2.2 细胞复苏、传代及保藏 | 第28-29页 |
| 2.2.3 慢病毒包装 | 第29页 |
| 2.2.4 细胞转染 | 第29-30页 |
| 2.2.5 质粒扩增及抽提 | 第30-31页 |
| 2.2.6 total RNA的抽提 | 第31页 |
| 2.2.7 RT-PCR | 第31-32页 |
| 2.2.8 荧光定量PCR | 第32-33页 |
| 2.2.9 琼脂糖凝胶电泳实验 | 第33页 |
| 2.2.10 SDS-PAGE凝胶电泳 | 第33-36页 |
| 2.2.11 Transwell实验 | 第36页 |
| 2.2.12 细胞增殖实验 | 第36-37页 |
| 2.2.13 Mammosphere实验 | 第37页 |
| 2.2.14 Softagar实验 | 第37-38页 |
| 2.2.15 Confocal实验 | 第38页 |
| 2.2.16 Co-IP实验 | 第38-39页 |
| 2.2.17 Chip-seq样品制备 | 第39-42页 |
| 第3章 实验结果 | 第42-62页 |
| 3.1 已有的工作基础 | 第42-43页 |
| 3.1.1 新型算法的开发 | 第42-43页 |
| 3.2 前列腺癌中验证算法的合理性 | 第43-46页 |
| 3.2.1 将新开发的SIMBA算法应用到前列腺癌的研究中 | 第43-44页 |
| 3.2.2 实验验证SIMBA算法在前列腺癌中的合理性应用 | 第44-46页 |
| 3.2.3 新型算法SIMBA在其他癌症中应用的展望 | 第46页 |
| 3.3 三阴性乳腺癌中挖掘联合生物靶标 | 第46-49页 |
| 3.4 关键转录因子EN1和FOXC1表达情况 | 第49-50页 |
| 3.5 EN1和FOXC1存在物理的相互作用 | 第50-51页 |
| 3.6 建立EN1和FOXC1敲除的细胞模型 | 第51-52页 |
| 3.7 实验验证敲除EN1和FOXC1后细胞生物学功能的变化 | 第52-54页 |
| 3.8 建立成功过表达EN1和FOXC1的细胞模型 | 第54-55页 |
| 3.9 实验验证EN1和FOXC1过表达的细胞发挥重要生物学功能 | 第55-58页 |
| 3.10 构建乳腺癌转移、预后模型 | 第58-59页 |
| 3.11 NFκB通路的激活 | 第59-60页 |
| 3.12 超级增强子与EN1和FOXC1的表达相关 | 第60-62页 |
| 第4章 结论与讨论 | 第62-64页 |
| 4.1 结论 | 第62-63页 |
| 4.2 讨论 | 第63-64页 |
| 参考文献 | 第64-73页 |
| 作者简历 | 第73页 |
