| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 插图索引 | 第10-12页 |
| 附表索引 | 第12-13页 |
| 第1章 绪论 | 第13-18页 |
| 1． 1 研究动机与意义 | 第13-14页 |
| 1． 2 研究目的 | 第14-15页 |
| 1． 3 研究内容 | 第15页 |
| 1． 4 本文主要工作 | 第15-16页 |
| 1． 5 本文组织结构 | 第16-18页 |
| 第2章 背景知识及研究现状 | 第18-23页 |
| 2． 1 生物信息处理中的数据挖掘 | 第18-20页 |
| 2． 1． 1 数据挖掘定义 | 第18-19页 |
| 2． 1． 2 应用及研究现状及进展 | 第19-20页 |
| 2． 2 生物信息处理中的聚类分析技术 | 第20-21页 |
| 2． 2． 1 基本概念 | 第20页 |
| 2． 2． 2 研究现状及进展 | 第20-21页 |
| 2． 3 DNA序列信息加密技术研究现状及进展 | 第21-22页 |
| 2． 4 本章小结 | 第22-23页 |
| 第3章 基因表达数据聚类分析算法研究 | 第23-45页 |
| 3． 1 基因表达数据 | 第23-24页 |
| 3． 2 聚类算法研究 | 第24-29页 |
| 3． 2． 1 K-均值聚类算法 | 第24-26页 |
| 3． 2． 2 层次聚类(Hierarchical Clustering) | 第26-27页 |
| 3． 2． 3 自组织图(Self-Organizing Maps) | 第27-28页 |
| 3． 2． 4 主成份分析PCA(Principal component analysis) | 第28-29页 |
| 3． 3 聚类算法的改进 | 第29-33页 |
| 3． 3． 1 一些基本概念 | 第29-32页 |
| 3． 3． 2 算法基本思想 | 第32页 |
| 3． 3． 3 算法描述 | 第32-33页 |
| 3． 4 基因表达数据聚类质量评价体系 | 第33-37页 |
| 3． 4． 1 FOM定义和计算 | 第33-34页 |
| 3． 4． 2 修正的质量因数Adhyst FOM | 第34-35页 |
| 3． 4． 3 Entropy_FOM定义与计算 | 第35-37页 |
| 3． 5 基因表达数据聚类分析模型设计与实现 | 第37-43页 |
| 3． 5． 1 模型设计 | 第37-38页 |
| 3． 5． 2 实验数据 | 第38-39页 |
| 3． 5． 3 测试结果分析 | 第39-41页 |
| 3． 5． 4 性能评价 | 第41-43页 |
| 3． 6 本章小结 | 第43-45页 |
| 第4章 基因序列数据聚类分析算法研究 | 第45-66页 |
| 4． 1 基因序列的概念 | 第45-46页 |
| 4． 2 数据库搜索序列比较 | 第46-48页 |
| 4． 2． 1 序列两两联配 | 第47-48页 |
| 4． 2． 2 多序列联配 | 第48页 |
| 4． 3 基因序列聚类算法研究 | 第48-50页 |
| 4． 3． 1 基因序列聚类算法概述 | 第48-49页 |
| 4． 3． 2 基于图BAG的聚类算法 | 第49-50页 |
| 4． 4 基于比对相似度动态矩阵SZDM的聚类算法 | 第50-54页 |
| 4． 4． 1 cutoff初始值的确定 | 第51-52页 |
| 4． 4． 2 回归精练类(Refine Cluster) | 第52页 |
| 4． 4． 3 最长公共子串阀值Threshold的确定 | 第52页 |
| 4． 4． 4 分割类(Split Clusters) | 第52-53页 |
| 4． 4． 5 合并类(Merge Clusters)或类中的序列 | 第53页 |
| 4． 4． 6 算法描述 | 第53-54页 |
| 4． 5 基因序列数据聚类质量评价体系 | 第54-57页 |
| 4． 5． 1 评价体系概述 | 第54页 |
| 4． 5． 2 评价指标 | 第54-57页 |
| 4． 6 基因序列聚类分析模型设计与实现 | 第57-65页 |
| 4． 6． 1 模型设计 | 第57-59页 |
| 4． 6． 2 模型数据来源 | 第59-61页 |
| 4． 6． 3 测试结果分析 | 第61-64页 |
| 4． 6． 4 性能评价 | 第64-65页 |
| 4． 7 小结 | 第65-66页 |
| 第5章 随机DNA序列加密与解密 | 第66-75页 |
| 5． 1 引言 | 第66-68页 |
| 5． 1． 1 信息加密技术概述 | 第66-67页 |
| 5． 1． 2 信息加密技术分类 | 第67-68页 |
| 5． 1． 3 现有算法分析 | 第68页 |
| 5． 2 DNA序列信息加密解密技术 | 第68-70页 |
| 5． 3 随机DNA序列信息加密解密模型实现及应用 | 第70-73页 |
| 5． 3． 1 基本思想 | 第70-71页 |
| 5． 3． 2 系统设计 | 第71-72页 |
| 5． 3． 3 数据准备 | 第72-73页 |
| 5． 4 实验结果分析 | 第73-74页 |
| 5． 5 小结 | 第74-75页 |
| 结束语 | 第75-76页 |
| 参考文献 | 第76-85页 |
| 致谢 | 第85页 |
| 附录 攻读硕士期间发表的论文及参加的科研项目 | 第85页 |
