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嗜热真菌热稳定纤维素酶的分子改造

中文摘要第1-13页
Abstract第13-16页
第一章 文献综述第16-51页
 1 纤维素酶的研究进展第16-34页
   ·纤维素的研究概况第16-18页
   ·纤维素酶研究进展第18-32页
   ·纤维素酶的应用第32-34页
 2 酶的分子改造第34-44页
   ·酶定向进化产生的背景第35页
   ·构建突变文库的方法第35-37页
   ·文库筛选的方法第37-40页
   ·基因融合技术第40页
   ·分子改造的应用第40-44页
 3 纤维素酶的分子改造第44-51页
   ·不同家族纤维素酶的定点突变第45页
   ·纤维素酶的定向进化第45-51页
第二章 嗜热真菌内切葡聚糖酶eg1 基因的克隆及在毕赤酵母中的表达第51-88页
 1. 材料和方法第51-72页
   ·材料第51-55页
     ·供试菌株第51-52页
     ·菌株与质粒第52页
     ·酶和生化试剂第52页
     ·仪器第52页
     ·溶液及培养基配制第52-55页
   ·试验方法第55-63页
     ·PCR 引物设计第55页
     ·总RNA 的提取(Trizol 法)第55-56页
     ·反转录cDNA 第一链的合成第56页
     ·eg1 基因的PCR 扩增第56-57页
     ·PCR 产物回收第57-59页
     ·与载体连接第59页
     ·E.coli 感受态细胞的制备和转化第59-60页
     ·重组质粒的筛选与鉴定第60-63页
     ·序列测定第63页
   ·序列的生物信息学分析第63页
   ·内切葡聚糖酶eg1 在毕赤酵母中的高效表达第63-72页
     ·酵母表达载体的构建第63-64页
     ·线性化酶切第64-65页
     ·酵母转化第65-66页
     ·酵母转化子的筛选第66-67页
     ·酵母转化子的PCR 鉴定第67-69页
     ·酵母工程菌的培养和内切葡聚糖酶eg1 的诱导分泌表达第69-70页
     ·表达产物的生物学活性检测及表达产物的SDS-PAGE第70-71页
     ·内切葡聚糖酶eg1 工程菌表达产物的纯化及酶学性质第71-72页
 2 实验结果第72-86页
   ·T.aurantiacus var.levisporus 总RNA 的提取第72页
   ·eg1 基因成熟蛋白编码序列的克隆第72-73页
   ·嗜热子囊菌光孢变种内切葡聚糖酶eg1 基因序列测定与分析第73-75页
   ·内切葡聚糖酶Ⅰ基因的核苷酸序列和氨基酸序列分析第75-76页
     ·内切葡聚糖酶Ⅰ基因eg1 的核苷酸序列分析第75页
     ·内切葡聚糖酶Ⅰ基因eg1 的氨基酸序列分析第75-76页
   ·内切葡聚糖eg1 在毕赤酵母中的表达第76-78页
   ·毕赤酵母的电击转化和重组菌株的鉴定第78-81页
     ·酵母转化子的甲醇利用表型的筛选第78-79页
     ·eg1 基因多拷贝整合子的筛选第79-80页
     ·酵母转化子的PCR 鉴定第80-81页
   ·内切葡聚糖酶eg1 基因在酵母中的高效表达及表达产物的检测第81-86页
     ·定内切葡聚糖酶eg1基因在P.pastoris中的诱导表达和高表达酵母菌株的筛选第81页
     ·内切葡聚糖酶eg1 基因酵母工程菌产酶SDS-PAGE第81页
     ·内切葡聚糖酶eg1 基因表达产物的分析第81-82页
     ·内切葡聚糖酶工程菌的遗传稳定性分析第82-83页
     ·表达内切葡聚糖酶的纯化及酶学性质研究第83-86页
 3 讨论第86-88页
第三章 嗜热真菌纤维素酶的分子改造第88-148页
 第一节 嗜热真菌内切葡聚糖酶 eg1 的定向进化第88-108页
  1 材料和方法第88-96页
   ·材料第88-89页
     ·供试菌株第89页
     ·菌株与质粒第89页
     ·酶和生化试剂第89页
   ·试验方法第89-91页
     ·PCR 引物设计第89页
     ·易错PCR第89-90页
     ·易错PCR 产物回收第90页
     ·易错PCR 产物双酶切第90页
     ·酶切产物纯化第90-91页
   ·表达载体pPIC9K 的酶切和纯化第91页
     ·表达载体pPIC9K 的酶切第91页
     ·pPIC9K 的酶切纯化第91页
   ·突变体库的构建第91-94页
     ·易错PCR 产物与载体的连接第91-92页
     ·重组质粒转化大肠杆菌JM109第92页
     ·重组质粒的提取第92页
     ·线性化质粒DNA 制备第92-94页
   ·酵母转化第94页
   ·突变体库的筛选方法第94-95页
     ·正向突变子的初步筛选第94页
     ·正向突变子的复筛第94页
     ·摇瓶发酵确定突变体第94-95页
   ·蛋白含量的测定第95页
   ·突变内切葡聚糖酶neg1 工程菌表达产物的纯化及酶学性质第95-96页
     ·突变内切葡聚糖酶neg1 工程菌表达产物的纯化第95-96页
     ·突变内切葡聚糖酶neg1 工程菌表达产物的酶学性质第96页
   ·突变基因序列测定第96页
  2 实验结果第96-105页
