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半夏珠芽发育相关基因的分离研究

缩略词第6-8页
摘要第8-10页
Abstract第10-11页
第一章 文献综述第12-25页
    1.半夏繁殖生物学相关研究进展第12-14页
        1.1 半夏属植物种类及半夏第12页
        1.2 半夏的形态特征第12-13页
        1.3 半夏的繁殖方式第13-14页
            1.3.1 无性生殖第13-14页
            1.3.2 种子繁殖第14页
    2.珠芽发育研究进展第14-19页
        2.1 珠芽形态发育过程的观察第15页
        2.2 珠芽发育的解剖学研究第15-16页
            2.2.1 块茎型珠芽解剖学研究第15-16页
            2.2.2 鳞茎型珠芽的解剖学研究第16页
        2.3 珠芽的生理研究第16-18页
            2.3.1 植物激素对珠芽的影响第16-17页
            2.3.2 营养物质在珠芽形成中作用第17页
            2.3.3 矿质元素对珠芽的影响第17-18页
            2.3.4 环境条件对珠芽的影响第18页
        2.4 珠芽发育的分子机制第18-19页
    3.PEBP基因家族成员在植物发育中的作用第19-23页
        3.1 FT-like亚家族基因成员及其在植物发育中的作用第20-21页
        3.2 TFL1-like亚家族基因成员及其在植物发育中的作用第21-22页
        3.3 MFT-like亚家族基因成员及其在植物发育中的作用第22-23页
    4.研究目的和意义第23-24页
    5.技术路线第24-25页
第二章 差异基因的筛选第25-30页
    1.材料第25页
    2.方法第25-26页
        2.1 TotalRNA的提取和文库的构建第25页
        2.2 转录组测序数据的加工、组装和注释第25-26页
        2.3 表达谱测序数据的加工、组装和注释第26页
        2.4 差异基因筛选及分类第26页
    3.结果第26-29页
        3.1 转录组和表达谱测序结果第26-27页
        3.2 差异基因筛选结果第27页
        3.3 差异基因进行分类整理第27页
        3.4 PEBP家族成员筛选第27-29页
    4.讨论第29-30页
第三章 PEBP基因家族成员全长克隆第30-50页
    1.试验材料与方法第30-33页
        1.1 实验材料第30页
        1.2 实验主要试剂及耗材第30-31页
        1.3 试验主要仪器第31页
        1.4 培养基配制第31-32页
            1.4.1 氨苄青霉素溶液的配制第31页
            1.4.2 LB固体培养基的配制第31页
            1.4.3 LB液体培养基的配制第31-32页
        1.5 克隆全长的基因ID号及其引物第32-33页
    2.实验方法第33-41页
        2.1 半夏叶片TotalRNA提取及检测第33-34页
            2.1.1 准备事项第33页
            2.1.2 TotalRNA的提取第33-34页
            2.1.3 RNA质量检测第34页
        2.2 cDNA第一链的合成第34-35页
        2.3 目的基因3’RACE第35-37页
        2.4 目的片段的回收第37页
        2.5 目的片段与载体连接第37-39页
            2.5.1 转化大肠杆菌感受细胞第38页
            2.5.2 菌落鉴定第38-39页
            2.5.3 目标基因3’RACE序列处理第39页
        2.6 目标基因5’RACE反应第39-40页
        2.7 目的片段的回收纯化第40页
        2.8 目的片段与载体连接第40-41页
            2.8.1 转化大肠杆菌感受细胞第40页
            2.8.2 单克隆挑选及菌落PCR鉴定第40页
            2.8.3 目标基因5’RACR序列处理第40-41页
        2.9 PEBP亚家族成员克隆中的不同第41页
        2.10 PEBP亚家族基因全长的获得第41页
    3.结果与分析第41-47页
        3.1 半夏TotalRNA的提取及检测第41-42页
        3.2 PteFT基因全长克隆第42-43页
        3.3 PteMFT基因全长克隆第43页
        3.4 PteTFL1基因全长克隆第43-44页
        3.5 PEBP基因家族cDNA全长的获得第44-47页
            3.5.1 PteFTcDNA全长第44-45页
            3.5.2 PteMFTcDNA全长第45-46页
            3.5.3 PteTFL1cDNA全长第46-47页
    4.讨论第47-50页
第四章 PEBP基因家族生物信息学分析第50-78页
    1.材料第50-51页
        1.1 生物信息学分析工具第50页
        1.2 基因序列来源第50-51页
    2.方法第51-52页
        2.1 半夏PEBP家族成员编码蛋白质同源性及系统进化树分析第51页
        2.2 半夏PEBP家族成员编码蛋白质结构与功能分析第51-52页
            2.2.1 基因编码蛋白质理化性质分析第51页
            2.2.2 基因编码蛋白质信号肽分析第51页
            2.2.3 基因编码蛋白质跨膜区域分析第51页
            2.2.4 基因编码蛋白质空间结构分析和折叠类型预测第51-52页
    3.结果与分析第52-76页
        3.1 半夏PEBP家族成员编码蛋白质同源性及系统进化树分析第52-55页
            3.1.1 半夏PteFT基因编码蛋白质同源性及系统进化树分析第52-53页
            3.1.2 半夏PteMFT基因编码蛋白质同源性及系统进化树分析第53-54页
            3.1.3 半夏PteTFL1基因编码蛋白质同源性及系统进化树分析第54-55页
        3.2 半夏PEBP基因家族编码蛋白质结构与功能分析第55-76页
            3.2.1 PEBP基因编码蛋白质理化性质分析第55-58页
            3.2.2 PEBP家族成员编码蛋白质信号肽预测第58-63页
            3.2.3 PEBP家族成员编码蛋白质跨膜区域预测第63-67页
            3.2.4 PEBP家族成员编码蛋白质疏水性分析第67-71页
            3.2.5 PEBP家族成员编码蛋白质功能域分析第71-74页
            3.2.6 基因编码蛋白质二级结构预测第74页
            3.2.7 基因编码蛋白质三级结构预测第74-76页
    4.讨论第76-78页
第五章 半夏PEBP家族基因在珠芽不同发育时期表达分析第78-89页
    1.实验材料第78-79页
        1.1 组织材料第78页
        1.2 实验主要试剂及耗材第78页
        1.3 实验主要仪器第78页
        1.4 试验所用引物第78-79页
    2.实验方法第79-81页
        2.1 不同时期半夏珠芽的取样第79页
        2.2 不同时期半夏珠芽TotalRNA的提取第79页
        2.3 不同半夏组织cDNA的合成第79-80页
        2.4 不同时期荧光定量PCR反应第80-81页
        2.5 PEBP家族成员在珠芽不同发育时期相对表达量分析第81页
    3.结果与分析第81-86页
        3.1 不同时期半夏珠芽的筛选第81-82页
        3.2 不同时期半夏珠芽TotalRNA的提取及检测第82页
        3.3 引物特异性分析第82-84页
        3.4 PEBP家族基因的表达分析第84-86页
            3.4.1 PteMFT基因的表达分析第84-85页
            3.4.2 PteTFL1基因的表达分析第85-86页
            3.4.3 PteFT基因的表达分析第86页
    4.讨论第86-89页
结论第89-91页
参考文献第91-102页
附件1 差异表达基因注释信息第102-104页
附录第104-105页
致谢第105-106页

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