| 摘要 | 第1-12页 |
| Abstract | 第12-14页 |
| 符号说明及缩写词 | 第14-16页 |
| 第一部分 文献综述 | 第16-43页 |
| ·粘细菌的社会学行为 | 第16-30页 |
| ·粘细菌的运动 | 第16-27页 |
| ·粘细菌的A运动系统 | 第18-19页 |
| ·粘细菌的S运动系统 | 第19-27页 |
| ·粘细菌的捕食行为 | 第27-28页 |
| ·粘细菌的子实体形态发生及孢子形成 | 第28-30页 |
| ·海洋耐盐粘细菌的研究 | 第30-34页 |
| ·海洋耐盐粘细菌的发现以及对海洋生境的适应机制 | 第30-31页 |
| ·水平转移基因在HW-1社会学行为的维系以及适应海洋生境中的作用 | 第31-34页 |
| ·TPR结构域在介导蛋白质互作中的功能机制 | 第34-39页 |
| ·TPR结构域的结构特征 | 第34-35页 |
| ·TPR单体结构域的结构特征 | 第34-35页 |
| ·TPR结构域的多体形式 | 第35页 |
| ·TPR结构域的功能 | 第35-37页 |
| ·TPR结构域在脚手架蛋白中的作用机制 | 第37-39页 |
| ·粘细菌基因组中存在的多拷贝基因 | 第39-42页 |
| ·本论文工作开展思路和研究内容 | 第42-43页 |
| 第二章 S.aurantiaca 17044中多拷贝pilA基因功能的研究 | 第43-74页 |
| ·材料 | 第44-48页 |
| ·菌株与质粒 | 第44-45页 |
| ·培养基 | 第45页 |
| ·试剂 | 第45-46页 |
| ·仪器设备与耗材 | 第46-48页 |
| ·实验方法 | 第48-60页 |
| ·生物信息学分析及相关软件 | 第48页 |
| ·包含S.aurantiaca 17044不同pilA基因回补载体的构建流程 | 第48-49页 |
| ·目的片段的PCR扩增及连接 | 第49-52页 |
| ·引物设计及合成 | 第49页 |
| ·融合PCR | 第49-51页 |
| ·片段与载体的连接、验证 | 第51-52页 |
| ·电转化以及阳性菌株的筛选 | 第52-54页 |
| ·电转化 | 第52-53页 |
| ·阳性菌株的系列稀释以及纯化 | 第53页 |
| ·粘球菌质粒的提取 | 第53-54页 |
| ·回补基因的表达分析 | 第54-58页 |
| ·反转录PCR(RT-PCR) | 第54-56页 |
| ·Western blot检测回补菌株TFP的存在 | 第56-58页 |
| ·回补菌株的性质分析 | 第58-60页 |
| ·菌株的胞外多糖(EPS)产生能力的分析 | 第58-59页 |
| ·菌株的群体运动(S motility)能力分析 | 第59页 |
| ·菌株的发育能力分析 | 第59页 |
| ·菌株识别能力的分析 | 第59-60页 |
| ·营养生长阶段的菌落扩展实验 | 第59-60页 |
| ·菌株的混合发育实验 | 第60页 |
| ·实验结果 | 第60-72页 |
| ·多拷贝pilA基因的获得以及pZJY41-pilA载体构建结果 | 第60-61页 |
| ·S.aurantiaca 17044中PilA蛋白序列分析结果 | 第61-62页 |
| ·S.acurantiaca 17044中各拷贝pilA基因的表达分析 | 第62-63页 |
| ·各回补菌株中pilA基因的表达分析 | 第63页 |
| ·菌株的社会学行为分析 | 第63-72页 |
| ·菌株的胞外多糖EPS产生能力分析 | 第63-64页 |
| ·菌株S运动能力分析 | 第64-65页 |
| ·菌株的发育能力分析 | 第65-66页 |
| ·菌株的相互识别能力分析 | 第66-72页 |
| ·菌株在营养生长阶段的菌落扩展情况 | 第66-68页 |
| ·菌株在发育阶段的识别能力 | 第68-72页 |
| ·本章小结 | 第72-74页 |
| 第三章 水平转移基因hdsp的功能机制研究 | 第74-104页 |
