| 摘要 | 第7-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 第一章 烟草基因组学及抗青枯病遗传育种研究进展 | 第10-31页 |
| 1 前言 | 第10页 |
| 2 烟草基因组学的研究现状与发展趋势 | 第10-19页 |
| 2.1 烟草基因组图谱的构建 | 第11-12页 |
| 2.2 烟草的文库构建与EST测序 | 第12-13页 |
| 2.3 二代测序系统的应用 | 第13-15页 |
| 2.4 分子标记的开发与其在烟草上的应用 | 第15-17页 |
| 2.5 基因芯片技术在烟草上的研究应用 | 第17-19页 |
| 3 抗烟草青枯病及遗传育种研究 | 第19-22页 |
| 3.1 烟草青枯病 | 第19页 |
| 3.2 烟草青枯病的防治 | 第19-20页 |
| 3.3 抗烟草青枯病品种的选育 | 第20-21页 |
| 3.4 植物抗青枯病相关基因的研究 | 第21-22页 |
| 4 本研究的目的意义 | 第22-23页 |
| Reference | 第23-31页 |
| 第二章 454测序技术用于烟草抗耐环境胁迫转录组的分析 | 第31-61页 |
| 1 引言 | 第31-32页 |
| 2 材料与方法 | 第32-36页 |
| 2.1 植物材料 | 第32页 |
| 2.2 RNA提取 | 第32-33页 |
| 2.3 cDNA合成 | 第33页 |
| 2.4 半定量PCR | 第33-35页 |
| 2.5 454测序及组装 | 第35页 |
| 2.6 基因注释及生物信息学分析 | 第35-36页 |
| 3 结果与分析 | 第36-54页 |
| 3.1 454胁迫转录组测序与序列拼接结果 | 第36-40页 |
| 3.2 功能注释及特征分析 | 第40-42页 |
| 3.3 SSR和SNP的特征分析 | 第42-43页 |
| 3.4 差异表达基因分析 | 第43-45页 |
| 3.5 抗逆相关基因的筛选 | 第45-48页 |
| 3.6 差异基因与抗逆性基因的分离与鉴定 | 第48-54页 |
| 4 讨论 | 第54-57页 |
| 4.1 胁迫转录组分析有利于揭示烟草新基因 | 第54-55页 |
| 4.2 Unigene库功能注释分离了一批胁迫相关重要差异基因 | 第55页 |
| 4.3 胁迫转录组测序揭示了胁迫相关功能SSR标记 | 第55-56页 |
| 4.4 胁迫转录组分析可高效发掘抗逆差异相关基因 | 第56-57页 |
| 5 结论 | 第57-58页 |
| Reference | 第58-61页 |
| 第三章 烟草受青枯菌诱导表达谱分析与NtRLK2基因抗青枯病功能验证 | 第61-88页 |
| 1 引言 | 第61-62页 |
| 2 材料与方法 | 第62-67页 |
| 2.1 材料与试剂 | 第62-63页 |
| 2.2 实验方法 | 第63-67页 |
| 3 结果与分析 | 第67-81页 |
| 3.1 烟草基因芯片的设计 | 第67-68页 |
| 3.2 差异表达基因的初步生物信息学分析 | 第68-73页 |
| 3.3 转录因子的表达模式初步分析 | 第73-75页 |
| 3.4 类受体蛋白激酶(RLK)基因的表达模式 | 第75-76页 |
| 3.5 NtRLK2基因的功能初步验证 | 第76-81页 |
| 4 讨论 | 第81-84页 |
| 4.1 建立了烟草受青枯病胁迫的表达谱 | 第81页 |
| 4.2 青枯病胁迫引起大量基因差异表达 | 第81-82页 |
| 4.3 转录因子与类受体蛋白激酶参与烟草胁迫响应机制 | 第82页 |
| 4.4 NtRLK2基因可抗烟草青枯病 | 第82-84页 |
| Reference | 第84-88页 |
| 附件1 | 第88-94页 |
| 致谢 | 第94页 |
