| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 第1章 前言 | 第10-12页 |
| 1.1 繁殖与呼吸综合征 | 第10页 |
| 1.2 同源模建与分子对接 | 第10-12页 |
| 第2章 PRRSV糖基化蛋白GP3与CD169同源模建及相互作用模拟 | 第12-26页 |
| 2.1 GP3蛋白和CD169蛋白 | 第12页 |
| 2.2 计算方法 | 第12-16页 |
| 2.2.1 蛋白的一级序列及晶体模型搜索 | 第13页 |
| 2.2.2 序列比对 | 第13-14页 |
| 2.2.3 同源模建 | 第14页 |
| 2.2.4 模型评估 | 第14页 |
| 2.2.5 模型优化 | 第14-15页 |
| 2.2.6 蛋白大分子对接 | 第15页 |
| 2.2.7 寻找活性位点 | 第15页 |
| 2.2.8 小分子对接及药物小分子筛选 | 第15-16页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第16-25页 |
| 2.3.1 序列比对 | 第16页 |
| 2.3.2 同源模建 | 第16-17页 |
| 2.3.3 模型优化 | 第17-18页 |
| 2.3.4 模型评估 | 第18-20页 |
| 2.3.5 蛋白大分子对接 | 第20-22页 |
| 2.3.6 寻找蛋白合体的活性位点及分析 | 第22-23页 |
| 2.3.7 小分子对接及药物小分子库筛选 | 第23-25页 |
| 2.4 结论 | 第25-26页 |
| 第3章 PRRSV糖基化蛋白GP2与CD163同源模建及相互作用模拟 | 第26-41页 |
| 3.1 GP2蛋白和CD163蛋白 | 第26-27页 |
| 3.2 实验方法 | 第27-31页 |
| 3.2.1 下载晶体模型 | 第27-28页 |
| 3.2.2 序列比对 | 第28页 |
| 3.2.3 同源模建 | 第28页 |
| 3.2.4 模型评估 | 第28-29页 |
| 3.2.5 模型优化 | 第29页 |
| 3.2.6 蛋白-蛋白对接 | 第29-30页 |
| 3.2.7 寻找活性位点 | 第30页 |
| 3.2.8 药物小分子筛选及对接 | 第30-31页 |
| 3.2.8.1 药物小分子筛选 | 第30-31页 |
| 3.2.8.2 小分子对接 | 第31页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第31-39页 |
| 3.3.1 下载晶体模型 | 第31页 |
| 3.3.2 序列比对 | 第31-32页 |
| 3.3.3 同源模建 | 第32-33页 |
| 3.3.4 模型评估 | 第33-35页 |
| 3.3.4.1 拉氏图法分析 | 第33-34页 |
| 3.3.4.2 Profiles-3D评估 | 第34-35页 |
| 3.3.5 蛋白-蛋白大分子对接 | 第35-37页 |
| 3.3.6 寻找蛋白合体的活性位点及小分子药物对接分析 | 第37-38页 |
| 3.3.7 小分子药物筛选 | 第38-39页 |
| 3.4 结论 | 第39-41页 |
| 参考文献 | 第41-44页 |
| 致谢 | 第44页 |