| ·材料 | 第74-76页 |
| ·菌株与质粒 | 第74-76页 |
| ·培养基 | 第76页 |
| ·试剂 | 第76页 |
| ·仪器设备与耗材 | 第76页 |
| ·实验方法 | 第76-85页 |
| ·hdsp基因以及编码的Hdsp蛋白的生物信息学分析 | 第76-77页 |
| ·相关载体的构建流程 | 第77-80页 |
| ·独立复制载体pZJY41-hdsp的构建 | 第77-78页 |
| ·位点特异性整合载体pSWU30-hdsp的构建 | 第78-80页 |
| ·表达载体pGEX-6P-1-truncated hdsp的构建 | 第80页 |
| ·目的片段的PCR扩增及连接 | 第80-81页 |
| ·引物设计及合成 | 第80-81页 |
| ·目的片段的PCR扩增、酶切以及回收 | 第81页 |
| ·片段与载体的连接、验证 | 第81页 |
| ·电转化以及阳性菌的筛选 | 第81页 |
| ·基因的存在以及表达分析 | 第81-82页 |
| ·菌落PCR | 第81-82页 |
| ·反转录PCR(RT-PCR) | 第82页 |
| ·菌株的社会学行为及生长情况分析 | 第82页 |
| ·菌株的胞外多糖(EPS)产生能力的分析 | 第82页 |
| ·菌株的群体运动(S motility)能力分析 | 第82页 |
| ·菌株的发育能力分析 | 第82页 |
| ·菌株的捕食能力分析 | 第82页 |
| ·菌株在液体培养条件下的生长情况分析 | 第82页 |
| ·目的基因在E.coli中的诱导表达 | 第82-83页 |
| ·利用亲和层析方法纯化蛋白 | 第83-84页 |
| ·利用离子交换层析方法纯化蛋白 | 第84页 |
| ·GST-pulldown实验状得与靶蛋白互作的蛋白分子 | 第84-85页 |
| ·质谱鉴定相互作用的蛋白 | 第85页 |
| ·GST-Hdsp融合蛋白中GST标签的去除 | 第85页 |
| ·实验结果 | 第85-102页 |
| ·hdsp基因以及编码的Hdsp蛋白的生物信息学分析 | 第85-87页 |
| ·相关载体的构建结果 | 第87-91页 |
| ·独立复制载体pZJY41-hdsp的构建结果 | 第87-89页 |
| ·位点特异性整合载体pSWU30-hdsp的构建结果 | 第89-91页 |
| ·异源表达载体pGEX-6P-1-hdsp的构建结果 | 第91页 |
| ·包含有hdsp基因转化菌株的社会学行为及生长情况分析 | 第91-96页 |
| ·菌株的EPS产生能力分析 | 第91-92页 |
| ·菌株的S运动能力分析 | 第92-93页 |
| ·菌株的发育能力分析 | 第93-94页 |
| ·菌株的捕食能力分析 | 第94-95页 |
| ·菌株的聚团生长能力 | 第95-96页 |
| ·截短Hdsp蛋白在E.coli中的表达及条件优化 | 第96-97页 |
| ·GST-Hdsp蛋白表达的检测 | 第96页 |
| ·GST-Hdsp蛋白表达条件的优化 | 第96-97页 |
| ·GST-Hdsp蛋白的纯化 | 第97-100页 |
| ·亲和层析纯化GST-Hdsp融合蛋白 | 第97-98页 |
| ·离子交换层析纯化GST-Hdsp融合蛋白 | 第98-99页 |
| ·GST-Hdsp融合蛋白中GST标签的去除 | 第99-100页 |
| ·与Hdsp蛋白相互作用蛋白的信息 | 第100-102页 |
| ·GST-pulldown实验获得的相互作用蛋白 | 第100页 |
| ·质谱鉴定蛋白样品以及候选蛋白的筛选 | 第100-102页 |
| ·本章小结 | 第102-104页 |
| 总结与展望 | 第104-106页 |
| 附录 | 第106-108页 |
| 参考文献 | 第108-118页 |
| 致谢 | 第118-119页 |
| 攻读学位期间发表的论文 | 第119-120页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第120页 |