   ·易错PCR 突变库的建立和筛选结果第96页
   ·正向突变基因的筛选第96-98页
     ·双层平板初筛第97页
     ·小量液体发酵法复筛第97页
     ·酶活力测定第97页
     ·NT0542 酵母工程菌产酶SDS-PAGE第97-98页
   ·突变体NT0542 蛋白的纯化第98-100页
     ·DEAE-Sepharose 阴离子交换柱层析第98页
     ·Phenyl-Sepharose 疏水柱层析第98-100页
   ·突变体NT0542 的一般性质第100-103页
     ·突变体的最适温度第100-101页
     ·突变体的最适pH第101页
     ·表达突变内切葡聚糖酶的热稳定性第101-102页
     ·突变酶的底物特异性第102-103页
   ·突变体NT0542的序列测定第103-105页
  3 讨论第105-108页
   ·突变库的构建第105页
   ·筛选方法第105-106页
   ·突变内切葡聚糖酶的酶活提高的因素第106-107页
   ·纤维素酶的定向进化第107-108页
 第二节 嗜热子囊菌光孢变种eg1 基因和嗜热毛壳菌cbh1 基因的融合第108-124页
  1. 材料和方法第108-113页
   ·材料第108-109页
     ·供试菌株第108页
     ·菌株与质粒第108页
     ·酶和生化试剂第108-109页
     ·仪器第109页
     ·溶液及培养基配制第109页
   ·试验方法第109-111页
     ·PCR 引物设计第109-110页
     ·eg1cbh1 和cbh1eg1 融合基因的PCR 扩增第110-111页
     ·融合eg1cbh1 和cbh1eg1 全长PCR 产物回收第111页
   ·融合基因eg1cbh1 和cbh1eg1 在毕赤酵母中的高效表达第111-113页
  2 结果与分析第113-123页
   ·融合基因独立片段的获得第113-114页
     ·融合基因cbh1eg1 的独立片段的PCR 扩增第113页
     ·融合基因eg1cbh1 的独立片段的PCR 扩增第113-114页
   ·融合基因cbh1eg1 和eg1cbh1 全长的PCR 扩增第114-115页
   ·融合基因cbh1eg1 和eg1cbh1 在毕赤酵母中的表达第115-120页
     ·酵母表达载体的构建和鉴定第115-118页
     ·重组酵母表达质粒 pPIC9K/ec11 和 pPIC9K/ce11 转化 P.pastoris GS115 及酵母转化 子的筛选第118-120页
   ·融合酶 eg1cbh1 和 cbh1eg1 基因在 P.pastoris 中的表达产物的检测第120-123页
     ·融合酶eg1cbh1 酵母工程菌产酶产酶曲线分析及SDS-PAGE第120-121页
     ·融合酶基因eg1cbh1 表达产物的分析第121-122页
     ·融合酶 eg1cbh1 的底物特异性第122-123页
  3 讨论第123-124页
 第三节 嗜热毛壳菌cbh3 基因与纤维素结合区CBD 的基因融合第124-148页
  1. 材料和方法第124-134页
   ·材料第124-125页
   ·试验方法第125-132页
   ·融合基因cbh3-1 在毕赤酵母中的高效表达第132-134页
     ·酵母表达载体的构建第132-133页
     ·线性化质粒DNA 制备第133-134页
  2 结果与分析第134-146页
   ·融合基因独立片段的获得第134页
     ·融合基因cbh3-1A 的独立片段的PCR 扩增第134页
     ·融合基因cbh3-1B 的独立片段的PCR 扩增第134页
   ·融合基因cbh3-1 全长的PCR 扩增第134-137页
   ·融合基因cbh3-1A 和cbh3-1B 在毕赤酵母中的表达第137-142页
     ·酵母表达载体的构建和鉴定第137-139页
     ·重组酵母表达质粒 pPIC9K/cbh31A 和 pPIC9K/cbh31B 转化 P.pastoris GS115 及酵 母转化子的筛选第139-142页
   ·融合酶 cbh31 基因在 Pichia pastoris 中的高效表达及表达产物的检测第142-143页
     ·融合酶 cbh31 基因在 Pichia pastoris 中的诱导表达和高表达酵母菌株的筛选第142页
     ·融合酶cbh31B 酵母工程菌产酶SDS-PAGE第142页
     ·融合酶酵母工程菌的遗传稳定性分析第142-143页
   ·表达融合酶的纯化及酶学性质研究第143-146页
     ·表达融合酶的纯化第143-144页
     ·表达融合酶 cbh31 的最适反应温度第144页
     ·表达融合酶 cbh31 的最适反应 pH 值第144-145页
     ·表达融合酶 cbh31 的热稳定性第145-146页
     ·融合酶的底物特异性第146页
  3 讨论第146-148页
第四章 全文结论与建议第148-150页
 1 结论第148-149页
 2 建议第149-150页
参考文献第150-170页
致谢第170-171页
攻读学位期间发表论文的情况第171页

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