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固氮施氏假单胞菌非编码RNA基因crcZ和crcY的转录特性及其RNA稳定性研究

摘要第6-7页
abstract第7-8页
英文缩略表第14-15页
第一章 引言第15-26页
    1.1 碳代谢抑制研究进展第15-19页
        1.1.1 枯草芽孢杆菌的碳代谢抑制第15页
        1.1.2 大肠杆菌的碳代谢抑制第15-16页
        1.1.3 假单胞菌的碳代谢抑制第16-17页
        1.1.4 CbrAB/Crc-Hfq/CrcZY系统调控模型第17-19页
    1.2 细菌RNA降解的作用机制第19-24页
        1.2.1 RNA降解保守的基本特征第19-20页
        1.2.2 RNA降解体(Degradosome)组分第20-24页
    1.3 立题依据和技术路线第24-26页
        1.3.1 立题依据第24-25页
        1.3.2 技术路线第25-26页
第二章 crcZ和crcY的生物信息学和转录特性分析第26-39页
    2.1 材料第26-27页
        2.1.1 菌株与质粒第26页
        2.1.2 培养基与试剂第26-27页
        2.1.3 主要仪器第27页
    2.2 方法第27-31页
        2.2.1 野生型A1501基因组的提取第27页
        2.2.2 质粒提取第27页
        2.2.3 PCR反应第27-28页
        2.2.4 重组载体的构建第28-29页
        2.2.5 三亲结合实验第29-30页
        2.2.6 菌体的培养与收集第30页
        2.2.7 β-半乳糖苷酶酶活测定第30-31页
        2.2.8 CrcZ和CrcY的生物信息学分析第31页
    2.3 结果第31-37页
        2.3.1 CrcZ和CrcY生物信息学分析第31-33页
        2.3.2 pGD-Pz和pGD-Py重组载体的构建第33-34页
        2.3.3 crcZ和crcY的转录特性第34-37页
        2.3.4 固氮生长条件下野生型中CrcZ和CrcY的绝对量第37页
    2.4 讨论第37-39页
第三章 Crc和Hfq蛋白影响CrcZ/Y胞内稳定性第39-46页
    3.1 材料第39页
        3.1.1 菌株第39页
        3.1.2 培养基与试剂第39页
        3.1.3 主要仪器第39页
    3.2 方法第39-41页
        3.2.1 固氮条件下RNA稳定性测定第39-40页
        3.2.2 苯甲酸唯一碳源条件下RNA稳定性测定第40页
        3.2.3 细菌总RNA的提取以及cDNA的合成第40-41页
        3.2.4 QuantitiveReal-timePCR第41页
    3.3 结果第41-44页
        3.3.1 野生型和Δcrc中crcZ和crcY的相对定量第41-42页
        3.3.2 野生型和Δcrc中cbrB和rpoN的相对定量第42页
        3.3.3 野生型和Δcrc中CrcZ和CrcY的稳定性测定第42-44页
        3.3.4 野生型和Δhfq中CrcZ/Y的稳定性测定第44页
    3.4 讨论第44-46页
第四章 CrcZ和CrcY降解模式的初步探究第46-60页
    4.1 材料第46页
        4.1.1 菌株与质粒第46页
        4.1.2 酶和试剂第46页
        4.1.3 仪器第46页
    4.2 方法第46-52页
        4.2.1 野生型A1501基因组的提取第46-47页
        4.2.2 质粒的提取第47页
        4.2.3 PCR反应第47页
        4.2.4 蛋白表达载体pTWcrc和pET-srne的构建第47-48页
        4.2.5 Crc蛋白的表达与纯化第48-49页
        4.2.6 截短RNaseE的表达与纯化第49-50页
        4.2.7 SDS-PAGE第50-51页
        4.2.8 CrcZ和CrcY全长的制备第51-52页
    4.3 结果第52-58页
        4.3.1 CrcZ和CrcY全长的制备第52-53页
        4.3.2 pTWcrc重组载体的构建第53-54页
        4.3.3 Crc蛋白的纯化第54-55页
        4.3.4 A1501中RNase的生物信息学分析第55-56页
        4.3.5 pETsrne重组载体的构建第56-57页
        4.3.6 截短RNaseE蛋白的纯化第57-58页
    4.4 讨论第58-60页
第五章 全文结论第60-63页
    5.1 结论与讨论第60-62页
    5.2 展望第62-63页
参考文献第63-71页
致谢第71-72页
作者简介第72页

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