| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-11页 |
| 1 绪论 | 第11-17页 |
| ·生物序列研究的背景、理论意义及应用价值 | 第11-12页 |
| ·生物序列的图形表示研究概况 | 第12-13页 |
| ·本文的主要工作 | 第13-17页 |
| 2 拓扑指数的应用：生物序列的比较方法 | 第17-31页 |
| ·引言 | 第17-20页 |
| ·拓扑指数在生物序列相似性比较中的应用 | 第20-27页 |
| ·拓扑指数 | 第20-23页 |
| ·相似性比较 | 第23-27页 |
| ·DNA序列的特征数值 | 第27-30页 |
| ·DNA序列的图形表示 | 第27-28页 |
| ·矩阵不变量 | 第28-29页 |
| ·相似性分析 | 第29-30页 |
| ·小结 | 第30-31页 |
| 3 用随机游动描述DNA序列 | 第31-39页 |
| ·引言 | 第31-32页 |
| ·随机游动与DNA序列 | 第32-35页 |
| ·DNA序列的特征数值 | 第35-37页 |
| ·相似性分析 | 第37-38页 |
| ·小结 | 第38-39页 |
| 4 利用物种DNA序列的图形表示构建系统进化树的方法 | 第39-51页 |
| ·引言 | 第39-41页 |
| ·材料与方法 | 第41-48页 |
| ·材料 | 第41页 |
| ·方法1 | 第41-44页 |
| ·方法2 | 第44-48页 |
| ·进化树的构建 | 第48-50页 |
| ·小结 | 第50-51页 |
| 5 RNA二级结构的相似性分析 | 第51-61页 |
| ·引言 | 第51-53页 |
| ·用二维随机游动描述RNA二级结构序列 | 第53-57页 |
| ·RNA二级结构的6-D表示 | 第57-60页 |
| ·小结 | 第60-61页 |
| 6 RNA二级结构序列映射到“波谱线”和“Z型曲线”表示 | 第61-69页 |
| ·引言 | 第61-62页 |
| ·算法 | 第62-66页 |
| ·1-D表示 | 第63-65页 |
| ·2-D表示 | 第65页 |
| ·3-D表示 | 第65-66页 |
| ·RNA二级结构序列的频谱分析方法 | 第66-68页 |
| ·小结 | 第68-69页 |
| 7 蛋白质序列的图形表示及其应用 | 第69-85页 |
| ·引言 | 第69-70页 |
| ·基于核苷酸三联体密码子上蛋白质序列的2-D图形表示 | 第70-76页 |
| ·DNA序列的2-D表示 | 第70-72页 |
| ·DNA三联体的2-D表示 | 第72-74页 |
| ·蛋白质序列的2-D图形表示 | 第74-75页 |
| ·DNA三联体的数值刻划 | 第75-76页 |
| ·蛋白质序列的3-D表示 | 第76-84页 |
| ·蛋白质序列的3-D表示 | 第76-80页 |
| ·应用举例 | 第80-84页 |
| ·小结 | 第84-85页 |
| 8 附录：分子生物学知识概论 | 第85-91页 |
| ·核酸 | 第85-88页 |
| ·DNA | 第85-87页 |
| ·RNA | 第87-88页 |
| ·蛋白质 | 第88-89页 |
| ·分子遗传学机制 | 第89-91页 |
| ·基因和遗传密码 | 第89-90页 |
| ·中心法则：转录、翻译、和蛋白质的合成 | 第90-91页 |
| 参考文献 | 第91-97页 |
| 攻读博士学位期间发表学术论文情况 | 第97-98页 |
| 创新点摘要 | 第98-99页 |
| 致谢 | 第99-100页 |
| 大连理工大学学位论文版权使用授权书 | 第100页 |
