| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 第一章 前言 | 第12-18页 |
| 1.1 肥胖的遗传学 | 第12-14页 |
| 1.1.1 肥胖概述 | 第12-13页 |
| 1.1.2 肥胖的遗传学研究 | 第13-14页 |
| 1.2 肥胖相关miRNA | 第14-16页 |
| 1.3 TSC22D3基因 | 第16页 |
| 1.4 本研究的目的 | 第16-18页 |
| 第二章 材料与方法 | 第18-34页 |
| 2.1 计算分析软件 | 第18页 |
| 2.2 肥胖GWAS lead SNP的计算分析 | 第18-22页 |
| 2.2.1 连锁proxy SNP的查找 | 第19页 |
| 2.2.2 SNP的保守性分析 | 第19-20页 |
| 2.2.3 肥胖lead SNP的远距离互作分析 | 第20页 |
| 2.2.4 肥胖lead SNP及其proxy SNP的功能注释 | 第20-21页 |
| 2.2.5 肥胖lead SNP和proxy SNP对miRNA结合的影响分析 | 第21页 |
| 2.2.6 lncRNA有关SNP的鉴定及其对lncRNA与miRNA互作的影响分析 | 第21-22页 |
| 2.2.7 肥胖lead SNP和proxy SNP对磷酸化的影响分析 | 第22页 |
| 2.3 肥胖GWAS关联基因的生物信息学分析 | 第22页 |
| 2.3.1 肥胖GWAS基因的搜集 | 第22页 |
| 2.3.2 肥胖GWAS基因蛋白互作网络分析 | 第22页 |
| 2.3.3 肥胖GWAS基因GO和信号通路富集分析 | 第22页 |
| 2.4 调控TSC22D3的miRNA预测分析 | 第22-23页 |
| 2.5 实验方法 | 第23-34页 |
| 2.5.1 实验设备 | 第23页 |
| 2.5.2 实验试剂、试剂盒和载体 | 第23-28页 |
| 2.5.3 DH5α大肠杆菌感受态细胞的制备 | 第28-29页 |
| 2.5.4 细胞培养 | 第29页 |
| 2.5.5 细胞基因组DNA的提取 | 第29页 |
| 2.5.6 3'UTR和miRNA重组载体的构建 | 第29-33页 |
| 2.5.7 细胞转染 | 第33页 |
| 2.5.8 双荧光素酶报告基因检测 | 第33-34页 |
| 第三章 结果与分析 | 第34-56页 |
| 3.1 肥胖GWAS lead SNP的计算分析 | 第34-41页 |
| 3.1.1 肥胖lead SNP及其proxy SNP的获得 | 第34页 |
| 3.1.2 肥胖lead SNP的保守性分析 | 第34-35页 |
| 3.1.3 肥胖lead SNP的远距离互作分析 | 第35-36页 |
| 3.1.4 肥胖lead SNP和proxy SNP的功能注释 | 第36-37页 |
| 3.1.5 肥胖lead SNP和proxy SNP对miRNA结合的影响分析 | 第37-39页 |
| 3.1.6 lncRNA有关SNP鉴定及其对lncRNA-miRNA互作的影响分析 | 第39-41页 |
| 3.1.7 肥胖lead SNP及其proxy SNP对蛋白磷酸化的影响分析 | 第41页 |
| 3.2 肥胖GWAS关联基因的生物信息学分析 | 第41-45页 |
| 3.2.1 肥胖GWAS基因的搜集 | 第41-42页 |
| 3.2.2 肥胖hub蛋白的鉴定 | 第42-43页 |
| 3.2.3 肥胖GWAS基因的信号通路富集分析 | 第43页 |
| 3.2.4 肥胖GWAS基因的GO分析 | 第43-45页 |
| 3.3 ZC3H4/rs3810291、ADCY9/rs879620和ASB4/rs6465468影响miRNA结合的实验验证 | 第45-51页 |
| 3.3.1 计算分析结果 | 第45页 |
| 3.3.2 ZC3H4/rs3810291影响miRNA结合的实验验证 | 第45-49页 |
| 3.3.3 ADCY9/rs879620影响miR-892a结合的实验验证 | 第49-50页 |
| 3.3.4 ASB4/rs6465468影响miR-101-5p结合的实验验证 | 第50-51页 |
| 3.4 调控TSC22D3的miRNA预测和实验验证 | 第51-56页 |
| 3.4.1 调控TSC22D3的miRNA预测结果 | 第51-52页 |
| 3.4.2 调控TSC22D3的miRNA实验验证 | 第52-56页 |
| 第四章 讨论 | 第56-58页 |
| 第五章 小结 | 第58-59页 |
| 参考文献 | 第59-68页 |
| 附录一 肥胖GWAS文献 | 第68-71页 |
| 附录二 肥胖GWAS lead SNP | 第71-87页 |
| 附录三 肥胖GWAS lead SNP和proxy SNP的功能注释 | 第87-128页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第128-129页 |
| 致谢 | 第129页 |
