| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-9页 |
| 目录 | 第9-11页 |
| 第一章 绪论 | 第11-35页 |
| ·文献综述 | 第11-16页 |
| ·研究方法 | 第16-26页 |
| ·本论文工作的思路 | 第26-27页 |
| 参考文献 | 第27-35页 |
| 第二章 基于HPPK的分子对接研究 | 第35-66页 |
| ·引言 | 第35-37页 |
| ·受体分子表面的表征 | 第37-50页 |
| ·金属Mg~(2+)对基于HPPK的分子对接的影响 | 第50-58页 |
| ·基于HPPK的MDL数据库对接 | 第58-64页 |
| 参考文献 | 第64-66页 |
| 第三章 HPPK在不同环境下的动力学行为 | 第66-79页 |
| ·概述 | 第66页 |
| ·研究体系及动力学模拟 | 第66-67页 |
| ·常规动力学轨迹分析 | 第67-73页 |
| ·重要动力学分析(Essential Dynamics analysis) | 第73-78页 |
| ·小结 | 第78页 |
| 参考文献 | 第78-79页 |
| 第四章 HPPK与底物复合物模型的建立 | 第79-107页 |
| ·HPPK酶与底物复合物的分子动力学模拟 | 第79-89页 |
| ·金属镁离子和水分子在复合物中的作用 | 第89-105页 |
| 参考文献 | 第105-107页 |
| 第五章 HPPK和突变体的动力学研究 | 第107-123页 |
| ·引言 | 第107页 |
| ·计算方法 | 第107-108页 |
| ·各突变体的动力学轨迹分析 | 第108-115页 |
| ·构象和相互作用分析 | 第115-118页 |
| ·磷转移机理的初步探讨 | 第118-120页 |
| ·小结 | 第120页 |
| 参考文献 | 第120-123页 |
| 第六章 定量结构-活性/性质关系 | 第123-155页 |
| ·引言 | 第123-124页 |
| ·结合三维静电势参数研究二取代苯的定量结构—疏水性关系 | 第124-132页 |
| ·溶剂软度的理论诠释及预测 | 第132-139页 |
| ·乙酰胆碱酯酶抑制剂的比较分子力场分析 | 第139-145页 |
| ·α_1-AR拮抗剂DDPH类似物的比较分子力场分析 | 第145-155页 |
| 第七章 总结与展望 | 第155-158页 |
| 附录 | 第158-160页 |
| 致谢 | 第160-161页 |
