| 摘要 | 第5-6页 |
| abstract | 第6-7页 |
| 一、前言 | 第10-15页 |
| 二、实验材料和研究方法 | 第15-20页 |
| 1 实验材料收集 | 第15-16页 |
| 2 组织学研究方法 | 第16页 |
| 3 转录组分析方法 | 第16-20页 |
| 3.1 实验方案设计 | 第16-17页 |
| 3.2 RNA的提取 | 第17页 |
| 3.3 cDNA文库的构建 | 第17-18页 |
| 3.4 聚类和测序 | 第18页 |
| 3.5 质量评估 | 第18页 |
| 3.6 Reads比对参考基因组 | 第18页 |
| 3.7 基因表达水平的量化 | 第18-19页 |
| 3.8 基因差异表达 | 第19页 |
| 3.9 差异表达基因的GO富集 | 第19页 |
| 3.10 差异表达基因的KEGG Pathway富集分析 | 第19-20页 |
| 三、结果 | 第20-48页 |
| 1 FPT和MPT6个发育时期性腺的形态变化过程分析 | 第20-21页 |
| 2 FPT和MPT6个发育时期性腺的表达谱分析 | 第21-48页 |
| 2.1 RNA样品提取质量的检测 | 第21-26页 |
| 2.2 测序数据质量评估与参考序列比对分析 | 第26-28页 |
| 2.3 基因表达水平分析 | 第28-30页 |
| 2.4 RNA-Seq相关性分析 | 第30-31页 |
| 2.5 差异表达分析 | 第31-37页 |
| 2.6 FPT相邻发育期间性腺差异表达基因的分析、GO富集及KEGG分析 | 第37-41页 |
| 2.7 MPT相邻发育期间性腺差异表达基因的分析、GO富集及KEGG分析 | 第41-44页 |
| 2.8 同一时期雌雄之间性腺差异表达基因的分析、GO富集及KEGG分析 | 第44-47页 |
| 2.9 筛选与扬子鳄性别决定和分化相关的基因 | 第47-48页 |
| 四、讨论 | 第48-53页 |
| 1 FPT和MPT6个发育时期性腺的形态变化过程 | 第48页 |
| 2 FPT和MPT6个发育时期性腺的表达谱 | 第48-53页 |
| 2.1 FPT相邻发育期间性腺的表达谱 | 第49页 |
| 2.2 MPT相邻发育期间性腺的表达谱 | 第49-50页 |
| 2.3 同一时期雌雄之间性腺的表达谱 | 第50-52页 |
| 2.4 与扬子鳄性别决定和分化相关的基因 | 第52-53页 |
| 五、结论与展望 | 第53-54页 |
| 1 主要结论 | 第53页 |
| 2 展望 | 第53-54页 |
| 参考文献 | 第54-61页 |
| 致谢 | 第61-62页 |
| 附：研究生期间发表论文及获奖情况 | 第62页 |
