摘要 | 第1-6页 |
ABSTRACT | 第6-8页 |
目录 | 第8-10页 |
第一章 绪论 | 第10-26页 |
·研究背景和意义 | 第10-13页 |
·国内外研究现状及分析 | 第13-20页 |
·数据集 | 第13-14页 |
·研究方法 | 第14-19页 |
·物理化学性质(Submito) | 第14-15页 |
·遗传算法(GP-Loc) | 第15-16页 |
·自协方差算法(AC) | 第16-18页 |
·小波分析(DWT) | 第18-19页 |
·结果对比分析 | 第19-20页 |
·线粒体概述 | 第20-24页 |
·外膜(outer membrane) | 第22-23页 |
·膜间隙(intermembrane space) | 第23页 |
·内膜(inner membrane) | 第23页 |
·嵴(cristae) | 第23-24页 |
·基质(matrix space) | 第24页 |
·论文研究内容及安排 | 第24-26页 |
第二章 特征提取及理论预测模型 | 第26-50页 |
·引言 | 第26-27页 |
·特征参数及提取方式 | 第27-42页 |
·氨基酸组分信息(Amino acid composition,AAC) | 第27-28页 |
·二肽组分信息(Dipeptide composition,DC) | 第28-29页 |
·约化的6种物理化学性质(Reduced physicochemical properties,H6) | 第29-30页 |
·Gene ontology(GO) | 第30-31页 |
·进化信息(PSSM) | 第31-33页 |
·化学位移(Chemical shift) | 第33-39页 |
·化学位移及其本质 | 第33页 |
·化学位移和蛋白二级结构关系 | 第33-34页 |
·化学位移数据集 | 第34页 |
·平均化学位移计算 | 第34-37页 |
·蛋白质的平均化学位移特征提取 | 第37-38页 |
·平均化学位移服务网站 | 第38-39页 |
·氨基酸黏性(protein stickiness) | 第39-42页 |
·氨基酸黏性的定义 | 第39-40页 |
·氨基酸黏性 | 第40-41页 |
·氨基酸黏性特征参数提取 | 第41-42页 |
·预测算法 | 第42-47页 |
·离散增量算法 | 第42-45页 |
·离散量 | 第42-43页 |
·离散增量 | 第43-44页 |
·离散增量算法 | 第44-45页 |
·SVM算法 | 第45-47页 |
·融合算法 | 第47页 |
·算法评价 | 第47-48页 |
·小结 | 第48-50页 |
第三章 蛋白质亚线粒体定位预测 | 第50-70页 |
·引言 | 第50-51页 |
·数据集 | 第51-59页 |
·数据集的建立 | 第51-52页 |
·数据集对比分析 | 第52-58页 |
·数据集网站 | 第58-59页 |
·最优特征筛选 | 第59-64页 |
·AAC | 第59-60页 |
·DC | 第60页 |
·H6 | 第60-61页 |
·GO | 第61-62页 |
·psePSSM | 第62-63页 |
·acACS | 第63-64页 |
·预测算法 | 第64-66页 |
·ID算法 | 第64页 |
·ID-SVM算法 | 第64-66页 |
·结果讨论 | 第66-69页 |
·预测结果对比分析 | 第66-68页 |
·结合氨基酸黏性的预测 | 第68-69页 |
·小结 | 第69-70页 |
第四章 讨论及其展望 | 第70-78页 |
·引言 | 第70-71页 |
·推广性检测 | 第71-75页 |
·数据集 | 第71-72页 |
·特征参数选取及算法 | 第72-73页 |
·预测结果 | 第73-74页 |
·结果对比分析 | 第74页 |
·结果讨论 | 第74-75页 |
·工作总结 | 第75-76页 |
·展望 | 第76-78页 |
参考文献 | 第78-90页 |
附录 | 第90-98页 |
致谢 | 第98-99页 |
攻读博士学位期间发表和完成的学术论文 | 第99页 |